Medische Microbiologie

Medical Microbiology

Studiewijzer 2021/2022

Globale inhoud

Colleges Bacteriologie:

• Inleiding Bacteriologie
• Microbiële diagnostiek
• Neisseria meningitidis, epidemiologie
• Vaccins
• Bloedbaan infecties, sepsis
• Endocarditis en innate defense
• Urineweg infecties
• SOA's en Zoönoses
• Darminfecties
• Luchtweginfecties

Practicum Bacteriologie:

• Resistentie tegen antimicrobiele middelen, overdracht van resistentie
• Antimicrobiële biomaterialen
• Analyse van bacteriele membraaneiwitten
• Buitenmembraaneiwitten, beschermende antistoffen en vaccinontwikkeling

Colleges Parasitologie:

• Malaria cyclus, epidemiologie, pathogenese en behandeling
• Malaria diagnostiek: microscopie, antigeentests en DNA detectie
• Darmparasieten: Protozoa
• Darmparasieten: Helminthen

Practicum Parasitologie:

• Malaria diagnostiek

Colleges Virologie:

• Inleiding Virologie
• Virus entry en exit
• Arbo virussen
• Hepatitis C virus (HCV)
• Human Immunodeficiency virus (HIV)
• Picornavirussen
• Morbillivirussen
• Rhabdovirussen
• Herpesvirussen
• Humaan Papillomavirus (HPV)
• Rota- en Norovirussen

Studiemateriaal

Syllabus

• Practicumhandleiding wordt door de cursusleiding verstrekt. Hiervoor wordt een geringe vergoeding gevraagd.

Practicummateriaal

• Laboratoriumjas en labjournaal dienen door de studenten zelf meegebracht te worden.

Leerdoelen

• De student kan de behandelde onderzoeksmethoden uitvoeren
• De student kan begrippen uit de medische microbiologie en epidemiologie toepassen
• De student kan zelfstandig informatie verzamelen uit studieboeken en wetenschappelijke literatuur.
• De student kan een schriftelijk overzicht opstellen over een specifiek virus in de vorm van een literatuurverslag aan de hand van een aantal aspecten van het virus.
• De student kan middels adequate software de phylogenetische relatie tussen een aantal virussen op basis van hun sequentie vaststellen.
• De student kan de volgende concepten herkennen en beschrijven, en er constructief over redeneren: verschillende soorten infectieziekten en bacteriën, virussen en parasieten, die deze ziekten veroorzaken, traditionele en moderne diagnostiek, mechanismen van pathogenese van microbiele infecties, interactie met de gastheer, afweermechanismen van de gastheer, immune evasion, de wijze van infectie en transmissie, en mogelijkheden tot preventie en behandeling.
• De student kan middels LabBuddy practica voorbereiden, uitvoeren en de resultaten evalueren

Onderwijsvormen

• Hoorcollege
• (Computer)practicum

Verplichte (werk)colleges, practicum, literatuurstudie en presentaties.
In de hoorcolleges wordt de leerstof behandeld welke wordt getoetst in het tentamen.Er is gelegenheid tot het stellen van vragen. Ieder practicumonderdeel wordt voorafgegaan door een verplicht inleidend voorcollege. De colleges en voorcolleges worden op Blackboard geplaatst. Aan de hand van deze inleiding en de practicumhandleiding worden de experimenten in groepjes of zelfstandig uitgevoerd, waarbij assistentie aanwezig is. De resultaten van de proeven worden genoteerd in het labjournaal (dat de studenten zelf mee dienen te brengen!). Het practicum wordt getoets met een öpen labjournaal tentamen" waarbij het labjournaal en de practicumhandleiding gebruikt mogen worden voor het beantwoorden van de vragen. Voor de opdrachten Virologie worden verslagen ingeleverd die worden beoordeeld. Het practicum Parasitologie wordt tijdens de uitvoering beoordeeld en dient voldoende te zijn.

Verdeling leeractiviteiten

Academische vaardigheden

Kennis/cognitie;  experimentele vaardigheden zoals steriel werken, bacteriën kweken, antibioticumresistentiebepaling, PCR, sequentie-analyse, eiwitgelelectrophorese en begrip van Western Blotting t.a.v. Bacteriologisch practicum, microscopie/herkenning parasieten bij practicum Parasitologie; schriftelijke verslaglegging: nauwkeurig bijhouden labjournaal zoals aangeleerd bij academische vaardigheden, wetenschappelijk literatuurverslag.

De leerdoelen staan geformuleerd onder 1. Leerdoelen

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.
  

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanwezigheid bij practicum voorcolleges en practica is verplicht, zie hierboven. De practica zijn een verdieping en uitbreiding van de hoorcolleges, waarbij de stof van de hoorcolleges bekend wordt verondersteld. Het volgen van de hoorcolleges is dus feitelijk essentieel.  

Toetsing

Opdrachten

Opdrachten practica

• Er wordt in de practica een aantal opdrachten bewerkt, en er wordt een labjournaal bijgehouden om over het tentamen een "open labjournaal" toets te kunnen maken. In deze toets worden vragen gesteld over het practicum, zowel over de resultaten als de interpretatie hiervan.
  In het onderdeel Virologie worden individuele computer- en schrijfopdrachten uitgevoerd.

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Aanvullende informatie

Verwerking feedback studenten

Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.

Het cursusjaar 2020-2021 was door COVID een uitzonderlijk jaar, waarbij alle cursusonderdelen online gegeven moesten worden, waaronder ook een nieuw ontwikkeld alternatief voor het practicum in de vorm van een LabBuddy practicum. Een aantal punten uit de evaluatie is derhalve specifiek voor deze situatie. Hieronder volgt een samenvatting van de reactie van de coordinator op de kommentaren uit de evaluatie.

• De schrijfopdracht Virologie is niet geheel goed verlopen doordat de instructie op CANVAS om één of andere reden pas laat toegankelijk was. Er zal volgend jaar live of online voor gezorgd worden dat de instructie en toegankelijkheid van de opdracht weer in orde is.
• Een punt van aandacht is ook de feedback op deze opdracht. Dit is lastig omdat de opdracht nog niet nagekeken is wanneer de cursus eindigt. Studenten zullen meer expliciet op de mogelijkheid gewezen worden individueel kontakt op te kunnen nemen met de begeleider voor feedback “achteraf”.
• Dit was een uitzondelijk jaar. Het heeft de noodzaak c.q. mogelijkheid gegeven om een digitaal practicum middels LabBuddy te ontwikkelen dat door de studenten zeer gewaardeerd werd, hoewel een echt practicum duidelijk de voorkeur blijft verdienen. Volgend jaar zullen de 2 LabBuddy practica worden ingebouwd in het reeds bestaande wetlab deel van het Bacteriologie practicum. De combinatie is zeker een verrijking.
• Verbeterpunt voor de onderwijsondersteuning is de betrouwbaarheid van TestVision; dit viel uit tijdens het tentamen, met nogal wat vervelende gevolgen voor studenten en docenten.

Contactinformatie

Coördinator

• dr. S.A.J. Zaat

s.a.zaat@amc.uva.nl