Data Collection and Analysis
6 EC
Semester 1, periode 1, 2
5042DAVA6Y
| Eigenaar | Bachelor Biologie |
| Coördinator | drs. Peter Assink |
| Onderdeel van | Bachelor Biologie, jaar 1Pre-master Biological Sciences, jaar 1 |
Data Verzamelen en Analyseren is een zestienweekse cursus die plaatsvindt gedurende de eerste vier maanden (sep-dec) van het eerste studiejaar. In de cursus (1) wordt aandacht besteed aan op welke wijze je onderzoeksgegevens moet verzamelen om ze zinvol te kunnen analyseren, en (2) worden enige eenvoudige analysetechnieken besproken en geoefend, zowel met pen en papier als met een statistiekprogramma. Veel van deze analysetechnieken worden in latere cursussen van de bachelor regelmatig toegepast.
In onderstaand overzicht staan de onderwerpen met hun Engelse term aangegeven (o.a. vanwege het Engelstalige cursusboek), maar de cursus wordt in het Nederlands gegeven.
Periode 1
Periode 2
The Analysis of Biological Data. Whitlock and Schluter, 3rd edition, 2019. ISBN: 9 781319 325343
LET OP: dit mag NIET de 2nd of 1st edition zijn!
Handleiding R (3 delen). Komt digitaal beschikbaar tijdens de cursus
Laptop met als besturingssysteem Windows (7, 8, 8.1 of 10) of macOS 10.x, 11.x of 12.x.
LET OP: Draag zorg voor een laptop met voldoende rekenkracht. Zorg verder dat je voldoende bekend bent met je besturingssysteem om je laptop onder normale omstandigheden te kunnen bedienen.
Voor Windows machines: (bij voorkeur de Engelstalige) Excel uit Microsoft Office 2019, 2016 of 365.
Voor Mac's: (bij voorkeur de Engelstalige) Excel uit Microsoft Office 2019, 2016 of 365. LET OP: eerdere en/of Nederlandstalige versies van Excel zijn toegestaan maar Excel wordt uitgelegd a.h.v. Engelstalige tutorials. Zorg dat de Excel-applicatie op je laptop staat voordat de cursus begint.
CRANE R 4.1.1 of een recentere release (bij oudere besturingssystemen kan het zijn dat je een oudere release moet gebruiken). Je hoeft deze applicatie niet thuis al te downloaden: we doen dat gezamenlijk tijdens de cursus.
RStudio 1.4.1717 of recentere release (bij oudere besturingssystemen kan het zijn dat je een oudere release moet gebruiken). Je hoeft deze applicatie niet thuis al te downloaden: we doen dat gezamenlijk tijdens de cursus.
Tijdens de hoorcolleges bespreekt de docent de stof uit het boek, vaak vanuit een wat andere invalshoek en met andere voorbeelden. Tijdens de werkcolleges oefenen studenten om de behandelde stof toe te passen a.h.v. opgaven uit het boek en oude tentamenopgaven. Tijdens de laptopcolleges leren studenten werken met R vanuit RStudio. Dit doen ze op hun eigen laptop.
|
Activiteit |
Uren |
|
|
Hoorcollege |
26 |
|
|
Laptopcollege |
24 |
|
|
Theorietoets |
3 |
|
|
Werkcollege |
24 |
|
|
Zelfstudie |
89 |
|
|
Practicumtoets |
2 |
|
|
Totaal |
168 |
(6 EC x 28 uur) |
Merk op dat er 89 uur zelfstudie deel uitmaakt van de cursus. Dat is ongeveer de helft van de studielast.
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Absentie bij een werkcollege of laptopcollege dient ALTIJD vooraf te worden gemeld, met reden.
In zeldzame gevallen waarin vooraf melden niet mogelijk of niet reëel is, dien je je absentie in elk geval z.s.m. te melden.
Melden doe je mondeling of via het cursus-emailaccount.
Indien meedoen met de andere groep mogelijk is, dan heeft dat de voorkeur (dat moet wel de goedkeuring hebben van de cursusleiding). In dat geval geld je niet als absent.
Vanwege de naweeën van de corona pandemie geldt voorlopig nog het volgende: als je gezondheidsklachten hebt die zouden kunnen wijzen op corona, dan adviseren we je om je absent te melden. Een dergelijke absentie heeft geen consequenties (leidt niet tot extra werk) zoals hieronder staat vemeldt staat. Hij telt als het ware niet mee. NB. Misbruik maken van deze makkelijke manier om absent te zijn, is geen goed idee. Te vaak afwezig zijn zal zeer waarschijnlijk je je toetsresultaten negatief beïnvloeden omdat je geen gebruik hebt kunnen maken van begeleiding in deze toch niet als makkelijk bekend staande cursus.
Iedere student mag 2 keer absent zijn tijdens de cursus zonder consequenties, mits deze absenties zijn gemeld.
Vanaf de 3e keer (of bij niet melden) geldt:
Bij een werkcollege: je moet, om een punt te krijgen voor je ingeleverde huiswerk, nu ook de antwoorden op de werkcollege-opgaven inleveren. Doe je dat niet, dan krijg je geen punt (met consequenties voor je eindcijfer).
Bij een laptopcollege uit de tweede helft van de cursus: je moet bepaalde, door de cursusleiding aan te geven, opgaven maken en de antwoorden inleveren. Doe je dat niet, dan zal de cursuscoördinator besluiten wat daarvoor de sanctie is.
Voor studenten met problemen thuis, gezondheidsproblemen e.d. kunnen mildere regels gelden.
Alleen de studieadviseur kan bepalen of je tot deze categorie behoort, niet jijzelf.
De absentieregeling staat in detail beschreven op Canvas op de pagina's "Wat te doen bij absentie?" en "Beoordeling".
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer |
Het eindcijfer van de cursus wordt berekend uit 4 deelcijfers, met de volgende gewichten:
theorietoets 76%
computervaardighedentoets(1) 9%
computervaardighedentoets(2) 9%
inleveren huiswerk 6%
Hiervan kunnen de eerste 3 herkanst worden. En te laag resultaat voor een computervaardighedentoets kan leiden tot een NAV ('niet aan voldaan'). Deze moet eerst (in een herkansing) worden weggewerkt alvorens het eindcijfer wordt vrijgegeven.
Daarnaast worden er Excelvaardigheden getoetst, middels een zelf te downloaden toets die net zo vaak gemaakt kan worden tot er een voldoende is behaald. Het resultaat van deze toets draagt niet bij aan het eindcijfer van de cursus maar zolang er geen voldoende is behaald, wordt het eindcijfer niet vrijgegeven.
De antwoorden op de toetsvragen komen daags na het tentamen op Canvas.
Het bespreken van de toetsen is geen ingeroosterd onderdeel, maar kan desgewenst individueel plaatsvinden voor wie dat wil. Benader daarvoor de coördinator.
De Excelvaardighedentoets moet gemaakt worden om de cursus te kunnen afronden. Deze toets kunnen studenten zelf downloaden van Canvas en maken wanneer het hen uitkomt, ergens in de maanden september en oktober. De deadline voor het inleveren van deze toets is 7 november middernacht.
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
| Weeknummer | Onderwerpen | Studiestof |
| 1 | ||
| 2 | ||
| 3 | ||
| 4 | ||
| 5 | ||
| 6 | ||
| 7 | ||
| 8 | ||
| 9 | ||
| 10 | ||
| 11 | ||
| 12 | ||
| 13 | ||
| 14 | ||
| 15 | ||
| 16 |
Zie hiervoor de uitgebreide informatie op Canvas.
Wellicht zinnig om nu vast te weten: voor de cursusonderdelen in eerste week (week 36) hoef je niets voor te bereiden. Zorg alleen dat je je laptop bij je hebt.
Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.
VOERTAAL: NEDERLANDS
De cursus wordt gegeven in het Nederlands, maar vanwege het Engelstalige cursusboek en omdat de wetenschappelijke voertaal doorgaans Engels is, worden in de hoor- en werkcolleges karakteristieke statistiektermen in het Engels gebezigd.
MEER CURSUSINFO OP CANVAS
Vanaf de eerste cursusdag is er een Canvas-omgeving beschikbaar die gedurende de gehele cursus up-to-date zal worden gehouden. Deze omgeving bevat nuttige informatie over rooster, huiswerk-, werkcollege- en laptopcollege-opgaven, powerpoint-slides van de hoorcolleges, video-opnames van de hoorcolleges, overzicht van de tentamenstof, en meer.
De informatie op Canvas is identiek met of uitgebreider dan de informatie in deze studiewijzer.
De studiewijzer is hoofdzakelijk bedoeld om een indruk te krijgen van de cursus voordat deze van start gaat. Daarna is de Canvas-omgeving de aangewezen plek voor informatie. Tijdens het introductiecollege zal het gebruik van Canvas worden toegelicht.
Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van eerdere vakevaluaties.
Naar aanleiding van de vakevaluatie uit 2017-2018 is (al in 2018-2019) het jarenlang gehanteerde 'strafsysteem' (wie te weinig aanwezig was bij de verplichte cursusonderdelen werd uitgesloten van het tentamen), vervangen door een 'beloningsysteem' waarbij ingeleverd huiswerk een deel van het eindcijfer kan opleveren.
De assistenten van de cursus uit 2018-2019 zijn spontaan begonnen met het nakijken van en feedback geven op ingeleverd huiswerk, en vanwege de waardering die dat bij de studenten oogstte, is het nakijken van en feedback geven op ingeleverd huiswerk dit jaar (2021-2022) tot vaste taak van de assistenten gemaakt.
Het enthousiasme en de betrokkenheid van de cursusleiding wordt jaarlijks gewaardeerd en als motiverend en ondersteunend ervaren en zullen we ook dit studiejaar weer op de eerste plaats zetten. :-)
Zolang de cursus nog niet gestart is, kunnen studenten communiceren met de coördinator.
Als de cursus eenmaal loopt (dat is vanaf 6 september 2021) wordt de studenten verzocht in principe alleen nog te communiceren met de assistenten. Daartoe kan gebruik gemaakt worden van het cursus e-mailadres 5042DAVA@gmail.com.
Indien er om wat voor redenen dan ook moet worden afgeweken van het persoonlijke rooster, is het van belang dit tijdig aan de assistenten door te geven.
Stuur geen inhoudelijke vragen (vragen over de stof) naar de coördinator of de assistenten Met dergelijke vragen kun je terecht op de hoorcolleges, werkcolleges en laptopcolleges.