Voortgezette Statistiek in de BMW

Advanced Statistics in BMS

4 EC

Semester 1 & 2, periode 3, 4

5051VSIB4Y

Eigenaar Bachelor Biomedische wetenschappen
Coördinator dr. ir. Michiel van Wijk
Onderdeel van Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1Dubbele bachelor Biomedische wetenschappen en Geneeskunde, jaar 1

Studiewijzer 2020/2021

Globale inhoud

In deze cursus zal aandacht worden besteed aan het ontwerpen van experimenten en het analyseren van vergaarde data. Daarnaast leert de student de resultaten hoe de resultaten van een statistische analyse worden gepresenteerd. 

Studiemateriaal

Literatuur

  • The analysis of biological data.  Whitlock & Schluter (3de druk)

Practicummateriaal

  • Materiaal van laptopcolleges wordt aangeboden in de digitale leeromgeving SOWISO

Software

  • R & R-studio

Overig

  • Een laptop is verplicht

Leerdoelen

  • statistische toetsen en methoden uit het vak Basiswiskunde en Statistiek in de BMW zoals de binomiaaltoets, de chi-kwadraat toets voor passendheid, de chikwadraat-toets voor onafhankelijkheid en de Fisher-exact toets kunnen uitvoeren en interpreteren.
  • werken met normaal verdeelde data, o.a. "z-scoring" en het uitvoeren en interpreteren van de resultaten van t-toetsen.
  • het op de juiste wijze kunnen toepassen van data transformaties (log arcsin en wortel) en verdelingsvrije methoden, o.a. de tekentoets, de Mann-Withney U toets en Wilcoxon's signed rank test en permutatie testen.
  • een experiment plannen en ontwerpen met inachtneming van de daaropvolgende dataverwerking en de statistische analyse.
  • toetsen of variabelen gecorreleerd zijn met parametrische en verdelingsvrije methoden.
  • relaties tussen numerieke variabelen onderzoeken met behulp van simpele regressie.
  • relaties tussen een numerieke responsvariabele en meerdere numerieke verklarende variabelen onderzoeken met multiple regressie.
  • general linear models (LM) fitten en selecteren voor interpretatieve en predicatieve doeleinden.
  • het effect van verklarende variabelen onderzoeken op bivariaten responsvariabelen met behulp van logistische regressie (GLM)
  • het vergelijken van de effectiviteit van interventies met survival analyse: de log rank test.
  • het op de juiste wijze rapporteren van de resultaten van statistische analyses en het op de juiste wijze weergeven in tabellen en figuren van verkregen data.

Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • Laptopcollege
  • Zelfstudie

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Uren

Digitale Deeltoetsen

3

Hoorcollege

20

Laptopcollege

40

Zelfstudie

49

Totaal

112

(4 EC x 28 uur)

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.

Toetsing

Onderdeel en weging Details

Eindcijfer

1 (100%)

Digitale Deeltoets 1

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Weeknummer Onderwerpen Studiestof
1 De normale verdeling Whitlock & Schluter hoofdstuk 10 & 11
2 Het vergelijken van gemiddelden (t-toetsen) Whitlock & Schluter hoofdstuk 12 
3 Verdelingsvrije methoden Whitlock & Schluter hoofdstuk 13
4 Deeltoets 1 Stof: Statistiek stof uit Basiswiskunde en statistiek + bovenstaande stof
5 Het vergelijken van gemiddelden in meer dan twee groepen (ANOVA & Kruska-Wallis) Whitlock & Schluter hoofdstuk 15
6 Correlatie en experimental design Whitlock & Schluter hoofdstuk 14 & 16
7 Enkelvoudige lineaire regressie Whitlock & Schluter hoofdstuk 17
8 General linear models 1: ANCOVA Whitlock & Schluter hoofdstuk 18
9 General linear models 2: multiple regressie en multiple comparissons  Whitlock & Schluter hoofdstuk 17 & 18
10 Generalized linear models: Logistische regressie Whitlock & Schluter hoofdstuk 17 & 18
11 Survival analyse: De log rank test Whitlock & Schluter hoofdstuk 21
12 Deeltoets 2 Stof: Alle statistiekstof uit de vakken basiswiskunde en statistiek en voortzetting statistiek. 

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Aanvullende informatie

Overgangsregeling

 

Wanneer u voor het studiejaar 2020-2021 Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 1 & 2 heeft gevolgd en voor een van deze vakken nog niet bent geslaagd geldt de volgende overgangsregeling: 

 

Reeds behaalde deelcijfers blijven geldig. De onderdelen kunnen apart worden herkanst.

 

De overgangsregeling per onderdeel is:  

 

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 1 onderdeel wiskunde: De eerste helft van de deeltoets 2 van het vak "Basiswiskunde en Statistiek in de BMW" (1 EC)

 

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 2 onderdeel wiskunde: De tweede helft van de deeltoets 2 van het vak "Basiswiskunde en Statistiek in de BMW" (1 EC)

 

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 1 onderdeel Statistiek: deeltoets 1 het vak "Basiswiskunde en Statistiek in de BMW" (2 EC) + deeltoets 1 van het vak "Voortgezette Statistiek in de BMW" (1 EC)

 

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 2 onderdeel Statistiek:  deeltoets 2 van het vak "Voortgezette Statistiek in de BMW" (3 EC)

Verwerking vakevaluaties

Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.

Contactinformatie

Coördinator

  • dr. ir. Michiel van Wijk