Ecofysiologie

Ecophysiology

Studiewijzer 2020/2021

Globale inhoud

Het vak biedt inzicht in de relatie tussen de verschijningsvorm van een organisme en z’n leefomgeving. Het vak vereist geen speciale voorkennis maar Biologie op middelbare school niveau is een pre. Het vak overkruist de vakgebieden van de gedragsbiologie, planten- en dierenfysiologie, neurobiologie, ecologie en evolutie in vogelvlucht en biedt naast kennis vooral inzicht in biologische interacties en ervaring met het opzetten van experimenteel onderzoek. De onderwerpen zijn:

• • Variatie en plasticiteit in fysiologie van planten en dieren;
  • De invloed van klimaatverandering op fysiologie;
  • De invloed van de biotische en abiotische leefomgeving op fysiologie;
  • De verdediging van planten en dieren tegen belagers (herbivoren, predatoren, parasitoiden en parasieten) en andere vormen van stress;
  • Fysiologische variatie gedurende de levensloop en levenscycli van organismen;
  • De fysiologie van het vermogen van planten en dieren om hun omgeving waarnemen;
  • Zoekgedrag, migratie, oriëntatie en leergedrag van dieren.

Studiemateriaal

Overig

• Na ieder college verschijnen de slides op Canvas, voorzien van een begeleidende tekst inclusief de verwijzingen naar de relevantie hoofdstukken en paragrafen uit het boek. Ook de Zoom opnames van de online colleges komen op Canvas.

   

  We gebruiken enkele hoofdstukken uit het boek “Plant Physiology and Development”, 6th ed, Taiz et al., ISBN: 9781605357454. Overig materiaal wordt als losse teksten of video’s toegevoegd aan het collegemateriaal op canvas.

Leerdoelen

• Kennis en inzicht toepassen in situaties die betrekking hebben tot de interacties van organismen met hun biotische en abiotische omgeving en waar selectie in deze milieus de plasticiteit van hun fysiologie heeft bepaald.
• Het uitvoeren van onderzoek en toetsen van zelf-geformuleerde hypothesen door middel van:
• Het lezen van wetenschappelijke literatuur (Engels) ter onderbouwing van een onderzoeksvraag
• Het formuleren van een toetsbare hypothese en deze uitwerken in de vorm van ‘aims & objectives’ (het ‘doel’ en het ‘stappenplan’)
• Het ontwerpen van een experiment, rekening houdende met dataverwerking, en in een groep tot consensus komen en taken verdelen
• Het uitvoeren een experiment uitvoeren en onderzoeksgegevens verzamelen op basis van een planning
• Het uitwerken van onderzoeksgegevens door middel van gangbare methodes in statistiek en datapresentatie
• Het rapporteren van onderzoeksresulaten m.b.v. een digitale poster

Onderwijsvormen

• Hoorcollege
• (Computer)practicum
• Presentatie/symposium
• Zelfstudie
• Begeleiding/feedbackmoment
• Werkcollege

Er worden negen online hoorcolleges gegeven in week 1 en 2. Deze hoorcolleges zijn thematisch, maar niet inhoudelijk, verbonden aan de practica.

Er zijn achttien dagdelen practicum in week 1, 3 en 4 van de cursus. Het practicumprogramma opgebouwd uit 2 delen: (1) tijdens de eerste cursusweek worden de studenten in groepjes van 10-12 personen bekend gemaakt met een modelsysteem. Elke groepje krijgt een begeleider toegewezen. Aan de hand van literatuur, internet, levend materiaal en discussie formuleert elke groep een onderzoeksvraag. Daarna zet elke groep deze vraag om in experimenten daarbij nadrukkelijk rekening houdende met dataverwerking en verslaglegging. Tijdens de tweede cursusweek zijn er twee werkcolleges ingeroosterd: de eerste geldt als reservetijd voor de voorbereiding van de practicumproeven in week 3. Deelname is verplicht mits anders besloten door de begeleider. De tweede bestaat uit een online workshop over de ‘wetenschappelijke poster’. Deelname is verplicht. Tijdens de derde en vierde cursusweek worden de experimenten uitgevoerd, gevolgd door data-analyse en verslaglegging in de vorm van een digitale wetenschappelijke poster. De cursus wordt afgesloten met een online presentatie van de posters en een schriftelijk tentamen.

Verdeling leeractiviteiten

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Deelname aan (computer)practica, veldwerk en werkcolleges is in principe verplicht. Eventueel aanvullende eisen worden per onderdeel in de studiewijzer omschreven. Hier staat ook beschreven wat de eventuele consequenties zijn van het niet nakomen van deze verplichting.
  

Aanvullende eisen voor dit vak:

Bovenstaande aanwezigheidsplicht geldt voor alle onderdelen m.u.v. de online hoorcolleges.

Mocht je wegens persoonlijke omstandigheden (denk hierbij aan ziekte of bijzondere familieomstandigheden) niet kunnen deelnemen aan een verplichte onderwijsbijeenkomst, neem dan direct per e-mail contact op met de vakcoördinator. De vakcoördinator bespreekt dan met je of je in aanmerking komt voor de vervangende opdracht ter compensatie van de afwezigheid. In de regel zal je hiervoor in aanmerking komen indien de afwezigheid over de gehele cursusperiode niet meer dan twee dagdelen betreft. Deze vervangende opdracht bestaat uit het schrijven van een practicumverslag over het gehele practicum. Het inhalen van onderdelen van het practicum binnen het lopende cursusjaar is niet mogelijk!

Ben je langdurig niet in staat om onderwijs te volgen (langer dan 1 week), neem dan ook contact op met de studieadviseur.

NB Covid-19: Houd je te allen tijde aan de RIVM richtlijnen, ook als dit betekent dat je daardoor één of meerdere verplichte onderwijsbijeenkomsten moet missen. Ook hiervoor geldt, neem direct contact op met de vakcoördinator zodat er samen gekeken kan worden of je in aanmerking komt voor de vervangende opdracht.

Toetsing

Voor het practicum moet minimaal een 5.5 worden gehaald. Het practicumcijfer is het gewogen gemiddelde van het persoonlijke cijfer (2/3) en het cijfer voor de groepsposter (1/3). Voor het schriftelijk tentamen moet minimaal een 5.0 worden gehaald. Je bent voor de module geslaagd wanneer het gewogen gemiddelde van tentamen en practicum gelijk of hoger is dan 6.0 (waarbij een 5.50 naar een 6.0 wordt afgerond). Hierbij gelden de regels uit het OER.

Inzage toetsing

Studenten kunnen hun tentamen inzien nadat het beoordeeld is. Omdat de afzonderlijke docenten eigen vragen aanleveren kunnen de nagekeken tentamens alleen per docent ingezien en besproken worden.

Opdrachten

Het practicum bestaat uit het opzetten van een experiment op basis van “aims & objectives” (zie ‘leerdoelen’) en eventueel een hypothese. Aan het eind van het practicum vervaardig je groepsgewijs een poster waarop het practicumwerk aan het eind van de cursus gepresenteerd wordt. De instructies voor het maken van de poster vind je op Canvas en tijdens de cursus wordt een poster workshop aangeboden. De poster wordt beoordeeld door de docenten en practicumbegeleiders.

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Aanvullende informatie

Dit vak heeft een Canvas-site. Hier vind je de noodzakelijke aanvullende informatie, zoals de groepsindeling van de werkcolleges, de opdrachten. Bekijk de Canvassite dus met grote regelmaat

Verwerking vakevaluaties

Vorig jaar viel de cursus precies in het begin van de eerste COVID golf. We hebben toen studenten een thuispracticum laten doen. Uit de evaluaties kwam naar voren dat de meeste studenten een sterke voorkeur hebben voor practicum op locatie. Omdat dat op moment is toegestaan vinden de practica nu weer op Science Park plaats.

Vorig jaar hebben we ongeveer de helft van de hoorcolleges van te voren opgenomen en aangeboden als video. Uit de evaluaties kwam naar voren dat er een sterke voorkeur is voor live online college. Het aanbieden van vooraf opgenomen colleges beperken we dit jaar dus tot het minimum.

Contactinformatie

Coördinator

• dr. M. Kant

Docenten

• Max Anders
• drs. Peter Assink
• G.M. Beretta MSc
• dr. E.R. Burdfield Steel
• dr. C. Diepenbroek-Barker PhD
• J. Diepstraten
• Arne Janssen
• kavel Ozturk
• B.O.C.M. van Pinxteren
• Peter Roessingh
• dr. ir. Michiel van Wijk