The Cell
6 EC
Semester 1, periode 1
5052CELX6Y
| Eigenaar | Bachelor Biomedische wetenschappen |
| Coördinator | dr. Rob Dekker |
| Onderdeel van | Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1 |
In deze cursus zullen de belangrijkste moleculen, structuren en processen in de cel worden behandeld uitgaande van de meest essentiële chemische en biologische principes. Dit betreft de organisatie van genetische informatie, biomoleculen en hun functie, celcyclus en celdood, transcriptie, translatie en energiemanagement van de cel.
Bovendien zal op basis van deze inzichten uitgelegd worden hoe cellen zullen zich kunnen gedragen in de context van andere cellen, organismen en ziekten. Hierbij zal de nadruk liggen op cellulaire communicatie, moleculaire mechanismen van evolutie, celtypen en hun functie, de ontwikkeling van kanker, goede en slechte micro-organismen en het afweersysteem.
Als laatste zal de student door middel van een practicum in deze cursus geleerd worden om basale cellulaire/moleculaire laboratoriumhandelingen zelfstandig, veilig en verantwoord uit te voeren.
Essential Cell Biology (5th edition) Alberts, Bruce ISBN 978-0393680362
Molecular Biology of the Cell (6th edition) Alberts, Bruce ISBN 9780815344643. Dit boek wordt gebruikt voor meerdere cursussen in de bachelorstudie.
Leerwijzer 'De Cel' (5052CELX6Y). Verkrijgbaar als PDF op Canvas.
Witte laboratoriumjas (verplicht voor het practicum in alle cursussen)
Practicumhandleiding 'De Cel' (5052CELX6Y). Zelf printen of laten drukken via Canvas.
Goed tekenpotlood (zwart)
Liniaal
Rekenmachine
Labjournaal (hier krijg je nog informatie over)
Laptop
Om dit vak te kunnen volgen zijn enkele verplichte artikelen nodig. Dit betreft een laboratoriumjas en een snijset. Deze zaken kunnen, indien lid van de studievereniging Congo, tegen een gereduceerd tarief in een webshop besteld worden (http://webshop.medicalwerff.nl/congo/index.php).
In deze cursus wordt gebruik gemaakt van Just-in-Time Teaching (JiTT). Hierbij bereidt de student zich in een werkcollege in kleine groepjes (~4 studenten) voor op het daaropvolgende JiTT college. Dit gebeurt door het lezen van de in de leerwijzer opgegeven stof en het maken van hierop aansluitende opdrachten. Vragen die ontstaan tijdens de voorbereiding kunnen op Canvas worden ingediend en zullen worden behandeld tijdens het JiTT college. De student sluit de voorbereiding af met het maken van een korte kennistoets die bestaat uit een selectie oude tentamenvragen. Tijdens het JiTT college wordt de stof kort in de juiste context geplaatst en worden de opdrachten die gemaakt zijn in de voorbereiding, evenals de ingediende vragen, doorgesproken. De cursus bestaat uit totaal 10 JiTT dagen die ieder een afgebakend onderwerp behandelen (zie onder Weekplanning hieronder).
Naast de JiTT colleges worden er twee zogenaamde highlight colleges gegeven met als thema baanbrekende technologische ontwikkelingen in de genomics en microscopie.
Tijdens het practicum wordt d.m.v. een aantal eenvoudige experimenten de basis gelegd voor het uitvoeren van enkele belangrijke standaard labaratoriumhandelingen. Het registreren van experimenten in een labjournaal wordt aangeleerd. Dit wordt per practicumonderdeel voorzien van feedback.
|
Activiteit |
Aantal uur |
|
JiTT college |
30 |
|
Hoorcollege |
12 |
|
Werkcollege |
20 |
|
Zelfstudie |
70 |
|
Practicum |
16 |
|
Tentamen |
3 |
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Bovenstaande aanwezigheidsplicht geldt ook voor alle 'live' aangeboden online (computer)practica en werkcolleges.
Mocht je wegens persoonlijke omstandigheden (denk hierbij aan ziekte of bijzondere familieomstandigheden) niet kunt deelnemen aan een verplichte onderwijsbijeenkomst, neem dan direct per e-mail contact op met de vakcoördinator. De vakcoördinator bespreekt dan met je of er mogelijkheden er zijn om het onderwijs op een andere wijze te volgen, en zo ja welke.
Ben je langdurig niet in staat om onderwijs te volgen (langer dan 1 week), neem dan ook contact op met de studieadviseur.
NB Covid-19: Houd je te allen tijde aan de RIVM richtlijnen, ook als dit betekent dat je daardoor één of meerdere verplichte onderwijsbijeenkomsten moet missen. Ook hiervoor geldt, neem direct contact op met de vakcoördinator zodat er samen gekeken kan worden naar een oplossing.
De werkcolleges en het practicum zijn dus verplicht. Er wordt een presentielijst bijgehouden door de docent. Mocht je door overmacht niet in staat zijn om bij één van deze onderdelen aanwezig te zijn, meld dit dan vooraf op de-cel-fnwi@uva.nl
De consequentie van het missen van een werkcollege of practicumdeel wordt in overleg met de vakcoördinator bepaald.
Herhaaldelijke afwezigheid zonder geldige reden of zonder afmelding kan tot uitsluiting van het vak leiden. Ook bij te laat komen voldoe je niet aan de aanwezigheidsplicht. Bij uitsluiting van het vak wordt er geen eindcijfer geregistreerd.
De JiTT (hoor)college's zijn niet verplicht, maar deelname wordt sterk aangeraden.
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer | |
|
1 (100%) Digitale Toets |
Het tentamen bestaat uit meerkeuzevragen en wordt afgenomen over de gehele stof die tijdens De Cel aan bod is gekomen, zoals weergegeven in de leerwijzer. Het tentamencijfer wordt afgerond op 1 decimaal en is het eindcijfer voor het gehele vak. Het vak is gehaald als het tentamencijfer een 5,5 of hoger is en als het practicum beoordeeld is met 'aan voldaan'.
Naast een pen zijn er geen verdere toegestane hulpmiddelen.
Labjournaals die niet voor het officiele eind van het betreffende practicumonderdeel zijn ingeleverd (zie rooster), worden niet meer van feedback voorzien. Dit kan in combinatie met andere als slecht beoordeelde practicumonderdelen leiden tot een 'niet aan voldaan' beoordeling van het gehele practicum. In dit geval kan er geen eindcijfer voor het vak worden geregistreerd ook al is het theoriedeel wel voldoende.
Als je tijdig een inzagemoment hebt aangevraagd dan krijg je binnen enkele dagen per mail te horen wanneer en waar dit plaats zal vinden.
Als je het tentamen in wilt zien, stuur dan binnen 5 werkdagen nadat de uitslag bekend is gemaakt een e-mail naar de-cel-fnwi@uva.nl
JiTT | Opdrachten:
Voorafgaand aan ieder JiTT college worden in kleine groepen opdrachten gemaakt die op Canvas te vinden zijn. Deze opdrachten zijn bedoeld om met de stof te oefenen en zijn geen afspiegeling van de vragen die op het tentamen zullen worden gesteld. De opdrachten tellen niet mee voor het eindcijfer. Als de student specifieke vragen heeft over de stof dan kunnen deze voorafgaand aan het JiTT hoorcollege op het betreffende Discussion Board op Canvas worden ingediend.
JiTT | Kennistoets:
Voorafgaand aan ieder JiTT college wordt door iedere student individueel op Canvas een digitale toets gemaakt (kennistoets). De vragen zijn o.a. geselecteerd uit oude tentamenvragen. Knelpunten bij de vragen worden kort behandeld in het JiTT college. Dit telt niet mee voor het eindcijfer.
Practicum | Vragen
Voorafgaand aan en tijdens het practicum worden vragen uit de practicumhandleiding beantwoord. Hoewel de kwaliteit van de antwoorden niet meetelt voor het eindcijfer, weegt de inzet bij het maken ervan wel mee bij de eindbeoordeling van het practicum.
Practicum | Labjournaal:
Voor ieder experiment moet een labjournaal worden bijgehouden. Deze dient na afloop van het practicumonderdeel te worden ingeleverd bij de assistent. Per practicumonderdeel wordt het labjournaal van feedback voorzien door de assistent.
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
| Week | Onderwerp | Inhoud |
| 1 | JiTT 1 | Biomolecules | DNA, RNA, proteins, fats, lipids, polysaccharides and glycogen |
| 1 | JiTT 2 | Cell cycle | Cell cycle order, mitosis, DNA replication, apoptosis, DNA damage and repair |
| 2 | JiTT 3 | Transcription | Production, processing, degradation and regulation of RNA |
| 2 | JiTT 4 | Translation | Production, degradation and regulation of proteins |
| 3 | JiTT 5 | Energy management | Energy carriers, glycolysis, citric acid cycle, oxidative phosphorylation, glycogen and fat |
| 3 | JiTT 6 | Cell signaling | General principles, intracellular signaling and extracellular signaling |
| 4 | JiTT 7 | Evolution | Mutation, recombination, transposition and meiosis |
| 4 | JiTT 8 | Tissue types | Epithelium, connective tissue, muscular tissue, nervous tissue and stem cells |
| 5 | JiTT 9 | Cancer & Immunology |
Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.
Aanbevolen voorkennis: middelbare school scheikunde en biologie.
Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.
- Een groot deel van het tentamen toets feitenkennis. Per JiTT onderdeel zal een vast aantal vragen nu ook op inzicht testen.
- De oefenvragen die aan het eind van de werkcollege's worden gemaakt (kennistoets) zullen voor een groot deel uit tentamenvragen van voorgaande jaren bestaan zodat deze toetsen een betere afspiegeling van het tentamen vormen.
Neem uitsluitend contact op via onderstaande mailadressen. E-mails naar andere adressen kunnen helaas NIET worden beantwoord.
Voor algemene vragen, ziekmeldingen en meldingen van te laat komen: de-cel-fnwi@uva.nl