Experimentatie jaar 2

Experimentation Year 2

15 EC

Semester 1 & 2, periode 1, 2, 3, 4, 5

51022EJ15Y

Eigenaar Bachelor Psychobiologie
Coördinator J. Struik MSc
Onderdeel van Bachelor Psychobiologie, jaar 2

Studiewijzer 2019/2020

Globale inhoud

De practicumreeks wordt in groepen van 36 studenten parallel georganiseerd aan de theoretische vakken van het tweede jaar Psychobiologie. Het practicum sluit inhoudelijk zoveel mogelijk aan op deze theoretische vakken van het tweede studiejaar. Verschillende vaardigheden waarmee kennis is gemaakt in het eerste jaar zoals bij Academische Basisvaardigheden, Methode van Onderzoek & Statistiek en bij de verschillende practica zullen in dit practicum nader worden toegepast. Het practicum vormt de overgang tussen de kortere, meer illustratieve practica uit het eerste jaar en het zelfstandig doen van onderzoek aan het einde van de bacheloropleiding en in de eventuele masterfase. De studenten doen individueel of groepsgewijs experimenten die meerdere dagdelen in beslag nemen en waarover zij schriftelijk dan wel mondeling rapporteren.

Studiemateriaal

Literatuur

  • Academische Vaardigheden voor Interdisciplinaire Studies (boek van ABV uit jaar 1)

  • Matlab: A Practical Introduction to Programming and Problem Solving, Attaway S. Elsevier, 4e editie.

Syllabus

  • Per practicum zal er via Canvas een handleiding verstrekt worden.

Software

  • Matlab en R (zie Canvas)

Overig

  • Voorafgaand aan ieder practicim kan in de Rubrics worden gezien wat er van de studenten wordt verwacht.

Leerdoelen

  • De student kan de theoretische achtergronden (concepten) van de experimenten en gebruikte technieken uitleggen en toepassen op experimenteel onderzoek
  • De student kan een protocol correct interpreteren en uitvoeren
  • De student kan correct programmeervaardigheden toepassen
  • De student is in staat om methodologische problemen op te sporen, op te lossen en onderbouwde experimentele alternatieven aan te dragen
  • De student kan verschillende experimentele stappen toelichten en de samenhang hiertussen uitleggen
  • De student kan de gebruikte technieken generaliseren en toepassen op een andere onderzoeksvraag
  • De student kan zelfstandig originele hypotheses formuleren
  • De student kan zelfstandig toetsbare experimenten ontwerpen
  • De student houdt zich aan milieu- en veiligheidsvoorschriften
  • De student werkt goed samen met medestudenten
  • De student communiceert helder en correct met medestudenten, assistenten, docenten en eventueel proefpersonen
  • De student bereid zich goed voor op de practica
  • De student doet actief mee
  • De student is op tijd en houdt zich aan afspraken en deadlines
  • De student kan op een wetenschappelijke manier schriftelijke verslaglegging doen in het Engels
  • De student kan op wetenschappelijke manier mondeling verslaglegging doen in het Engels
  • De student toont aan over algemene laboratoriumvaardigheden en voor de Psychobiologie relevante onderzoeks- en computervaardigheden (zoals werken met proefpersonen en andere levende organismen, en kennis van R.) te beschikken.
  • De student kan reflecteren op eerder (niet-) geleerde vaardigheden of technieken
  • De student kan een peer review op een verslag geven en ontvangen
  • De student kan feedback op presentaties geven / ontvangen
  • De student kan (digitale) informatiebronnen (bibliotheeksystemen) onderzoeken en inhoud van de deze informatie (literatuur) organiseren en beoordelen.

Onderwijsvormen

  • Werkcollege
  • Presentatie/symposium
  • Zelfstudie
  • Zelfstandig werken aan bijv. project/scriptie
  • Begeleiding/feedbackmoment
  • Practica
  • Computerpractica
  • Proefpersoonpunten
  • Werkcolleges Engels
  • Orientatie jaar 2
  • Laptopcollege

Aan de hand van diverse practica komen vele verschillende vaardigheden aan bod. 

  • Practicum 1: Theorie van het Hodgkin & Huxley model. Aan de hand van computer simulaties krijg je inzicht in de werking van ionkanalen en actiepotentialen in elektrisch prikkelbare cellen.
  • Practicum 2: Neurofarmacologie. Je leert over de invloed van neurofarmacologie op elektrische signaalgeleiding in reuze-axonen.
  • Practicum 3: Leren en Geheugen. Je doet een computerpracticum met Matlab op basis van een door jezelf ontwikkelde geheugentaak aan proefpersonen.
  • Practicum 4: Inleiding Programmeren. Je programmeert en voert een visual search task uit in Matlab.

  • Practicum 5: EEG. Je stelt een EEG onderzoek op en voert het uit.
  • Practicum 6: Moleculaire Celbiologie. Je bouwt voort op je kennis en vaardigheden uit het practicum Celbiologie en bestudeert mutaties in de hGR-GFP..

De volgende onderdelen zijn ook bij Experiementatie ondergebracht:

  • Methoden en Technieken: bij iedere practicum van Experimentatie krijg je inzicht in hoe verschillende methoden en technieken toegepast kunnen worden in het brede onderzoeksveld van de Psychobiologie.
  • Oriëntatie jaar 2: Je zet de volgende stap in je eigen (studie-)loopbaanoriëntatie traject aan de hand van reflectieve vragen en wordt begeleid om een geïnformeerde keuze te maken voor derdejaars keuzevakken, mogelijke stageplekken en je master.
  • Highlightcolleges: inzicht krijgen in verschillende onderzoeksgroepen aan de UvA (wie en wat ze doen) en verschillende onderzoeksvelden waarin je terecht kunt komen na je studie.  
  • Proefpersoonpunten: Je behaalt proefpersoonpunten door deel te nemen aan Psychologieonderzoek.

Verdeling leeractiviteiten

Onderwijsvorm Aantal uur
hoorcollege 16
werkcollege 96
practicum 104
presentatie 22
tentamen 2
zelfstudie 180

Academische vaardigheden

Vermeld onder ' Leerdoelen'.

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan alle practica, computerpractica, veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht. Eventueel aanvullende eisen worden per onderdeel in de studiewijzer omschreven. Hier staat ook beschreven wat de eventuele consequenties zijn van het niet nakomen van deze verplichting.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanwezigheid bij de practica en werkcolleges is verplicht en de student dient zich op deze practica terdege voor te bereiden. Bij overmacht moet je je van te voren per e-mail afmelden bij je practicumdocent via Psychobiologiejaar2-science@uva.nl. Daarnaast moet je ook bij afwezigheid aan de deadlines voor het inleveren van opdrachten voldoen. Je bent er zelf verantwoordelijk voor dat je de informatie die je hebt gemist, verkrijgt via je docent en/of je medestudenten.

Toetsing

Onderdeel en weging Details Opmerkingen

Eindcijfer

25%

Hodgkin & Huxley / Neurofarmacologie

Moet ≥ 5.5 zijnblijft tot einde volgend collegejaar staan

40%

Praktisch werk

30%

Academische houding

10%

Posterpresentatie Hodgkin & Huxley

Moet ≥ 5 zijnherkansbaar voor maximaal een 6

20%

Verslag Neurofarmacologie

Moet ≥ 5 zijnherkansbaar voor maximaal een 6

15%

Programmeren

Moet ≥ 5.5 zijnblijft tot einde volgend collegejaar staan

25%

Praktisch werk

20%

Academische houding

25%

Code

Moet ≥ 5 zijnherkansbaar voor maximaal een 6

30%

Rapport

Moet ≥ 5 zijnherkansbaar voor maximaal een 6

20%

Leren en Geheugen

Moet ≥ 5.5 zijnblijft tot einde volgend collegejaar staan

30%

Praktisch werk

30%

Academische houding

10%

Presentatie

Moet ≥ 5 zijnherkansbaar voor maximaal een 6

30%

Verslag

Moet ≥ 5 zijnherkansbaar voor maximaal een 6

25%

EEG

Moet ≥ 5.5 zijnblijft tot einde volgend collegejaar staan

30%

Praktisch werk

30%

Academische houding

10%

Presentatie

Moet ≥ 5 zijn

30%

Verslag

Moet ≥ 5 zijn

15%

Moleculaire celbiologie

Moet ≥ 5.5 zijnblijft tot einde volgend collegejaar staan

30%

Praktisch werk

30%

Academische houding

25%

Labjournaal

Moet ≥ 5 zijn

15%

Open boek-tentamen

Moet ≥ 5 zijn

Methoden en Technieken

Moet ≥ AVV zijnzie uitleg op Canvas

Orientatietraject

Moet ≥ AVV zijnMinimaal 18 punten halen, zie uitleg op Canvas

Highlightcolleges

Minimaal 3 highlightcolleges bezoeken (3 punten)

Proefpersoonpunten

Minimaal 5 punten halen

Orientatieactiviteiten

Verplicht 6 punten halen

De beoordeling van dit vak is gebaseerd op de beoordeling van zes practica. Ieder practicumcijfer wordt bepaald door het gewogen gemiddelde van een aantal deelcijfers, bijvoorbeeld deelcijfers voor verslagen, academische houding, praktisch werk, etc. Per practicum is er een beoordelingsmodel dat via Canvas bekend wordt gemaakt. 

 

Afronding

Alle deelcijfers worden op tienden afgerond. Practicumcijfers worden op 0,5 punt afgerond. Het eindcijfer van Experimentatie Jaar 2 wordt op 0,5 punt afgerond, waarbij geldt dat een 5,5 niet gegeven wordt: Dit wordt afgerond naar 5,0 of een 6,0, afhankelijk van het onafgeronde cijfer.

 

Herkansingen van eindproducten binnen practica

De deadline voor het herkansen is 5 werkdagen na het bekendmaken van het practicumcijfer. Hierbij geldt dat je voor je herkanste eindproduct maximaal een 6,0 kan halen. Dit houdt in dat het practicumcijfer wel hoger dan een 6,0 kan uitkomen.

 

Feedback  

Bij ieder practicum wordt middels een Rubric feedback gegeven door je practicumbegeleider. Het doel van de feedback is om informatie te bieden over wat er goed is aan de opdracht en over wat er nog verbeterd kan worden. Daarnaast geeft het informatie over welke vaardigheden je al beheerst en aan welke vaardigheden je in de volgende opdracht nog moet werken. Er wordt verwacht dat je de feedback en feedforward op je vaardigheden gebruikt bij je volgende opdrachten van Experimentatie en bij andere vakken zoals de Miniscriptie en Bachelorproject. Zo verbeter je je academische vaardigheden gedurende je hele studie. 

Inzage toetsing

De manier van inzage wordt via de webpagina van het vak gecommuniceerd.

Inzage in practicumcijfer

Om inzage te krijgen in de beoordeling van de practica, kun je een afspraak maken met je docent. Als je na dit gesprek niet tevreden bent, kun je contact opnemen met de practicumcoördinator, en eventueel de coördinator van Experimentatie jaar 2. Een overzicht van de docenten en coördinatoren vind je aan het einde van deze studiewijzer.

Opdrachten

Verslagen, posters, presentaties, (zie practicumhandleiding)

  • De gemaakte opdrachten dienen voor de door de docent gestelde deadline ge-upload te worden in Canvas, waar voor elke student een portfolio wordt aangelegd. Afwezigheid bij een practicum is in principe geen reden tot uitstel van de deadline. Als je een deadline niet haalt, krijg je geen cijfer voor de opdracht.

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Het rooster voor dit vak hangt van de groepsindeling af. Je ziet via DataNose in welke groep je bent ingedeeld. Iedere groep begint met Hodgkin & Huxley, gevolgd door Neurofarmacologie, Programmeren, Leren en Geheugen, EEG en Moleculaire Celbiologie.  Bij iedere practicum zitten de werkcolleges voor Methoden en Technieken. Tussendoor wordt de Oriëntatie-opdracht uitgevoerd, zijn er Highlightcolleges en worden de proefpersoonpunten behaald.

In de handleidingen van de practica en Canvas vind je meer informatie over welke stof wanneer behandeld wordt, wat je voor wanneer moet voorbereiden (zelfstudie) en welke deadlines er zijn.

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Honoursinformatie

Er is een 3 EC honours-uitbreiding op de practica van Leren en Geheugen en EEG. Neem hiervoor contact op met Tonny Mulder.

Eindtermen

Via de Zichtbare Leerlijnen Creator kun je zien aan welke eindtermen de leerdoelen van deze cursus bijdragen en hoe de  vakleerdoelen, leerlijndoelen en eindtermen van de opleiding aan elkaar gekoppeld zijn:

https://datanose.nl/#program[BSc%20PB]/outcomes 

https://datanose.nl/#program[BSc%20PB]/trajectories

Aanvullende informatie

Dit vak heeft een Canvassite. Hier vind je de noodzakelijke informatie voor de practica. Bekijk de Canvassite dus met grote regelmaat!

Deze cursus moet behaald zijn alvorens aan het Bachelorproject in het 3e jaar te kunnen beginnen.

Verwerking vakevaluaties

Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.

Contactinformatie

Coördinator

  • J. Struik MSc

Bij algemene vragen over het vak kan je bij de Coördinator Experimentatie terecht. Voor vragen over een specifiek practicum bij de coördinator van het betreffende practicum:

Coördinator Experimentatie jaar 2
Jerry Struik

Coördinator practicum H&H, Neurofarmacologie
Taco Werkman

Coördinator practicum Programmeren
Julia Dawitz

Coördinator practicum Leren & Geheugen
Tonny Mulder

Coördinator practicum EEG
Tonny Mulder

Coördinator practicum Moleculaire Celbiologie
Richard de Boer

Docenten

  • Ilja Boor
  • Sandra Cornelisse
  • Julia Dawitz
  • Cato Drion
  • Zainal Haberham
  • Mao Hashemi
  • Hannie van Hooff
  • Laura Koenders
  • Joost van Kordelaar
  • Tonny Mulder
  • Jonas van Nijnatten
  • Sam van Bijnen
  • Chantal Vlaskamp
  • Eleni Spyropoulou