Moleculaire Neurobiologie 3

Molecular Neurobiology 3

6 EC

Semester 1, periode 3

51023MON6Y

Eigenaar Bachelor Psychobiologie
Coördinator dr. M.F.M. Hoekman
Onderdeel van Bachelor Psychobiologie, jaar 3Bachelor Bèta-gamma, major Neurobiologie, jaar 3Bachelor Biomedische wetenschappen, specialisatie Neurobiologie, jaar 3

Studiewijzer 2019/2020

Globale inhoud

Tijdens het vak moleculair neurobiologie 3 ga je, in een groep, onderzoek doen naar de mechanismen die ten grondslag liggen aan de neurodegeneratieve aandoeningen Amyotrofische Laterale Sclerose en de ziekte van Parkinson. Belangrijkste doel van deze cursus is het ontwerpen en uitvoeren van een onderzoeksstrategie.  Een kritische academische houding ligt hieraan ten grondslag. Tijdens de werkbesprekingen wordt literatuur besproken en ga je je eigen experimenten opzetten, die je tijdens de practica gaat uitvoeren. Het vak geeft inzicht in hoe wetenschappelijk onderzoek wordt uitgevoerd in een moleculair neurobiologisch lab aan de UvA (Molecular Neuroscience). 

Studiemateriaal

Literatuur

  • Molecular Biology of the Cell (6e druk, Alberts et al.)

Practicummateriaal

  • Practicumhandleiding

Overig

  • Achtergrondliteratuur (beschikbaar via Canvas)

Leerdoelen

  • wetenschappelijke literatuur selecteren en kritisch inhoudelijk beoordelen.
  • een presentatie geven over bevindingen in wetenschappelijk Nederlands en Engels.
  • het onderzoeksverslag en presentatie van medestudenten kritisch beoordelen
  • de theoretische achtergronden (concepten) van de volgende experimenten en technieken uitleggen en toepassing op experimenteel onderzoek: Basale aseptische, microbiologische en moleculair biologische technieken waaronder: transiente transfecties; celkweek van Neuro2A cellen; celpreparaten maken; fluorescentie microscopie; MTA-assay; semi-kwantitatieve PCR; SDS-PAGE; Westernblot; Immunocytochemie, eiwit bepaling, cellysaten maken.
  • uit een onderzoeksartikel een protocol interpreteren en toepassen op experimenteel onderzoek
  • de verschillende experimentele stappen toelichten en de samenhang hiertussen uitleggen
  • zelfstandig de empirische cyclus doorlopen en toepassen in experimenteel onderzoek: 1) selecteren literatuur; 2) opstellen onderzoeksvraag en onderzoekshypothese; 3) maken van proefopzet (inclusief voorspellingen); 4) (statistisch) analyseren, interpreteren en bediscussiëren van verkregen resultaten
  • een labjournaal bijhouden
  • reflecteren op eigen handelen
  • professioneel samenwerken met medestudenten
  • deelnemen aan een wetenschappelijke discussies (mening naar voren brengen, verantwoorden en overeind houden)
  • de algemene veiligheidsregels (voor mens en milieu) benoemen en toepassen
  • uitleggen wat er onder een professionele lab- (academische-)houding wordt verstaan en hier naar gedragen
  • bedenken en beschrijven van een experimentele strategie aan de hand van een eerder geformuleerde hypothese
  • formuleren van een probleemstelling in de vorm van een onderzoeksvraag en hypothese op basis van wetenschappelijke literatuur en beschikbare technieken
  • organiseren en coordineren van de onderzoeksgroep met het doel de voorgestelde onderzoeksstrategie (in groepsverband) uit te voeren

Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • Werkcollege
  • Presentatie/symposium
  • Zelfstudie
  • Begeleiding/feedbackmoment

Hoorcolleges (verplicht): hoe ontwerp je een onderzoeksstrategie, met (oa) ALS en PD als voorbeelden 

Werkcolleges (verplicht): bespreking van de gekozen onderzoeksstrategie en uitgevoerde experimenten

Practicum (verplicht): kritisch en creatief denken, verschillende labvaardigheden

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Aantal uur

Hoorcollege

8

Practicum

68

Presentatie

16

Tentamen

3

Werkcollege

20

Zelfstudie

53

Totaal 6EC * 28

168

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan alle practica, computerpractica, veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht. Eventueel aanvullende eisen worden per onderdeel in de studiewijzer omschreven. Hier staat ook beschreven wat de eventuele consequenties zijn van het niet nakomen van deze verplichting.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Voor zowel de Highlight-colleges, werkcolleges als practica geldt een strikte aanwezigheidsplicht. Je mag gedurende het hele vak maximaal 1 van de highlightcolleges en werkcolleges missen. Ben je vaker dan 1 maal afwezig, dan wordt er geen eindcijfer geregistreerd.

Toetsing

Onderdeel en weging Details

Eindcijfer

0.2 (20%)

Tentamen

Moet ≥ 5 zijn

0.25 (25%)

Labvaardigheden

Moet ≥ 5 zijn

0.2 (20%)

Verslag

Moet ≥ 5 zijn

0.25 (25%)

Academische houding

Moet ≥ 5 zijn

0.1 (10%)

Presentatie

Moet ≥ 5 zijn

Voor alle te toetsen onderdelen geldt dat er minimaal een 5 voor moeten worden gehaald. Short report, presentatie(s) en tentamen zijn herkansbaar. Geen van de onderdelen is compenseerbaar. 

Inzage toetsing

De manier van inzage wordt via de digitale leeromgeving gecommuniceerd.

Tentamens mogen niet worden meegenomen. Kort na het tentamen is er een moment waarop studenten de tentamenvragen kunnen inzien en opmerkingen over tentamenvragen kunnen melden. Datum, tijdstip en plaats worden via Canvas gecommuniceerd. Opmerkingen zullen behandeld worden door de docenten en worden teruggekoppeld via Canvas. Zodra de uitslag van een deeltentamen bekend is, is er een moment waarop studenten hun uitwerking van het tentamen en antwoordmodellen kunnen inzien. Datum, tijdstip en plaats worden via Canvas gecommuniceerd.

Opdrachten

JournalClub

  • De studenten lezen papers over ALS en Parkinson’s en presenteren die aan elkaar.

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Weeknummer Onderwerpen Studiestof
1
2
3
4

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Eindtermen

Via de Zichtbare Leerlijnen Creator kun je zien aan welke eindtermen de leerdoelen van deze cursus bijdragen en hoe de  vakleerdoelen, leerlijndoelen en eindtermen van de opleiding aan elkaar gekoppeld zijn:

https://datanose.nl/#program[BSc%20PB]/outcomes 

https://datanose.nl/#program[BSc%20PB]/trajectories

Aanvullende informatie

De inhoud van het vak Moleculaire Neurobiologie sluit aan bij het vak Celbiologie gegeven in jaar 1 en Moleculaire Celbiologie dat onderdeel is van het vak Experimentatie jaar 2 dat gegeven wordt in jaar 2.

Capaciteit: max 60 deelnemers

Verwerking vakevaluaties

Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.

Contactinformatie

Coördinator

  • dr. M.F.M. Hoekman