Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 1

Basic Statistics and Mathematics in Biomedical Sciences 1

4 EC

Semester 1, periode 1, 2

50521BSW4Y

Eigenaar Bachelor Biomedische wetenschappen
Coördinator dr. ir. Michiel van Wijk
Onderdeel van Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1Dubbele bachelor Biomedische wetenschappen en Geneeskunde, jaar 1

Studiewijzer 2019/2020

Globale inhoud

Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 1

De vakken Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 1 & 2 lopen worden als een lint gegeven gedurende periode 1, 2, 3 en 4. Binnen deze twee vakken zijn het wiskunde onderdeel en het statistiek onderdeel niet onderling compenseerbaar. Voor zowel het wiskunde onderdeel als het statistiek onderdeel geldt dat er een doorlopende opbouw in de gegeven stof in de vakken Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 1 & 2 zit. Om deze leerlijn en de uiteindelijke leerdoelen duidelijk te maken worden hieronder voor ieder onderdeel eerst de algemene leerdoelen geformuleerd. Daarna wordt kort aangegeven welke onderdelen van deze algemene leerdoelen worden gegeven in het vak Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 1

Studiemateriaal

Literatuur

  • The Analysis of Biological Data. Whitlock and Schluter, 2nd edition, 2015. ISBN-10: 1-936221-48-9; ISBN-13: 978-1-936221-48-6; LET OP: dit mag NIET de 1st edition zijn!  

Practicummateriaal

  • Laptop

Software

  • R

  • Rstudio

  • Excel

  • Sowiso (internet)

Overig

Leerdoelen

  • ruwe empirische data ordenen en zo organiseren dat de data op de juiste wijze weer kan worden gegeven in tabellen en figuren.
  • vaststellen aan de hand van empirisch verkregen data welke statistische methoden het meest geschikt is om de data te analyseren en deze analyse vervolgens uitvoeren.
  • experimenten zorgvuldig ontwerpen en beargumenteren waarom een bepaald experimenteel ontwerp geschikt is om de onderzoeksvraag te beantwoorden en aangeven hoe de verkregen data verwerkt en geanalyseerd zullen worden.
  • data beweringen, statistische bewerkingen en grafische representaties van de data uitvoeren in R en Excel.
  • Uitleggen wat statische begrippen als populaties en steekproeven, toetsingsgrootheden, kansverdelingen en beschrijvende statistieken zijn.
  • discrete en voorwaardelijke kansrekeningsvraagstukken oplossen.
  • basale statistische methoden zoals de chi-kwadraat toets, t-toets en ANOVA toepassen op empirisch verkregen data.
  • bovengenoemde technieken uitvoeren in Excel of R.
  • basiswiskunde kennis en vaardigheden toepassen om elementaire vraagstukken wiskundig te modelleren, te simuleren en te analyseren.
  • wiskundige voorstellingen hanteren om problemen in herkenbare contexten en in situaties zoals die later in de studie aan de orde komen te beschrijven en te analyseren.
  • zich fundamentele begrippen en technieken eigen te maken en hanteren uit het gebied dat ook wel bekend staat onder naam Dynamische Systemen of meer specifiek als Systeembiologie.
  • wiskundeteksten op basisniveau lezen en de betekenis van de meeste formules in de literatuur begrijpen.
  • wiskundige berekeningen en antwoorden op vragen correct formuleren en op te schrijven.

Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • Laptopcollege
  • Zelfstudie

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Uren

Digitale Toets

3

Hoorcollege

26

Laptopcollege

42

Vragenuur

2

Zelfstudie

39

Totaal

112

(4 EC x 28 uur)

Academische vaardigheden

Empirische cyclus

  • De student leer onderzoeksvragen om te zetten in toetsbare hypotheses
  • De student leer hoe onderzoeksresultaten statistisch worden getoetst en welke conclusies aan deze toetsing kunnen worden verbonden.

 

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Laptop colleges zijn verplicht, afwezigheid dient vooraf gemeld te worden.

Toetsing

Onderdeel en weging Details

Eindcijfer

1 (100%)

Digitale Toets

Het tentamen bestaat uit een wiskunde en een statistiek onderdeel. Het wiskunde onderdeel omvat 1/4 van het eindcijfer terwijl het statistiek deel 3/4 deel van het eindcijfer omvat. 

Voor beide onderdelen dient minimaal een voldoende te worden behaald.

 

 

Inzage toetsing

Inzage verloopt digitaal

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Periode Week nr. Datum Onderdeel Studiestof
1 38   Statistiek W&S Hoofdstuk 1: Statistics and samples
16-Sep W&S Hoofdstuk 2: Displaying data 
20-Sep Theorie sowiso WC 1a & 1b
   
39   Statistiek W&S Hoofdstuk 3: Describing data
23-Sep W&S Hoofdstuk 4: Estimating with uncertainty
27-Sep Theorie sowiso WC 2a & 2b
   
40   Statistiek W&S Hoofdstuk 5: Probability
30-Sep Theorie sowiso WC 3a & 3b
04-Oct  
   
41   Statistiek W&S Hoofdstuk 6: Hypothesis testing
07-Oct W&S Hoofdstuk 7: Analyzing proportions
11-Jan Theorie sowiso WC 4a & 4b
   
   
42   Statistiek W&S Hoofdstuk: 8 Fitting probability models to frequency data
14-Oct W&S Hoofdstuk: 9 Contingency analysis
18-Oct Theorie sowiso WC 5a & 5b
   
   
43     Tentamens andere vakken
21-Oct
25-Oct
 
2 44   Statistiek W&S Hoofdstuk: 10 The normal distribution
28-Oct W&S Hoofdstuk: 11 Inference for a normal population
01-Nov Theorie sowiso WC 6a & 6b
   
45   Statistiek W&S Hoofdstuk: 12 Comparing two means (t tests)
04-Nov Theorie sowiso WC 7a & 7b
08-Jan  
   
46   Wiskunde Theorie onderdelen uit sowiso WC 8
11-Nov
15-Nov
 
47   Statistiek W&S Hoofdstuk: 13 Handling violations of assumptions
18-Nov Non-parametric tests
22-Nov Theorie sowiso WC 9a & 9b
   
48   Wiskunde Theorie onderdelen uit sowiso WC 10
25-Nov
29-Nov
 
49   Statistiek W&S Hoofdstuk 15: Compairing means of more than two groups 
  Theorie sowiso WC 11a
02-Dec  
06-Dec Wiskunde Theorie onderdelen uit sowiso WC 11
 
 
50   Statistiek W&S Hoofdstuk: 15 Comparing means of more than two groups
  Multiple comparissons & choosing among tests
  Theorie sowiso wc 12a
09-Dec Wiskunde  
13-Dec Theorie sowiso WC 12
   
51   Statistiek wiskunde Vragenuur
 
  Tentamen Statistiek & Wiskunde
  Om voor het vak te slagen moet voor de onderdelen wiskunde en statistiek, een voldoende worden gehaald.
   
  -Het tentamen wordt afgenomen in sowiso
16-Dec -Excel, R en RStudio plus de benodigde libraries zijn beschikbaar
20-Dec -Het statistiek onderdeel betreft een openboek tentamen (W&S dus meenemen!)
  Voor statistiek zal er een R-code referentie  blad beschikbaar zijn.
  -Het wiskunde onderdeel betreft geen openboek tentamen. De theorie op sowiso zal niet toegankelijk zijn.
  Voor het wiskunde deel zal een R-code referentie blad beschikbaar zijn.
  -“Help” in R is toegankelijk
   

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Verwerking vakevaluaties

Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.

Contactinformatie

Coördinator

  • dr. ir. Michiel van Wijk

Docenten

  • dr. A.J.P. Heck
  • Tomas Meijer