Data Collection and Analysis
6 EC
Semester 1, periode 1, 2
5042DAVA6Y
| Eigenaar | Bachelor Biologie |
| Coördinator | drs. Peter Assink |
| Onderdeel van | Bachelor Biologie, jaar 1Pre-master Biological Sciences, jaar 1 |
Data Verzamelen en Analyseren is een zestienweekse cursus die plaatsvindt gedurende de eerste vier maanden (sep-dec) van het eerste studiejaar. In de cursus (1) wordt aandacht besteed aan op welke wijze je onderzoeksgegevens moet verzamelen om ze zinvol te kunnen analyseren, en (2) worden enige eenvoudige analysetechnieken besproken en geoefend, zowel met pen en papier als met een statistiekprogramma. Veel van deze analysetechnieken worden in latere cursussen van de bachelor regelmatig toegepast.
In onderstaand overzicht staan de onderwerpen met hun Engelse term aangegeven (o.a. vanwege het Engelstalige cursusboek), maar de cursus wordt in het Nederlands gegeven.
Periode 1
Periode 2
The Analysis of Biological Data. Whitlock and Schluter, 2nd edition, 2015. LET OP: dit mag NIET de 1st edition zijn! ISBN: 978 13 1915 4219
Handleiding R (3 delen). Alleen digitaal beschikbaar.
Laptop met als besturingssysteem Windows (Vista, 7, 8 of 10) of Mac OS X (Mavericks of latere release).
LET OP: Draag zorg voor een laptop met voldoende rekenkracht. Check daartoe de processor van je laptop: Intel Core i3, Core i5 en Core i7 processoren zijn prima; Intel Atom, Celeron, Pentium of Core M processoren zijn te traag. Zorg verder dat je voldoende bekend bent met je besturingssysteem om je laptop onder normale omstandigheden te kunnen bedienen.
Voor Windows machines: (bij voorkeur de Engelstalige) Excel uit Microsoft Office 2016 of 365.
Voor Mac's: (bij voorkeur de Engelstalige) Excel uit Microsoft Office 2016 of 365. LET OP: eerdere en/of Nederlandstalige versies van Excel zijn toegestaan maar Excel wordt uitgelegd en voorgedaan a.h.v. de Engelstalige versie uit Microsoft Office 2016/365. Zorg dat de Excel-applicatie op je laptop staat voordat de cursus begint.
CRANE R 3.6.1 of een recentere release (bij oudere besturingssystemen kan het zijn dat je een oudere release moet gebruiken). Je hoeft deze applicatie niet thuis al te downloaden: we doen dat gezamenlijk tijdens de cursus.
RStudio 1.2.1335 of recentere release (bij oudere besturingssystemen kan het zijn dat je een oudere release moet gebruiken). Je hoeft deze applicatie niet thuis al te downloaden: we doen dat gezamenlijk tijdens de cursus.
Tijdens de hoorcolleges bespreekt de docent de stof uit het boek, vaak vanuit een wat andere invalshoek en met andere voorbeelden. Tijdens de werkcolleges oefenen studenten om de behandelde stof toe te passen a.h.v. opgaven uit het boek en oude tentamenopgaven. Tijdens de laptopcolleges leren studenten werken met (Microsoft) Excel en (CRANE) R. Dit doen ze op hun eigen laptop.
|
Activiteit |
Uren |
|
|
Hoorcollege |
25 |
|
|
Laptopcollege |
26 |
|
|
Theorietoets |
3 |
|
|
Werkcollege |
24 |
|
|
Zelfstudie |
88 |
|
|
Practicumtoets |
2 |
|
|
Totaal |
168 |
(6 EC x 28 uur) |
Merk op dat er 88 uur zelfstudie deel uitmaakt van de cursus. Dat is ongeveer de helft van de studielast.
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Als je een werkcollege of laptopcollege niet kunt bijwonen, dien je dat mondeling of via het cursus e-mailadres te melden VOORDAT het betreffende werkcollege of laptopcollege plaatsvindt.
De consequenties van absent zijn is dat (a) bij een onderdeel waarbij normaalgesproken geen opgaven hoeven worden ingeleverd (laptopcolleges), dat nu wel moet gebeuren, en dat (b) bij een onderdeel waarbij normaalgesproken opgaven kunnen worden ingeleverd voor een deelcijfer (werkcolleges), deze opgaven niet meer het maximale aantal punten kunnen opleveren met als gevolg dat niet meer het maximale deelcijfer kan worden bereikt voor dit onderdeel – en dat men voor de cursus dus niet meer het eindcijfer 10.0 kan behalen.
De absentieregeling staat in detail beschreven op Canvas op de pagina's "Wat te doen bij absentie?" en "Beoordeling".
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer | |
|
Digitale Toets | |
|
ingeleverde antwoorden huiswerk en werkcolleges | |
|
eerste practicumtoets | |
|
tweede practicumtoets |
Zie de slides van het introductiecollege en de informatie op Canvas voor de precieze berekening van het eindcijfer uit de vier onderdelen. (Essentie: digitale toets (dat is de theorietoets) 80%, de andere drie onderdelen samen 20%.)
De antwoorden op de tentamenvragen komen daags na het tentamen op Canvas.
Vanaf dat de (deel)cijfers bekend zijn gemaakt, kunnen studenten ook desgewenst hun antwoordformulier inzien.
Ook het bespreken van het tentamen behoort tot de mogelijkheden.
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
| Weeknummer | Onderwerpen | Studiestof |
| 1 | ||
| 2 | ||
| 3 | ||
| 4 | ||
| 5 | ||
| 6 | ||
| 7 | ||
| 8 | ||
| 9 | ||
| 10 | ||
| 11 | ||
| 12 | ||
| 13 | ||
| 14 | ||
| 15 | ||
| 16 |
Zie hiervoor de uitgebreide informatie op Canvas.
Wellicht zinnig om nu vast te weten: voor de cursusonderdelen in eerste week hoef je niets voor te bereiden. Zorg alleen dat je je boek en je laptop bij je hebt, en dat Microsoft Excel op je laptop geïnstalleerd is (zie Studiemateriaal, Software).
Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.
VOERTAAL: NEDERLANDS
De cursus wordt gegeven in het Nederlands, maar vanwege het Engelstalige cursusboek en omdat de wetenschappelijke voertaal doorgaans Engels is, worden in de hoor- en werkcolleges karakteristieke statistiektermen in het Engels gebezigd.
MEER CURSUSINFO OP CANVAS
Vanaf de eerste cursusdag is er een Canvas-omgeving beschikbaar die gedurende de gehele cursus up-to-date zal worden gehouden. Deze omgeving bevat nuttige informatie over rooster, huiswerk-, werkcollege- en laptopcollege-opgaven, powerpoint-slides van de hoorcolleges, video-opnames van de hoorcolleges, overzicht van de tentamenstof, en meer.
De informatie op Canvas is identiek met of uitgebreider dan de informatie in deze studiewijzer.
De studiewijzer is hoofdzakelijk bedoeld om een indruk te krijgen van de cursus voordat deze van start gaat. Daarna is de Canvas-omgeving de aangewezen plek voor informatie. Tijdens het introductiecollege zal het gebruik van Canvas worden toegelicht.
Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van eerdere vakevaluaties.
Naar aanleiding van de vakevaluatie uit 2017-2018 is (al in 2018-2019) het jarenlang gehanteerde 'strafsysteem' (wie te weinig aanwezig was bij de verplichte cursusonderdelen werd uitgesloten van het tentamen), vervangen door een 'beloningsysteem' waarbij ingeleverd huiswerk een deel van het eindcijfer kan opleveren.
Naar aanleiding van opmerkingen van collega-docenten over de tekortschietende Excelkennis bij eerstejaars biologen, is dit jaar (2019-2020) het aantal laptopcolleges Excel uitgebreid van 1 naar 2.
De assistenten van de cursus uit 2018-2019 zijn spontaan begonnen met het nakijken van en feedback geven op ingeleverd huiswerk, en vanwege de waardering die dat bij de studenten oogstte, is het nakijken van en feedback geven op ingeleverd huiswerk dit jaar (2019-2020) tot vaste taak van de assistenten gemaakt.
Zolang de cursus nog niet gestart is, kunnen studenten communiceren met de coördinator.
Als de cursus eenmaal loopt (dat is vanaf 3 september 2019) wordt de studenten verzocht in principe alleen nog te communiceren met de hoofdassistent. Daartoe kan gebruik gemaakt worden van het cursus e-mailadres 5042DAVA@gmail.com.
Indien er door plotselinge overmacht moet worden afgeweken van het persoonlijke rooster, is het van belang dit tijdig aan de hoofdassistent door te geven.
Stuur geen inhoudelijke vragen (vragen over de stof) naar de coördinator of de hoofdassistent. Met dergelijke vragen kun je terecht op de hoorcolleges, werkcolleges en laptopcolleges.