Microben

Microbes

Studiewijzer 2018/2019

Globale inhoud

De cursus Microben heeft als doel de student een introductie te geven in de microbiologie. Dit is een zeer breed veld en in de hoorcolleges zal de diversiteit en biologie van zowel bacteriën, gisten, schimmels, protozoa als virussen worden behandeld.

Microben spelen een essentiële rol in de natuur en het leven van de mens. Ze zijn belangrijk voor de nutriënten kringloop, het opnemen van voedsel, het bewaren en bewerken van ons voedsel, het beschermen tegen ziekte verwerkers, en zijn belangrijk in de biotechnologie. Maar ze vormen ook één van de grootste bedreigingen voor onze gezondheid en veroorzaken sterfte op een mondiale schaal. In de hoorcolleges komen al deze aspecten aan bod.

Het praktische deel van de cursus heeft drie doelstellingen. Ten eerste wordt een deel van de behandelde theorie geïllustreerd. Ten tweede maakt men kennis met de praktijk van de Veilige Microbiologische Techniek (VMT), en ten derde wordt aandacht besteed aan het experimenteel ontwerp om een hypothese te toetsen en de verkregen data statistisch correct te verwerken, te interpreteren en in een lab journaal te documenteren.

Studiemateriaal

Literatuur

• Bij deze cursus wordt geen gebruik gemaakt van een leerboek. Alle leerstof staat in de PowerPoint presentaties van de hoorcolleges. Deze zullen na de colleges op Canvas geplaatst worden. De presentaties van vorig jaar staan reeds als pdf files op Canvas en kunnen gebruikt worden als voorbereiding op de colleges.

Syllabus

• (Engels talige) practicumhandleiding: (prijs ± €15,-, bij Educational Service Center ) 

Practicummateriaal

• Labjournaal: (prijs ± €9,-, bij Educational Service Center)

Overig

• De PowerPoints van de hoorcolleges zullen op Canvas beschikbaar gemaakt worden.

Leerdoelen

Aan het eind van de cursus begrijpt de student het belang van micro-organismen en virussen en de wisselwerking met de mens door in staat te zijn:
- de algemene structuur-functie relaties bij micro-organismen uit te leggen.
- de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan morfologie en groei van micro-organismen uit te leggen.
- kwantitatief de groei van bacteriën te beschrijven en enkele fysiologische parameters te berekenen.
- de basisprincipes van signaaltransductie bij micro-organismen uit te leggen.
- uit te leggen wat de algemene aspecten zijn van het darm-, huid- en mondflora microbioom.
- de mechanismen van antibiotica en antibiotica-resistentie uit te leggen.
- de rol van micro-organismes te kennen in voedsel verwerking en bederf.
- de basisprincipes van het werken met bacteriën volgens VMT uit te voeren.
- een hypothese te vormen en te testen middels een experiment.
- eigen data te verwerken, resultaten te interpreteren en deze weer te geven in het labjournaal.

Onderwijsvormen

• Hoorcollege
• (Computer)practicum
• Highlightcolleges
• Veldwerk/excursie

Hoorcolleges:

In deze cursus wordt het onderwijs gegeven in hoorcolleges. De hoorcolleges (powerpoint slides) bepalen de tentamen stof. Er wordt geen gebruik gemaakt van een leerboek en het is daarom belangrijk om de hoorcolleges goed te volgen. PDFs van de hoorcolleges van vorig jaar zijn op Canvas beschikbaar. Deze kunnen gebruikt worden om een indruk te krijgen van de aankomende hoorcolleges. Let wel, de hoorcolleges zijn onderhevig aan aanpassingen en zullen verschillen met die van het vorige jaar. De powerpoint slides van de hoorcolleges worden na afloop op Canvas geplaatst. Er zullen ook opnames van de hoorcolleges gemaakt worden maar dit loopt niet altijd goed en biedt dus geen garanties. Tenslotte, de docenten zullen in hun college een lijst met keywords geven die als leidraad dient voor de tentamenstof.

Practica:

Studenten werken in koppels. De practicumhandleiding is in het Engels en het verslag/labjournaal wordt in het Engels geschreven. Het verslag/labjournaal zal niet worden beoordeeld op de kwaliteit van het Engels. Een rondleiding in Micropia (Artis) zal een verplicht onderdeel van het practicum zijn en wordt getoetst in het tentamen.

Computerpracticum:

Ter ondersteuning van de practicum rapportage.

Verdeling leeractiviteiten

Academische vaardigheden

Bij het practicum wordt de academische houding getoetst. In de practicumhandleiding vind je de behoordelingscriteria. Bij het schrijven van het labjournaal wordt ook gekeken naar de verwerking van de onderdelen van de empirische cyclus en de formulering van je tekst. In de practicumhandleiding vind je de beoordelingscriteria.

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Deelname aan alle practica computerpractica veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht en de student dient zich op deze bijeenkomsten terdege voor te bereiden.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanwezigheid bij de hoorcolleges is in principe verplicht. Voor de practica geldt een strikte aanwezigheidsplicht (zie details in de practicumhandleiding). De cursus naar Micropia valt onder het practicum. Voldoe je hier niet aan, dan kun je het practicum en dus het vak niet meer halen. Bij zwaarwegende redenen dien je voorafgaand aan het practicum de practicumcoördinator, met argumenten, hiervan op de hoogte te stellen.

Toetsing

Tijdens de cursus wordt de theorie na 4 weken schriftelijk getoetst. De toets zal de vorm van vierkeuzevragen hebben.

Inzage toetsing

Om een inzagemoment aan te vragen, kun je contact opnemen met de coördinator.

Opdrachten

Practicumopdracht

• Nauwkeurig uitvoeren van experimenten

Practicumopdracht

• Beantwoorden van vragen bij de experimenten

Practicumopdracht

• Bijhouden van een labjournaal

Cursus Micropia

• kennis wordt getoetst op tentamen (2 vragen)

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Honoursinformatie

Niet van toepassing.

Aanvullende informatie

Verdere informatie staat op Canvas.

Verwerking vakevaluaties

Naar aanleiding van de feedback van studenten zal dit jaar geen gebruik gemaakt worden van een studieboek. Volgens de studenten was alle informatie duidelijk uitgelegd en terug te vinden in de PowerPoint slides van de colleges. Studenten vonden de studielast te zwaar. Daarom zijn de 4 uur immunologie colleges komen te vervallen. 

Contactinformatie

Coördinator

• prof. dr. L.W. Hamoen

Prof. Dr. Leendert Hamoen

kamer C3.111

Science Park 904

1098 XH Amsterdam

Netherlands

Tel: 0031-205252193

Email: l.w.hamoen@uva.nl