Studiewijzer 2018/2019
Globale inhoud
Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 2
De vakken Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 1 & 2 worden als een lint gegeven gedurende periode 1, 2, 3 en 4. Binnen deze twee vakken zijn het wiskunde onderdeel en het statistiek onderdeel niet onderling compenseerbaar. Voor zowel het wiskunde onderdeel als het statistiek onderdeel geldt dat er een doorlopende opbouw in de vakken Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 1 & 2 zit. Om deze leerlijn en de uiteindelijke leerdoelen duidelijk te maken worden hieronder voor ieder onderdeel eerst de algemene leerdoelen geformuleerd. Daarna wordt kort aangegeven welke onderdelen van deze algemene leerdoelen worden gegeven in het vak Basis Statistiek en Wiskunde in Biomedische Wetenschappen 2
Studiemateriaal
Literatuur
- The Analysis of Biological Data. Whitlock and Schluter, 2nd edition, 2015. ISBN-10: 1-936221-48-9; ISBN-13: 978-1-936221-48-6; LET OP:dit mag NIET de 1st edition zijn!
- Introductory statistics with R. Springer, 2nd edition, 2008, e-ISBN: 978-0-387-79054-1; LET OP: Niet kopen, dit boek is vrij beschikbaar binnen het uva domein (https://link.springer.com/content/pdf/10.1007%2F978-0-387-79054-1.pdf)
Practicummateriaal
Software
Leerdoelen
Statistiek
Tijdens dit vak wordt geleerd hoe biomedische data die op verschillende manieren is verzameld correct wordt gerepresenteerd en er wordt een begin gemaakt met het statistisch analyseren van verschillende typen biomedische data. Na afloop van dit cursusonderdeel kan de student:
- Data te organiseren in excel en R
- Basale parametrische en non-parametrische statistische methoden zoals de chi-kwadraattoets, t-test, ANOVA, of een Kruskal-Wallis test topassen op empirisch verkregen data.
- Correlatieanalyse uitvoeren
- Lineaire, kwadratische en logistische regressie uitvoeren
- Multivariate regressie uitvoeren
- Survival analyse uitvoeren
- Permutatie testen, bootstrapping en likelyhood gebruiken in statistische analyses.
- Resultaten van statistische analyses correct rapporteren.
Wiskunde
De doelstellingen van deze inleidende cursus wiskunde zijn de volgende: Aan het einde van de cursus kan de student
- basiswiskunde kennis en vaardigheden toepassen om elementaire vraagstukken wiskundig te modelleren, te simuleren en te analyseren;
- wiskundige voorstellingen hanteren om problemen in herkenbare contexten en in situaties zoals die later in de studie aan de orde komen te beschrijven en te analyseren;
- fundamentele wiskundige begrippen en technieken eigen te maken en te hanteren uit het gebied dat ook wel bekend staat onder naam Dynamische Systemen of meer specifiek als Systeembiologie.
- wiskundeteksten op basisniveau lezen en de betekenis van de meeste formules in de literatuur begrijpen.
- werken met R bij wiskundige vraagstukken
De leerdoelen worden behandeld in de volgende vakinhoud:
- Groeimodellen (begrensde exponentiële groei, logistische groei)
- Inleiding differentiaalvergelijkingen en compartimentmodellen
- Reactiekinetiek en farmacokinetiek
- Inleiding tot dynamische systemen voor eiwitten
Onderwijsvormen
- Hoorcollege
- Laptopcollege
- Zelfstudie
Verdeling leeractiviteiten
|
Activiteit
|
Uren
|
|
Digitale Toets
|
3
|
|
Hoorcollege
|
22
|
|
Laptopcollege
|
32
|
|
Vragenuur
|
2
|
|
Werkcollege
|
0
|
|
Zelfstudie
|
53
|
|
Totaal
|
112
|
(4 EC x 28 uur)
|
Academische vaardigheden
Empirische cyclus
- De student leer onderzoeksvragen om te zetten in toetsbare hypotheses
- De student leer hoe onderzoeksresultaten statistisch worden getoetst en welke conclusies aan deze toetsing kunnen worden verbonden.
Aanwezigheid
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
-
Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.
Aanvullende eisen voor dit vak:
- Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.
Toetsing
| Onderdeel en weging
|
Details
|
|
| |
|
| |
Fraude en plagiaat
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
Weekplanning
| Weeknummer | Onderwerpen | Studiestof |
| 1 | | |
| 2 | | |
| 3 | | |
| 4 | | |
| 5 | | |
| 6 | | |
| 7 | | |
| 8 | | |
| 9 | | |
| 10 | | |
| 11 | | |
| 12 | | |
Rooster
Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.
Verwerking vakevaluaties
Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.
Coördinator