Cellulaire Fysiologie Practicum

Cellular Physiology Practical

6 EC

Semester 1, periode 3

5042CEFP6Y

Eigenaar Bachelor Biologie
Coördinator dr. T. Munnik
Onderdeel van Minor Moleculaire en Cellulaire Biologie, jaar 1Bachelor Biologie, jaar 2Bachelor Bèta-gamma, major Biologie, jaar 3Bachelor Future Planet Studies, major Biologie, jaar 3

Studiewijzer 2018/2019

Globale inhoud

Centraal in deze cursus staan 'Stress en Acclimatisatie (Adaptatie)'. De moleculaire mechanismes hierachter zijn vaak universeel, en cruciaal voor het leven van planten, dieren en micro-organismen. Er zal worden gewerkt met twee wetenschappelijke modelsystemen: de gist Saccharomyces cerevisae (bakkers gist) en de modelplant Arabidopsis thaliana (zandraket). Het prakticum is er op gericht om fysiologische verschillen op moleculair- en cellulair niveau zichtbaar te maken en te kwantificeren, en om met de belangrijkste basis technieken bekend te geraken. Aan bod zullen komen o.a. DNA- en eiwit extracties, PCR, restrictie-analyse, eiwit bepaling, SDS-PAGE, Western blot analyse, gen expressie (GUS, GFP), knock-out en over-expressie mutanten, fysiologische groei- en stress tolerantie assays, en fluorescentie microscopie/spectroscopie.

Studiemateriaal

Literatuur

  • Molecular Biology of the Cell, Alberts, verplicht naslagwerk.

Practicummateriaal

  • Practicumklapper; aan te schaffen online tenminste één week voor aanvang van de cursus tegen kostprijs (ca. 8,- euro).

  • Laboratoriumjas verplicht!

Overig

  • Aanvullend materiaal zal via Blackboard worden aangeboden.

Leerdoelen

Dit is een praktische cursus die er op is gericht een breder inzicht te verschaffen in de moleculaire en cellulaire biologie. Specifieke leerdoelen hierin zijn:

Leerdoel 1 Kennis en Begrip
De moleculaire en celbiologische technieken uit deze cursus kunnen beschrijven en uitleggen. 
Leerdoel 2 Toepassing
De technieken kunnen uitvoeren en interpreteren.
Leerdoel 3 Analytisch
Kunnen aangeven of bedenken voor welke andere onderzoeksdoelen een bepaalde techniek gebruikt kan worden. De relaties tussen technieken kunnen zien.
Leerdoel 4 Synthese
Met behulp van de geleerde technieken en kennis een onderzoeksplan kunnen ontwerpen en een verslag kunnen schrijven.


Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • Werkcollege
  • Zelfstudie
  • Zelfstandig werken aan bijv. project/scriptie
  • (Computer)practicum
  • Begeleiding/feedbackmoment
Inleiding/college18 uur
Practicum90 uur
Verslag30 uur
Extra studietijd22 uur
Totaal160 uur

Met het practicum zullen studenten in 3 groepen van ca. 2-3 personen werken onder begeleiding van een aio, analist of post-doc.

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Aantal uur

Hoorcollege

18

Practicum

90

Verslag

30

Extra studietijd

30

Totaal 6EC * 28

168

Academische vaardigheden

Extra lessen in English Writing zullen worden verzorgd (3 werkcolleges).

Het verslag van dit practicum zal in het Engels geschreven dienen te worden.

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan (computer)practica, veldwerk en werkcolleges is in principe verplicht. Eventueel aanvullende eisen worden per onderdeel in de studiewijzer omschreven. Hier staat ook beschreven wat de eventuele consequenties zijn van het niet nakomen van deze verplichting.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Deelname aan de practica is verplicht. Aanwezigheid bij de twee inleidende hoorcolleges wordt sterk aangeraden aangezien deze de lading dekt voor de 3 weken practicum.

Toetsing

Onderdeel en weging Details

Eindcijfer

50%

Indrukcijfer

50%

Verslag

Toetsing geschied op basis van 'inzet practicum' (indrukcijfer, 50%) en verslagcijfer (50%). Beide dienen hoger dan een 5.0 te zijn en tezamen dient gemiddeld hoger dan 5.5 te zijn.

Wie te laat (of geen) verslag inlevert, slaagt niet. Er is geen herkansing. 

Waneer er een voldoende (>5.5) is behaald voor het practische gedeelte (indrukcijfer), dan kan men het jaar erop in aanmerking komen voor een vervangende schrijfopdracht. Dit zal een verslag worden van een literatuuronderzoek van een actueel onderzoeksonderwerp in de abiotische stress.

Verslagen moeten in het Engels worden geschreven

Inzage toetsing

Om een inzagemoment aan te vragen, kun je contact opnemen met je begeleider.

Opdrachten

Verslag

  • Aan het einde van het practicum zal er een verslag moeten worden ingeleverd. Verslagen in het Engels verdienen een bonus.

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Weeknummer Onderwerpen Studiestof
1
2
3
4

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Aanvullende informatie

  • Available on Blackboard
  • Extra course of English writing included
  • Report is written in English

Verwerking vakevaluaties

Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.

Contactinformatie

Coördinator

  • dr. T. Munnik

Docenten

  • J. Chouaref MSc
  • P. van Egmond
  • M.J. van Hooren MSc
  • Ruy Kortbeek MSc
  • R.A. Korver MSc
  • drs. H.M.H. de Leeuw
  • dr. Gertien Smits
  • ing. R. van Wijk

Docenten

  • P. van Egmond
  • M.J. van Hooren MSc
  • B. Kim MSc
  • drs. H.M.H. de Leeuw
  • dr. Gertien Smits
  • ing. R. van Wijk