The Cell
6 EC
Semester 1, periode 1
5052CELX6Y
| Eigenaar | Bachelor Biomedische wetenschappen |
| Coördinator | dr. Rob Dekker |
| Onderdeel van | Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1 |
In deze cursus zullen de belangrijkste moleculen, structuren en processen in de cel worden behandeld uitgaande van de meest essentiële chemische en biologische principes. Dit betreft de organisatie van genetische informatie, biomoleculen en hun functie, celcyclus en celdood, transcriptie, translatie en energiemanagement van de cel.
Bovendien zal op basis van deze inzichten uitgelegd worden hoe cellen zullen zich kunnen gedragen in de context van andere cellen, organismen en ziekten. Hierbij zal de nadruk liggen op cellulaire communicatie, moleculaire mechanismen van evolutie, celtypen en hun functie, de ontwikkeling van kanker, goede en slechte micro-organismen en het afweersysteem.
Als laatste zal de student door middel van een practicum in deze cursus geleerd worden om basale cellulaire/moleculaire laboratoriumhandelingen zelfstandig, veilig en verantwoord uit te voeren.
Essential Cell Biology (4th edition) Alberts, Bruce ISBN 9780815344551
Molecular Biology of the Cell (6th edition) Alberts, Bruce ISBN 9780815344643. Dit boek wordt gebruikt voor meerdere cursussen in de bachelorstudie.
Syllabus 'De Cel' (5052CELX6Y)
Witte laboratoriumjas (verplicht voor het practicum in alle cursussen)
Practicumhandleiding 'De Cel' (5052CELX6Y)
Goed tekenpotlood (zwart)
Liniaal
Rekenmachine
Laptop
Om dit vak te kunnen volgen zijn een drietal verplichte artikelen nodig. Dit betreft het syllabi pakket Bio-medische Wetenschappen, een laboratoriumjas en een snijset. Deze zaken kunnen, indien lid van de studievereniging Congo, tegen een gereduceerd tarief in een webshop besteld worden (http://webshop.medicalwerff.nl/congo/index.php). Het syllabi pakket wordt bij de start van het eerste vak uitgereikt, maar dient wel vooraf besteld en betaald te zijn.
Uitgaande van de geleerde biologische concepten in de voorgaande cursus Inleiding Biomedische wetenschappen (5052INBW3Y), te weten:
...begrijpt de student aan het eind van deze cursus de belangrijkste moleculen, structuren en processen in de cel uitgaande van de meest essentiële chemische en biologische principes. Dit betreft:
Bovendien begrijpt de student op basis van deze inzichten hoe cellen zich kunnen gedragen in de context van andere cellen, organismen en ziekten, met een focus op:
Als laatste zal de student na het practicum in deze cursus in staat zijn om basale cellulaire/moleculaire laboratoriumhandelingen zelfstandig, veilig en verantwoord te kunnen uitvoeren.
In deze cursus wordt gebruik gemaakt van Just-in-Time Teaching (JiTT). Hierbij bereidt de student zich in een werkcollege in kleine groepjes (2-5 studenten) voor op het daaropvolgende JiTT college. Dit gebeurt door het lezen van de in de leeswijzer opgegeven stof en het maken van hierop aansluitende opdrachten. Vragen die ontstaan tijdens de voorbereiding kunnen op Blackboard worden ingediend en zullen worden behandeld tijdens het JiTT college. De student sluit de voorbereiding af met het maken van een korte JiTT test die bestaat uit oefententamenvragen. Tijdens het JiTT college wordt de stof kort in de juiste context geplaatst en worden de opdrachten die gemaakt zijn in de voorbereiding, evenals de ingediende vragen, doorgesproken. Hierna worden in groepsverband tijdens een interactieve peer instruction sessie nieuwe vragen gemaakt die direct door de docent worden behandeld en verder toegelicht. Het JiTT college, en daarmee de dag, wordt afgesloten met een korte samenvatting van de stof. De cursus bestaat uit totaal 10 JiTT dagen die ieder een afgebakend onderwerp behandelen (zie weekplanning hieronder).
Naast de JiTT colleges worden er twee zogenaamde highlight colleges gegeven met als thema baanbrekende technologische ontwikkelingen in de genomics en microscopie.
Op twee donderdagen worden er research challenges georganiseerd waar in teamverband onder begeleiding van een docent aan een uitdagend onderzoeksonderwerp wordt gewerkt. Deelname is beperkt tot 40 studenten per keer.
Tijdens het practicum wordt d.m.v. vier experimenten de basis gelegd voor het uitvoeren van enkele belangrijke basale labaratoriumhandelingen. Er wordt een start gemaakt met het format waarin wetenschappelijk onderzoek wordt gerapporteerd (labjournaal en practicumverslag). De gehele rapportage wordt per practicumonderdeel beoordeeld en voorzien van feedback.
|
Activiteit |
Aantal uur |
|
JiTT college |
30 |
|
Hoorcollege |
12 |
|
Werkcollege |
20 |
|
Zelfstudie |
70 |
|
Practicum |
16 |
|
Tentamen |
3 |
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
De werkcolleges en het practicum zijn verplicht. Er wordt een presentielijst bijgehouden door de docent. Mocht je door overmacht niet in staat zijn om bij één van deze onderdelen aanwezig te zijn, meld dit dan vooraf naar de volgende e-mailadressen:
Werkcolleges: de-cel-fnwi@uva.nl
Practicum: practicum-de-cel-fnwi@uva.nl
De consequentie van het missen van een werkcollege of practicumdeel wordt in overleg met de vakcoördinator bepaald.
Afwezigheid zonder geldige reden of zonder afmelding kan tot uitsluiting van het vak leiden. Ook bij te laat komen voldoe je niet aan de aanwezigheidsplicht. Bij uitsluiting van het vak wordt er geen eindcijfer geregistreerd.
De JiTT college's zijn niet verplicht, maar deelname wordt sterk aangeraden.
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer | |
|
9 (90%) Tentamen | Moet ≥ 5 zijn, Herkansbaar |
|
1 (10%) Practicum | Moet ≥ 5 zijn |
|
3 (30%) Theorie, technische vaardigheden, inzicht & veiligheid | |
|
2 (20%) Samenwerking, zelfstandigheid & werkhouding | |
|
2 (20%) Labjournaal | |
|
3 (30%) Practicumverslag |
Het tentamen bestaat uit meerkeuzevragen en wordt afgenomen over de gehele stof die tijdens De Cel aan bod is gekomen, zoals weergegeven in de studiewijzer.
Naast een pen zijn er geen verdere toegestane hulpmiddelen.
Labjournaals en verslagen die niet voor de in de practicumhandleiding vermelde deadlines zijn ingeleverd worden nog wel beoordeeld maar kunnen ten hoogste nog 3 van de 5 punten scoren.
Voorafgaand aan ieder JiTT college worden in kleine groepen opdrachten gemaakt die op Blackboard te vinden zijn. Vragen over de stof kunnen op Blackboard worden ingediend. Dit telt niet mee voor het eindcijfer.
Voorafgaand aan ieder JiTT college worden op Blackboard JiTT vragen (digitale toets) gemaakt die een afspiegeling zijn van tentamenvragen. Knelpunten bij de vragen worden kort behandeld in het JiTT college. Dit telt niet mee voor het eindcijfer.
Tijdens het interactief JiTT college worden vragen gemaakt in groepsverband. De antwoorden worden gegeven m.b.v. een voting systeem (stemkastjes en/of mobiele telefoon). Feedback vindt plaats door onderling overleg met studenten en docent. Dit telt niet mee voor het eindcijfer.
Voorafgaand aan en tijdens het practicum worden vragen uit de practicumhandleiding beantwoord. Hoewel de kwaliteit van de antwoorden niet meetelt voor het eindcijfer, weegt de inzet bij het maken ervan wel mee in het eindcijfer voor het practicum.
Voor ieder experiment moet een labjournaal worden bijgehouden in de practicumhandleiding. Deze dient na afloop van het practicumonderdeel te worden ingeleverd bij de assistent. Per practicumonderdeel wordt het labjournaal van feedback voorzien door de assistent. De beoordeling ervan telt mee voor het practicumcijfer.
Voor ieder experiment moet een practicumverslag worden gemaakt. Dit dient binnen 24 uur na afloop van het practicumonderdeel te worden ingeleverd op Blackboard. Per practicumonderdeel wordt het verslag van feedback voorzien door de assistent. De beoordeling ervan telt mee voor het practicumcijfer.
Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat
| Week | Onderwerp | Inhoud |
| 1 | JiTT 1 | Biomolecules | DNA, RNA, proteins, fats, lipids, polysaccharides and glycogen |
| 1 | JiTT 2 | Cell cycle | Cell cycle order, mitosis, DNA replication, apoptosis, DNA damage and repair |
| 2 | JiTT 3 | Transcription | Production, processing, degradation and regulation of RNA |
| 2 | JiTT 4 | Translation | Production, degradation and regulation of proteins |
| 3 | JiTT 5 | Energy management | Energy carriers, glycolysis, citric acid cycle, oxidative phosphorylation, glycogen and fat |
| 3 | JiTT 6 | Cell signaling | General principles, intracellular signaling and extracellular signaling |
| 4 | JiTT 7 | Evolution | Mutation, recombination, transposition and meiosis |
| 4 | JiTT 8 | Tissue types | Epithelium, connective tissue, muscular tissue, nervous tissue and stem cells |
| 5 | JiTT 9 | Microbiome | Bacteria, fungi, protozoa, viruses, skin, gastrointestinal, innate/adaptive immune system |
| 5 | JiTT 10 | Cancer | Types of cancer, microevolution, (proto)oncogenes, prevention and treatment |
Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.
Aanbevolen voorkennis: middelbare school wiskunde, scheikunde en biologie.
Neem uitsluitend contact op via onderstaande mailadressen. E-mails naar andere adressen kunnen helaas NIET worden beantwoord.
Voor algemene vragen over theoriedeel (JiTT): de-cel-fnwi@uva.nl
Voor vragen over het practicum en ziekmeldingen: practicum-de-cel-fnwi@uva.nl