Microbes and Man
4 EC
Semester 1, periode 3
5502MIME4Y
| Eigenaar | Biologie/bio-medisch (algemeen) |
| Coördinator | prof. dr. L.W. Hamoen |
| Onderdeel van | Bachelor Biologie, jaar 1Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1 |
De cursus Microben en de Mens heeft als doel de student een introductie te geven in de microbiologie. Dit is een breed veld en in de hoorcolleges zal de diversiteit en biologie van bacteriën, gisten, schimmels, protozoa en virussen worden behandeld.
Microben spelen een essentiële rol in de natuur en het leven van de mens. Ze zijn belangrijk voor de nutriënten kringloop in de natuur, het opnemen van voedsel, het bewaren en bewerken van ons voedsel, het beschermen tegen ziekte verwerkers, maar ze vormen ook één van de grootste bedreigingen voor onze gezondheid en veroorzaken sterfte op een mondiale schaal. In de hoorcolleges komen al deze aspecten aan bod en wordt er dieper ingegaan op de interactie tussen de mens en microben.
Dat de mens niet ziek wordt van microben is vooral te danken aan het immuun systeem, en in de cursus zal het immuun systeem ook behandeld worden.
Het praktische deel van de cursus heeft drie doelstellingen. Ten eerste wordt een deel van de behandelde theorie geïllustreerd. Ten tweede maakt men kennis met de praktijk van de Veilige Microbiologische Techniek VMY), en ten derde wordt aandacht besteed aan het experimenteel ontwerp om een hypothese te toetsen en de verkregen data statistisch correct te verwerken, te interpreteren en in een lab journaal te documenteren.
De cursus valt binnen de leerlijn Mechanismen van Ziekten van de Mens en sluit aan bij de volgende vakken binnen het curriculum: Van Molecuul tot Cel (jaar 1), Moleculaire Celbiologie (jaar 2), Immunologie (jaar 2), Medische Microbiologie (jaar 3).
Microbiology: An Evolving Science, Joan L. Slonczewski, John W. Foster, Uitgever: Ww Norton &Amp; Co, 3rd International student edition, ISBN10 :0393923215, ~50-60 Euro.
Voor de cursus is aanschaf van het boek (hardcopy of digitaal) essentieel.
Aanvullend kan ook oefenmateriaal aangeschaft worden, dit is facultatief.
(Engels talige) practicumhandleiding: (prijs ± €15,-, bij Educational Service Center )
Labjournaal: (prijs ± €9,-, bij Educational Service Center)
Labjas (verplicht voor het practicum in alle cursussen) (prijs ± €25,-)
PPTs van alle (highlighht)colleges zullen op Blackboard beschikbaar gemaakt worden.
Aan het eind van de cursus begrijpt de student het belang van micro-organismen en virussen en de wisselwerking met de mens door in staat te zijn:
|
Activiteit |
Aantal uur |
|
Hoorcollege |
26 |
|
Practicum |
20 |
|
Computer practicum |
4 |
|
Tentamen |
3 |
|
Zelfstudie |
57 |
|
Totaal 4 x 28 uur |
112 |
Bij het practicum wordt de academische houding getoetst. In de practicumhandleiding vind je de behoordelingscriteria.
Bij het schrijven van het labjournaal wordt ook gekeken naar de verwerking van de onderdelen van de empirische cyclus en de formulering van je tekst. De tekst wordt niet beoordeeld op correct gebruik van de Engelse taal. In de practicumhandleiding vind je de beoordelingscriteria. Bij de cursus Van Molecuul tot Cel en bij Academische Basisvaardigheden zijn de basis(vaardigheden) al aan de orde gekomen.
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Aanwezigheid bij de hoorcolleges wordt sterk aanbevolen.
Voor de practica geldt een strikte aanwezigheidsplicht (zie details in de practicumhandleiding). Voldoe je hier niet aan, dan kun je het practicum en dus het vak niet meer halen.
Bij zwaarwegende redenen dien je voorafgaand aan het practicum de practicumcoördinator, met argumenten, hiervan op de hoogte te stellen.
| Onderdeel en weging | Details | Opmerkingen |
|
Eindcijfer | ||
|
90% Tentamen | Moet ≥ 5.5 zijn, Herkansbaar | |
|
10% Practicum | Moet ≥ 5.5 zijn | Practicum blijft geldig tot einde volgend studiejaar. Onvoldoende practicum kan volgend studiejaar opnieuw worden gevolgd. |
|
1 (33%) Labjournaal | ||
|
1 (33%) Practische Vaardigheden | ||
|
1 (33%) Academische werkhouding |
Tijdens de cursus wordt de theorie na 4 weken schriftelijk getoetst. De toets zal de vorm van vierkeuzevragen hebben.
De manier van inzage wordt via de digitale leeromgeving gecommuniceerd.
Nauwkeurig uitvoeren van experimenten
Beantwoorden van vragen bij de experimenten
Bijhouden van een labjournaal
Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat
Overzicht hoorcolleges en leerstof Slonczewski & Foster:
WEEK 1:
Leendert Hamoen: Introductie bacteriën, archaea & bacteriofagen
Hoofdstuk 1: p 14-17, 22-25
Hoofdstuk 2: p 44-47, 52-53, 57-62, 64-71
Hoofdstuk 3: p 80-81, 90-98, 100, 112-116
Hoofdstuk 4: p 120-124, 134-145, 148, 150-154
Hoofdstuk 5: p 161-162, 164-165, 1691-175, 180-185, 187-188
Hoofdstuk 6: p 201, 208-210, 211-212, 223-224, 228-230
Hoofdstuk 7: p 240-242, 245-248, 250, 256-258
Hoofdstuk 8: p 278-280
Hoofdstuk 9: p 322-327, 329, 331, 333-334, 355-360
Hoofdstuk 10: p 366-368, 370-374, 389-390, 397-398
Hoofdstuk 17: p 682-685
Hoofdstuk 18: p 746-747, 750-751
Hoofdstuk 19: p 758-760, 762, 780, 787-788
Gertien Smits: Introductie gisten en schimmels
Hoofdstuk 1: p 29-32
Hoofdstuk 4: p 123-125
Hoofdstuk 16: p 623-629, 637-641
Hoofdstuk 20: p 797-818
Hoofdstuk 27: p 1142-1143
Appendix 2: p A-24-26, 38-40, 68
Aldert Bart: Introductie protozoa en parasitologie
Hoofdstuk 20: p 797-802, 804-805, p824-827, p827-836
Hoofdstuk 25: p 1005, 1007-1008
Hoofdstuk 26: p 1066, 1072-1073, p1077, 1082, p1092-1093
appendix 4: p A-69-A-70
WEEK 2:
Hans Zaaijer: Introductie virologie
Hoofdstuk 6: p 192-207, 213-225
Hoofdstuk 11: p 417-449
Hoofdstuk 26: p 1089-1090, p 1099-1103
Ester de Jong: Introductie innate immuunsysteem
Hoofdstuk 23: p 935-955
Hoofdstuk 24: p 962-973, 982-992
Marieke van Ham: Introductie immuunrespons
Slonczewski & Foster hoofdstuk 24
Stanley Brul: Introductie voedsel microbiologie en biotechnologie
Hoofdstuk 12: p458-463
Hoofdstuk 16: p625-650. 656-660
WEEK 3
Gerard Muijzer: Introductie microbiële ecologie
Hoofdstuk 21: p 839-876
Hoofdstuk 22: p 889-919
Max Nieuwdorp: Introductie humane microbioom
Hoofdstuk 23: p 925-927, 931-939, 943-946, 949, 952, 954-958
Arie van der Ende: Introductie bacteriële infecties
Hoofdstuk 25: p 1004-1019, 1022-1040
Hoofdstuk 26: p 1083-1087
Bas Zaat: Introductie antibiotica en resistentie
Hoofdstuk 27: p 1111-1133
Hoofdstuk 28: p 1152-1164, 1167-1168, 1171-1176 tot “Bioterrorism”, 1180-1181
Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.
Dit vak heeft een Blackboardsite. Hier vind je de noodzakelijke aanvullende informatie, zoals de groepsindeling van de practica en de opdrachten. Bekijk de Blackboardsite dus met grote regelmaat!