Course manual 2017/2018

Course content

Photosynthesis is the process that sustains virtually all life on Earth. In this process organisms capture and store the energy of the photons in the form of carbohydrates. In this course you will follow all the steps of the photosynthetic process at the molecular level. The course will cover: light-harvesting, excitation energy transfer, electron transport, photophosphorylation and mechanism of carbon dioxide fixation. We will get inspiration by the diversity of the photosynthetic process in different organisms and study the strategies used by them to respond to changes in their environment. The use of photosynthesis for bioenergy production will also be discussed.

Study materials

Literature

  • Robert E. Blankenship, 'Molecular Mechanisms of Photosynthesis', 2nd Edition, April 2014, Wiley-BlackwellISBN: 978-1-4051-8976-7. Ca. 56 Euro.

Objectives

  • To understand the principle of sunlight to energy conversion in nature
  • To apply concepts of physics and physical chemistry conceptually learned in  other courses
  • To become familiar with the physical, chemical and biological concepts that are on the basis of photosynthesis
  • To learn how to integrate concepts from physics, chemistry, and biology
  • To be able to understand and discuss scientific literature based on multidisciplinary approaches
  • To use these concepts for biofuel production.

Teaching methods

  • Hoorcollege
  • Werkcollege
  • literatuurbespreking
  • Begeleiding/feedbackmoment
  • Zelfstandig werken aan bijv. project/scriptie
  • Zelfstudie

Learning activities

Activiteit

Aantal uur

Hoorcollege

28

Tentamen

3

Werkcollege

24

Zelfstudie

112

Attendance

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Van elke student wordt actieve deelname verwacht aan het onderwijsonderdeel waarvoor hij staat ingeschreven. Een student die de eerste twee werkcolleges van een lesblok geen gebruik maakt van de werkcolleges, zal administratief uit de werkcollegegroep verwijderd worden. Een verzoek opnieuw ingeschreven te worden bij de werkcolleges kan ingediend worden bij de opleidingscoördinator.
  • Als een student door overmacht niet aanwezig kan zijn bij een verplicht onderdeel van het onderdeel, dient hij dit zo snel mogelijk schriftelijk te melden bij de betreffende docent. De docent kan, eventueel na overleg met de studieadviseur, besluiten om de student een vervangende opdracht op te leggen.
  • Het is niet toegestaan om verplichte onderdelen van een onderdeel te missen als er geen sprake is van overmacht.
  • Bij kwalitatief of kwantitatief onvoldoende deelname, kan de examinator de student uitsluiten van verdere deelname aan het onderdeel of een gedeelte daarvan. Voorwaarden voor voldoende deelname worden van te voren vastgelegd in de studiewijzer.
  • Ter uitbreiding van de bovenstaande regels geldt in het eerste semester van het eerste jaar dat een student bij minimaal 80% van de werkcolleges aanwezig dient te zijn. Bovendien moet worden deelgenomen aan eventuele tussentoetsen en verplicht gesteld huiswerk. Als niet aan deze verplichting is voldaan, wordt de student uitgesloten voor de herkansing van het bijbehorende vak. Studenten in het Dubbele Bachelor programma Wis- en Natuurkunde zijn vrijgesteld van deze plicht.

Assessment

Item and weight Details

Final grade

0.75 (75%)

Tentamen

0.25 (25%)

Assignments

Inspection of assessed work

For the assignments, I write to each student individually sending the assignment with my comments and the grade

Assignments

1

  • Paper 1

2

  • Paper 2

3

  • paper 3

4

  • Report - improving photosynthesis

 

 all the assignments have to be made individually

Fraud and plagiarism

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat

Course structure

Weeknummer Onderwerpen Studiestof
1  Introduction  chapter 1-2
2 History  chapter 3
3  Pigments/Antenna  chapter 4/5
4  Antennas  chapter 5
5  electron transfer  chapter 6-7
6  ATP/dark reactions  chapter 8-9
7  Fluorescence/ evolution  chapter 11-12
8    

Timetable

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Contact information

Coördinator

  • R. Croce