Medische Microbiologie

Medical Microbiology

Studiewijzer 2017/2018

Globale inhoud

Colleges Bacteriologie:

• Inleiding Bacteriologie
• Microbiële diagnostiek
• Neisseria meningitidis, epidemiologie
• Vaccins
• Bloedbaan infecties, sepsis
• Endocarditis en innate defense
• Urineweg infecties
• SOA's en Zoönoses
• Darminfecties
• Luchtweginfecties

Practicum Bacteriologie:

• Resistentie tegen antimicrobiele middelen, overdracht van resistentie
• Antimicrobiële biomaterialen
• Analyse van bacteriele membraaneiwitten
• Buitenmembraaneiwitten, beschermende antistoffen en vaccinontwikkeling

Colleges Parasitologie:

• Malaria cyclus, epidemiologie, pathogenese en behandeling
• Malaria diagnostiek: microscopie, antigeentests en DNA detectie
• Darmparasieten: Protozoa
• Darmparasieten: Helminthen

Practicum Parasitologie:

• Malaria diagnostiek

Colleges Virologie:

• Inleiding Virologie
• Virus entry en exit
• Arbo virussen
• Hepatitis C virus (HCV)
• Human Immunodeficiency virus (HIV)
• Picornavirussen
• Morbillivirussen
• Rhabdovirussen
• Herpesvirussen
• Humaan Papillomavirus (HPV)
• Rota- en Norovirussen

Studiemateriaal

Syllabus

• Practicumhandleiding wordt door de cursusleiding verstrekt. Hiervoor wordt een geringe vergoeding gevraagd.

Practicummateriaal

• Laboratoriumjas en labjournaal dienen door de studenten zelf meegebracht te worden.

Leerdoelen

• Theorie
  De student kan de volgende concepten herkennen en beschrijven, en er constructief over redeneren: verschillende soorten infectieziekten en bacteriën, virussen en parasieten,die deze ziekten veroorzaken, traditionele en moderne diagnostiek, mechanismen van pathogenese van microbiele infecties, interactie met de gastheer, afweermechanismen van de gastheer, immune evasion, de wijze van infectie en transmissie, en mogelijkheden tot preventie.
  
  
• Practicum
  De student kan de behandelde onderzoeksmethoden uitvoeren en begrippen uit de medische microbiologie en epidemiologie toepassen tijdens de practica die voor Bacteriologie en Parasitologie gegeven worden als ondersteuning van de in de colleges onderwezen leerstof. Hieronder vallen: Basistechnieken: werken en omgaan met pathogene micro-organismen, microscopie; moleculair biologische en biochemische analyse technieken;
  
  
• Literatuurstudie
  De student kan zelfstandig informatie verzamelen uit wetenschappelijke literatuur.
  De student kan een schriftelijk overzicht opstellen over een specifiek virus in de vorm van een literatuurverslag aan de hand van een aantal aspecten van het virus. De schrijfopdracht wordt uitgevoerd aan de hand van zelf te verzamelen  literatuur, volgens instructies die voor de opdracht worden verstrekt;
  
  
• Fylogenie, computeropdracht
  De student kan middels adequate software de phylogenetische relatie tussen een aantal virussen op basis van hun sequentie vaststellen. De student kan hierover schriftelijk rapporteren in een verslag. Deze opdracht maakt deel uit van het onderdeel Virologie

Onderwijsvormen

• Hoorcollege
• (Computer)practicum

Verplichte (werk)colleges, practicum, literatuurstudie en presentaties.
In de hoorcolleges wordt de leerstof behandeld welke wordt getoetst in het tentamen.Er is gelegenheid tot het stellen van vragen. Ieder practicumonderdeel wordt voorafgegaan door een verplicht inleidend voorcollege. De colleges en voorcolleges worden op Blackboard geplaatst. Aan de hand van deze inleiding en de practicumhandleiding worden de experimenten in groepjes of zelfstandig uitgevoerd, waarbij assistentie aanwezig is. De resultaten van de proeven worden genoteerd in het labjournaal (dat de studenten zelf mee dienen te brengen!). Het practicum wordt getoets met een öpen labjournaal tentamen" waarbij het labjournaal en de practicumhandleiding gebruikt mogen worden voor het beantwoorden van de vragen. Voor de opdrachten Virologie worden verslagen ingeleverd die worden beoordeeld. Het practicum Parasitologie wordt tijdens de uitvoering beoordeeld en dient voldoende te zijn.

Verdeling leeractiviteiten

Academische vaardigheden

Kennis/cognitie;  experimentele vaardigheden zoals steriel werken, bacteriën kweken, antibioticumresistentiebepaling, PCR, sequentie-analyse, eiwitgelelectrophorese en begrip van Western Blotting t.a.v. Bacteriologisch practicum, microscopie/herkenning parasieten bij practicum Parasitologie; schriftelijke verslaglegging: nauwkeurig bijhouden labjournaal zoals aangeleerd bij academische vaardigheden, wetenschappelijk literatuurverslag.

De leerdoelen staan geformuleerd onder 1. Leerdoelen

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.
  

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanwezigheid bij practicum voorcolleges en practica is verplicht, zie hierboven. De practica zijn een verdieping en uitbreiding van de hoorcolleges, waarbij de stof van de hoorcolleges bekend wordt verondersteld. Het volgen van de hoorcolleges is dus feitelijk essentieel.  

Toetsing

Opdrachten

Opdrachten practica

• Er wordt in de practica een aantal opdrachten bewerkt, en er wordt een labjournaal bijgehouden om over het tentamen een "open labjournaal" toets te kunnen maken. In deze toets worden vragen gesteld over het practicum, zowel over de resultaten als de interpretatie hiervan.
  In het onderdeel Virologie worden individuele computer- en schrijfopdrachten uitgevoerd.

Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:

•    Naam opdracht 1 : beschrijving 2
•    Naam opdracht 2 : beschrijving 1
•    ....

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat

Weekplanning

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Aanvullende informatie

Contactinformatie

Coördinator

• dr. S.A.J. Zaat

s.a.zaat@amc.uva.nl