Microben en de Mens

Microbes and Man

4 EC

Semester 1, periode 3

5502MIME4Y

Eigenaar Biologie/bio-medisch (algemeen)
Coördinator prof. dr. L.W. Hamoen
Onderdeel van Bachelor Biologie, jaar 1Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1

Studiewijzer 2016/2017

Globale inhoud

De cursus Microben en de Mens heeft als doel de student een introductie te geven in de microbiologie. Dit is een breed veld en in de hoorcolleges zal de diversiteit en biologie van bacteriën, gisten, schimmels, protozoa en virussen worden behandeld.

Microben spelen een essentiële rol in de natuur en het leven van de mens. Ze zijn belangrijk voor de nutriënten kringloop in de natuur, het opnemen van voedsel, het bewaren en bewerken van ons voedsel, het beschermen tegen ziekte verwerkers, maar ze vormen ook één van de grootste bedreigingen voor onze gezondheid en veroorzaken sterfte op een mondiale schaal. In de hoorcolleges komen al deze aspecten aan bod en wordt er dieper ingegaan op de interactie tussen de mens en microben.

Dat de mens niet ziek wordt van microben is vooral te danken aan het immuun systeem, en in de cursus zal het immuun systeem ook behandeld worden.

Het praktische deel van de cursus heeft drie doelstellingen. Ten eerste wordt een deel van de behandelde theorie geïllustreerd. Ten tweede maakt men kennis met de praktijk van de Veilige Microbiologische Techniek VMY), en ten derde wordt aandacht besteed aan het experimenteel ontwerp om een hypothese te toetsen en de verkregen data statistisch correct te verwerken, te interpreteren en in een lab journaal te documenteren.

De cursus valt binnen de leerlijn Mechanismen van Ziekten van de Mens en sluit aan bij de volgende vakken binnen het curriculum: Van Molecuul tot Cel (jaar 1), Moleculaire Celbiologie (jaar 2), Immunologie (jaar 2), Medische Microbiologie (jaar 3).

Studiemateriaal

Literatuur

  • Microbiology: An Evolving Science, Joan L. Slonczewski, John W. Foster, Uitgever: Ww Norton &Amp; Co, 3rd International student edition, ISBN10 :0393923215, ~50-60 Euro.
    Voor de cursus is aanschaf van het boek (hardcopy of digitaal) essentieel.
    Aanvullend kan ook oefenmateriaal aangeschaft worden, dit is facultatief.

Syllabus

  • (Engels talige) practicumhandleiding: (prijs ± €15,-, bij Educational Service Center ) 

Practicummateriaal

  • Labjournaal: (prijs ± €9,-, bij Educational Service Center)

  • Labjas (verplicht voor het practicum in alle cursussen) (prijs ± €25,-)

Overig

  • PPTs van alle (highlighht)colleges zullen op Blackboard beschikbaar gemaakt worden.

Leerdoelen

Aan het eind van de cursus begrijpt de student het belang van micro-organismen en virussen en de wisselwerking met de mens door in staat te zijn:

  • de algemene structuur-functie relaties bij prokaryoten te beschrijven;
  • de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan morfologie en groei van prokaryoten uit te leggen;
  • kwantitatief de groei van bacteriën te beschrijven en enkele fysiologische parameters te berekenen;
  • de basisprincipes van signaaltransductie bij micro-organismen te beschrijven;
  • algemene aspecten van darm-, huid- en mondflora (microbioom) te benoemen;
  • de mechanismen van antibiotica en antibiotica-resistentie uit te leggen;
  • de moleculaire mechanismen van afweer tegen prokaryoten en virussen door het menselijk lichaam te beschrijven;
  • de rol van micro-organismes te kennen in voedsel verwerking en bederf;
  • de basisprincipes van het werken met bacteriën volgens VMT uit te voeren;
  • een hypothese te vormen en te testen middels een experiment;
  • eigen data te verwerken, resultaten te interpreteren en deze weer te geven in het labjournaal.

Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • (Computer)practicum
  • Highlightcolleges
  • Highlightcolleges door externe deskundigen
  • Practica: studenten werken in koppels. De practicumhandleiding is in het Engels en het verslag/labjournaal wordt in het Engels geschreven. Het verslag/labjournaal wordt niet beoordeeld op de kwaliteit van het Engels.
  • Computerpracticum: ter ondersteuning van de practicumrapportage

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Aantal uur

Hoorcollege

22

Highlight college

4

Practicum

16

Computer practicum

4

Tentamen

3

Vragenuur

6

Zelfstudie

57

Totaal 4 x 28 uur

112

 

Academische vaardigheden

Bij het practicum wordt de academische houding getoetst. In de practicumhandleiding vind je de behoordelingscriteria.

Bij het schrijven van het labjournaal wordt ook gekeken naar de verwerking van de onderdelen van de empirische cyclus en de formulering van je tekst. De tekst wordt niet beoordeeld op correct gebruik van de Engelse taal. In de practicumhandleiding vind je de beoordelingscriteria. Bij de cursus Van Molecuul tot Cel en bij Academische Basisvaardigheden zijn de basis(vaardigheden) al aan de orde gekomen.

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan alle practica computerpractica veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht en de student dient zich op deze bijeenkomsten terdege voor te bereiden.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanwezigheid bij de hoorcolleges wordt sterk aanbevolen.

Voor de practica geldt een strikte aanwezigheidsplicht (zie details in de practicumhandleiding). Voldoe je hier niet aan, dan kun je het practicum en dus het vak niet meer halen.

Bij zwaarwegende redenen dien je voorafgaand aan het practicum de practicumcoördinator, met argumenten, hiervan op de hoogte te stellen.

Toetsing

Onderdeel en weging Details Opmerkingen

Eindcijfer

90%

Tentamen

Moet ≥ 5.5 zijn, Herkansbaar

10%

Practicum

Moet ≥ 5.5 zijnPracticum blijft geldig tot einde volgend studiejaar. Onvoldoende practicum kan volgend studiejaar opnieuw worden gevolgd.

1 (33%)

Labjournaal

1 (33%)

Practische Vaardigheden

1 (33%)

Academische werkhouding

Tijdens de cursus wordt de theorie na 4 weken schriftelijk getoetst. De toets zal de vorm van vierkeuzevragen hebben.

Inzage toetsing

De manier van inzage wordt via de digitale leeromgeving gecommuniceerd.

Opdrachten

Practicumopdracht

  • Nauwkeurig uitvoeren van experimenten

Practicumopdracht

  • Beantwoorden van vragen bij de experimenten

Practicumopdracht

  • Bijhouden van een labjournaal

Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:

  •    Naam opdracht 1 : beschrijving 2
  •    Naam opdracht 2 : beschrijving 1
  •    ....

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene ‘Fraude- en plagiaatregeling’ van de UvA. Onder plagiaat of fraude wordt verstaan het overschrijven van het werk van een medestudent dan wel het kopiëren van wetenschappelijke bronnen (uit bijvoorbeeld boeken en tijdschriften en van het Internet) zonder daarbij de bron te vermelden. Uiteraard is plagiaat verboden. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd en streng tegen opgetreden. Bij verdenking van plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Wanneer de examencommissie overtuigd is dat er plagiaat gepleegd is dan kan dit maximaal leiden tot een uitsluiting van al het onderwijs van de opleiding voor een heel kalenderjaar. Zie voor meer informatie over het fraude- en plagiaatreglement van de Universiteit van Amsterdam.www.uva.nl/plagiaat

Weekplanning

Weeknummer Onderwerpen Studiestof
1
2
3
4

Aanvullende informatie

Dit vak heeft een Blackboardsite. Hier vind je de noodzakelijke aanvullende informatie, zoals de groepsindeling van de practica en de opdrachten. Bekijk de Blackboardsite dus met grote regelmaat!

Contactinformatie

Coördinator

  • prof. dr. L.W. Hamoen