Course manual 2016/2017

Course content

Photosynthesis: an overview of the biological process. The relevant structures: pigments, proteins, the photosynthetic membrane. Excitation energy transfer and excitons. Disorder Charge separation by the reaction center and electron transfer. Charge stabilisation. Proton coupled electron transfer. The energetics of photosynthesis Arificial photosynthesis.

Study materials

Literature

  • R.E. Blankenship, 'Molecular Mechanisms of Photosynthesis', Blackwell 2014.

Syllabus

  • Lecture notes are provided electronically

Objectives

Introduce the fundamental aspects of photosynthesis and photosynthetic energy conversion.

Teaching methods

  • Lecture
  • Self-study
  • Laptop seminar
  • Computer lab session/practical training

Learning activities

Activity

Number of hours

Hoorcollege

21

Tentamen

5.5

Zelfstudie

141.5

Attendance

The programme does not have requirements concerning attendance (OER-B).


Additional requirements for this course:

Assessment

Item and weight Details

Final grade

100%

Tentamen

100%

Hertentamen

Assignments

Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:

  •    Naam opdracht 1 : beschrijving 2
  •    Naam opdracht 2 : beschrijving 1
  •    ....

Fraud and plagiarism

Dit vak hanteert de algemene ‘Fraude- en plagiaatregeling’ van de UvA. Onder plagiaat of fraude wordt verstaan het overschrijven van het werk van een medestudent dan wel het kopiëren van wetenschappelijke bronnen (uit bijvoorbeeld boeken en tijdschriften en van het Internet) zonder daarbij de bron te vermelden. Uiteraard is plagiaat verboden. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd en streng tegen opgetreden. Bij verdenking van plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Wanneer de examencommissie overtuigd is dat er plagiaat gepleegd is dan kan dit maximaal leiden tot een uitsluiting van al het onderwijs van de opleiding voor een heel kalenderjaar. Zie voor meer informatie over het fraude- en plagiaatreglement van de Universiteit van Amsterdam.www.uva.nl/plagiaat

Course structure

14 Wed April 5, 9-11h, F630  Introduction
  Fri April 7, 9-11h, C668 paramGUI (1)
15 Wed April 12, 9-11h, F630  Chapter 1-2
16 Wed April 19, 9-11h, F630  Chapter 4-5
  Fri April 21, 9-11h, C668 paramGUI (2)
17 Wed April 26, 9-11h, F630  Chapter 6
18 Wed May 3, 9-11h, F630  
19

Wed May 10, 9-11h, F630

 
 

Fri May 12, 9-11h, C668

 
20

Wed May 17, 9-11h, F630

 
 

Fri May 19, 9-11h, C668

 
21

Wed May 24, 9-11h, F630

 
22 Wed May 31, 12-14h45, M129 Exam

Week 14-16 Wednesdays: The Structure of Biological Matter and Photosynthesis

To be read: Chapter 1-5, blankenshipScience2011.pdf, downsampled Lecture TMoore Science for Sustainability 27 Nov 2015 VU.pdf

Week 14-16 Fridays: Global and target analysis of time‐resolved spectra

To be read: 2017GTAofLHandPQinvivo.pdf, page 66-79 of ModellingPSM.pdf

Please install RStudio on your laptop, and paramGUI as described on page 66 of ModellingPSM.pdf.

Timetable

Contact information

Coordinator

  • dr. I.H.M. van Stokkum