Genetica & Evolutie

Genetics & Evolution

Studiewijzer 2016/2017

Globale inhoud

Structuur en werking van het genetisch materiaal, celdeling, celcyclus en controle: wijze waarop genetische informatie wordt geconserveerd, overgedragen, verandert en evolueert.

• Mendelse genetica, mutaties en extra-nucleaire overerving
• Moleculaire mechanismen van DNA-replicatie, transcriptie en translatie
• Genexpressie
• Recombinant-DNA technologie en genetische modificatie
• Relatie tussen DNA-afwijkingen en ziekten
• Ontstaan van het leven op aarde, evolutie en soortvorming
• Genomische informatie en reconstructie van de fylogenie

Studiemateriaal

Literatuur

• Introduction to Genetic Analysis PLUS Launchpad, Griffith AJF, Wessler SR, Carroll SB and Doebley J, 10th ed., 2015;
• Evolutie boek: details nog onbekend

Syllabus

• Practicumhandleiding (te verkrijgen bij ESC);

Practicummateriaal

• Labjournaal (te verkrijgen bij ESC);
• Labjas (verplicht tijdens practica);
• Snijset;

Overig

• STAEDTLER Markeer Stift kleur zwart, permanent, Fijn (voor het markeren van o.a. 1,5 ml buisjes).

Leerdoelen

• Student heeft basaal begrip van onderstaande concepten en onderdelen daarvan, en kan deze op duidelijke en begrijpelijke wijze uitleggen aan derden:
  • Erfelijkheidsleer/Genetica;
  • Moleculaire genetica
  • (Moleculair) genetische technieken;
  • Populatie genetica;
  • Evolutie.

• Student kan opgedane theoretische kennis toepassen in experimenteel onderzoek.
• Student kan zelfstandig basale biologische methodes en technieken uitvoeren (o.a. microscopie, pipeteren, PCR, gel electroforese, microbiologische technieken, steriel werken, platen gieten, enten).
• Student kan zelfstandig empirische cyclus toepassen in het onderzoek volgens richtlijnen van cursus academische vaardigheden en methoden van onderzoek: opstellen van eenvoudige nul- en alternatieve hypotheses; verwerken van grote datasets in duidelijke figuren en/of tabellen; hypotheses op een statistische wijze te evalueren aan de hand van verkregen onderzoeksresultaten; leren kritisch foutenanalyse en analyse resultaten.
• Student kan een aantal basale (moleculair) genetische technieken veilig en correct uitvoeren.
• Student kan op wetenschappelijke wijze een labjournaal, voortbouwend op , bijhouden.
• Student ontwikkelt een eigen en juiste werkhouding in het lab (theoretische voorbereiding, veilig werken).

Onderwijsvormen

• Hoorcollege
• Werkcollege
• (Computer)practicum
• Zelfstudie

De student kan zelf via “learning curve” van de launchpad portal van “Introduction to Genetic Analysis” en  “How Life Works” zijn/haar kennis toetsen. Dit is een “on line quiz”, waarbij net zo lang vragen gesteld worden totdat de student een van tevoren vastgesteld niveau heeft gehaald.

Verdeling leeractiviteiten

Academische vaardigheden

Onderstaande academische vaardigheden worden getoetst en zijn onderdeel van practicum beoordeling:

• Toepassen van empirische cyclus in het onderzoek
• Op wetenschappelijke wijze bijhouden van een labjournaal
• Academische houding

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Deelname aan alle practica computerpractica veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht en de student dient zich op deze bijeenkomsten terdege voor te bereiden.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanvullende eisen voor dit vak:

Het is verplicht om deel te nemen aan alle (computer-)practica. Het volgen van practica is een vereiste voor het verkrijgen van een cijfer voor de cursus. Indien men door overmacht niet in staat is een practicum bij te wonen, is het beperkt mogelijk dit practicum met een andere groep mee te doen. Dit kan alleen wanneer op tijd (dus vooraf) gemeld is bij de coördinator (cursus1002@gmail.com) welk practicumonderdeel niet gevolgd kan worden en waarom men het betreffende practicumonderdeel niet kan volgen.

ONGEOORLOOFDE AFWEZIGHEID Afwezig zonder geldige reden of zonder afmelding kan tot uitsluiting van het gehele verdere practicum leiden met alle mogelijke gevolgen van dien voor de eindbeoordeling. Toelichting: het niet-voldoen aan de practicumverplichting betekent: geen eindcijfer voor het vak en geen toelating tot het 2de jaar.

Toetsing

Elk van de practicumonderwerpen bestaat uit een aantal schriftelijke opdrachten die onderdeel uitmaken van de empirische cyclus en worden bijgehouden in het labjournaal. Een deel van deze opdrachten (opstellen onderzoeksvraag/ hypotheses/proefopzet) moet thuis ter voorbereiding op het practicum in het labjournaal worden opgetekend. Overige opdrachten (noteren van resultaten/evaluatie/conclusie) worden tijdens het practicum uitgevoerd of kunnen thuis verder afgemaakt worden.

Opdrachten

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat

Weekplanning

Rooster

Het actuele rooster is te vinden in http://datanose.nl/#course[37296]

Aanvullende informatie

Aanmelding voor de eerstejaarsvakken in het eerste semester gebeurt automatisch. Vanaf het tweede semester moet je jezelf aanmelden via het systeem SIS. Zie voor meer informatie hierover www.student.uva.nl/sis. Als je je aanmeldt voor een vak word je ook automatisch ingeschreven voor het bijbehorende tentamen en voor eventuele andere toetsvormen van dat vak.  Herkansers die een voldoende hebben voor het practicum hoeven dit onderdeel niet te opnieuw doen. Het behaalde practicumcijfer blijft staan. 

• Dit vak heeft een Blackboardsite. Bekijk deze regelmatig!
• WEES OP TIJD Te laat komen is uitermate storend en onbeleefd. Bovendien voldoe je niet aan de aanwezigheidsverplichting.
• BEREID JE VOOR OP ELK PRACTICUM Zo weet je wat je ongeveer te wachten staat. Dit doe je door het betreffende practicumonderdeel in de syllabus en de bijbehorende hoofdstukken in het boek door te lezen. Ook moet je een deel van de vragen en opdrachten al van tevoren beantwoorden en maken.
• BRENG LABJAS, LABJOURNAAL, SNIJSET EN TEKENPOTLODEN VOOR HET PRACTICUM MEE.
• MOBIELE TELEFOONS EN ANDERE STORENDE APPARATUUR UITSCHAKELEN TIJDENS HET PRACTICUM.
• Het dragen van een LABJAS en deugdelijk schoeisel (geen naaldhakken of rollerskates) is VEPLICHT.
• LOSHANGEND HAAR DIENT SAMENGEBONDEN TE WORDEN.
• GEEN ETEN EN DRINKEN OP DE PRACTICUMZAAL

Contactinformatie

Coördinator

• dr. Hans Breeuwer