Studiewijzer 2016/2017

Globale inhoud

Studenten leren populatiedynamische modellen begrijpen en analyseren met verschillende interactievormen. Hiermee kunnen de studenten maatschappelijke problemen gerelateerd aan populatiedynamica (zoals overbevissing, plaagbestrijding en natuurbeheer) begrijpen en uitleggen.

De volgende onderwerpen worden behandeld in hoorcolleges, werkcolleges en computerpractica:

populatiedynamiek van biologische systemen;
balansvergelijking, toestand, (on-) afhankelijke variabelen, parameters, grootheden en dimensies;
life-tables en modelformulering in differentievergelijkingen;
modelformuleringen in differentiaalvergelijkingen voor exponentiële en logistische populatiegroei;
intra- en interspecifieke concurrentie;
de groei van micro-organismen;
analytische en grafische methoden voor onderzoek aan modellen;
predator-prooi interacties;
parasitoid-gastheer interacties;
parasiet-gastheer interacties;
voedselwebben;
directe en indirecte interacties;
trophic cascades;
omnivorie;
apparent competition;
metapopulatie-dynamica;
coexistentie en persistentie.

Studiemateriaal

Literatuur

De stof uit het Basisboek Wiskunde van Jan van de Craats en Rob Bosch (2e editie, 2000, Pearson Prentice Hall, Amsterdam, te verkrijgen via Scheltema of Bol.com) bekend verondersteld. Van dit boek zijn essentiële onderdelen de hoofdstukken 4 – 6, 9 – 12, hoofdstuk 16 t.m. Snijpunten van Grafieken, hoofdstuk 18, 20, en 21 t.m. Differentialen – definitie en rekenregels. De meeste delen van dit boek zijn ook via internet te bekijken (http://staff.science.uva.nl/~craats/#project, doorklikken naar Basisboek Wiskunde). De online toetsen dienen ter toetsing en ter opfrissing van de wiskundekennis.

Syllabus

De collegestof wordt aangeboden in de vorm van dictaten en hand-outs van de colleges en wordt op Blackboard aangeboden.

Practicummateriaal

Uitwerking van de practicumopdrachten

Software

R statistical software met package (library) "desolve"

Leerdoelen

De student is aan het eind van de cursus in staat om:

Onderliggende processen die dichtheden van populaties en eenvoudige levensgemeenschappen beïnvloeden, zoals concurrentie, predatie, parasitisme en ziekte, te benoemen en te herkennen in wiskundige formuleringen (Kennis).
Een gegeven wiskundig populatiemodel uit te leggen in biologische termen (Inzicht).
Evenwichten te berekenen van een gegeven populatiemodel (Toepassing).
Uitspraken te doen over de stabiliteit en het voortbestaan van de gemodelleerde populaties (Analyse).
De consequenties van interacties op het voortbestaan van populaties te voorspellen met behulp van het maken van een (grafische) analyse (Analyse en Inzicht)
De dynamica van de populaties te simuleren met behulp van computersimulaties (Toepassing en Analyse).
De voorspelde consequenties uit te leggen in biologische termen (Analyse).
Zelf eenvoudige modellen op te stellen van een nieuw concreet biologisch systeem (Synthese).
Bovengenoemde leerdoelen toe te passen op systemen met drie interacterende populaties (Synthese).

Onderwijsvormen

Hoorcollege
Werkcollege
Laptopcollege
Zelfstudie
lezing

De cursus bestaat uit hoorcolleges, werkcolleges, computerpractica, online-toetsen en lezingen.

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit	Aantal uur
Hoorcollege	38
Laptopcollege	40
Presentatie	12
Tentamen	3
Tussentoets	3
Vragenuur	2
Werkcollege	38
Zelfstudie	200

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

Deelname aan alle (computer)practica, veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht.

Aanvullende eisen voor dit vak:

De aanwezigheid tijdens practica en werkcolleges en de ethiekpresentaties en discussies is verplicht. De enige geldige redenen om afwezig te zijn betreffen ziekte en familie-omstandigheden, waarbij de student zich vooraf via email moet worden afgemeld, arne.janssen@uva.nl. Het resultaat van de online toetsen moet voldoende zijn.

Toetsing

Onderdeel en weging	Details
Eindcijfer
0.33 (33%) Tussentoets	Herkansbaar
0.66 (67%) Tentamen	Herkansbaar

Inzage toetsing

De datum, het tijdstip en de locatie van het inzagemoment staan in het rooster in DataNose.

Opdrachten

Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:

Naam opdracht 1 : beschrijving 2
Naam opdracht 2 : beschrijving 1
....

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene ‘Fraude- en plagiaatregeling’ van de UvA. Onder plagiaat of fraude wordt verstaan het overschrijven van het werk van een medestudent dan wel het kopiëren van wetenschappelijke bronnen (uit bijvoorbeeld boeken en tijdschriften en van het Internet) zonder daarbij de bron te vermelden. Uiteraard is plagiaat verboden. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd en streng tegen opgetreden. Bij verdenking van plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Wanneer de examencommissie overtuigd is dat er plagiaat gepleegd is dan kan dit maximaal leiden tot een uitsluiting van al het onderwijs van de opleiding voor een heel kalenderjaar. Zie voor meer informatie over het fraude- en plagiaatreglement van de Universiteit van Amsterdam.www.uva.nl/plagiaat

Weekplanning

Weeknummer	Onderwerpen	Studiestof
1
2
3
4
5
6
7
8

Rooster

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd op https://datanose.nl/

Aanvullende informatie

Calculus en algebra op eindexamenniveau middelbare school.

Contactinformatie

Coördinator

Arne Janssen

Contact practicumassistenten:

Lotte de Vries: lottedevriesss@gmail.com

Silke van Daalen: silkevandaalen@hotmail.com

Eigenaar	Bachelor Biologie
Coördinator	Arne Janssen
Onderdeel van	Bachelor Biologie, jaar 2 Bachelor Bèta-gamma, major Biologie, jaar 2 Bachelor Future Planet Studies, major Biologie, jaar 2

Populatie-ecologie