Ecosystem Dynamics

Ecosysteemdynamica

12 EC

Semester 2, period 5, 6

5042ESD12Y

Owner Bachelor Biologie
Coordinator dr. J.F. Duivenvoorden
Part of Minor Ecologie en Evolutie, year 1Bachelor Biologie, year 2

Course manual 2016/2017

Course content

In het eerste deel van de cursus zal het volgende behandeld worden:

Abiotische processen en nutrientencycli

Basiseigenschappen aquatisch en terrestrisch milieu; redox, zuurstof, licht, koolstof en organisch materiaal, N-, S-, en P-kringloop en micronutrienten, trofiegraad en nutrientbeschikbaarheid, remineralisatie en decompositie.

Dynamiek in levensgemeenschappen: abiotische factoren

Wetlands, meren, rivieren, het litoraal, waterbodems en bodems in (semi-)terrestrisch milieu, temperatuur, vocht en licht als limiterende factoren van soortsverbreiding.

Dynamiek in levensgemeenschappen: biotische factoren

Verspreiding, habitat selectie en sortering via uitruilmechanismen op basis van eigenschappen van organismen.

Dit eerste deel wordt afgesloten met een schriftelijk tentamen.

In het tweede deel van de cursus wordt de kennis uit het eerste deel toegepast tijdens een meerdaagse veldonderzoektraining die plaats vindt in Frankrijk (de Boulonnais nabij Wimereux en Ambleteuse). Het veldonderzoek wordt voorafgegaan door een voorbereiding in Amsterdam, waarbij ondermeer practica worden verzorgd in herkenning van organismen en hun eigenschappen, en in analysemethoden met concrete velddata waarbij multivariate analyse, regressies en andere technieken worden behandeld. Als voorbereiding stellen de studenten (in groepen van 3 tot 4) een kort onderzoeksvoorstel op. Tijdens het veldwerk in Frankrijk worden gegevens verzameld, die vervolgens worden geanalyseerd in Amsterdam en verwerkt tot een mondelinge en schriftelijke reportage.

Study materials

Literature

  • Ecology: the Experimental Analysis of Distribution and Abundance. 6 th Edition, C.J. Krebs (2009), Pearson, Education, San Fransisco. ISBN 9781292026275.
  • Fresh Water Ecology, 2nd Edition, W.K. Dodds & M.R. Whiles (2010), Academic Press. ISBN 978-0-12-374724-2. Dit boek is beschikbaar vanaf het UvA-domein via http://www.sciencedirect.com/science/book/9780123747242
  • Essential soil science: a clear and concise introduction to soil science, Ashman, M.R. & Puri, G. (2002), Blackwell, Malden. ISBN 0-632-04885-9. Dit boek is beschikbaar in de bibliotheek.

Other

  • Daarnaast kunnen docenten aanvullend leermaterialen verstrekken (powerpointpresentaties, artikelen, handleidingen practica, klapper veldonderzoek).

Objectives

Na het succesvol doorlopen hebben van de cursus kan de student

• de kenmerken van levensgemeenschappen en ecosystemen benoemen en de interacties van deze met de abiotische en biotische omgeving uitleggen

• groepsgewijs veldonderzoek ontwerpen

• groepsgewijs een ecologisch veldonderzoek uitvoeren

• groepsgewijs statistisch verkregen veldresultaten verwerken, gebruik makend van R, en een schriftelijk verslag doen van het onderzoek

• groepsgewijs de resultaten van het veldonderzoek in hoofdlijnen mondelijk presenteren

Teaching methods

  • Hoorcollege
  • Werkcollege
  • (Computer)practicum
  • Veldwerk/excursie
  • Presentatie/symposium
  • Zelfstudie
  • Zelfstandig werken aan bijv. project/scriptie
  • Begeleiding/feedbackmoment

Hoorcollege
Werkcollege 
Practicum
Veldonderzoekstraining
Presentaties van voorstel en onderzoeksresultaten

Learning activities

Activiteit

Aantal uur

Hoorcollege

32

Laptopcollege

14

Practicum

16

Presentatie

24

Tentamen

3

Veldwerk

56

Vragenuur

1

Werkcollege

24

Zelfstudie

166

Totaal 12 EC x 28 uur

336

Attendance

Programme's requirements concerning attendance (OER-B):

  • Participation in all practical (computer) sessions, field work and seminars in the curriculum is obligatory.

Additional requirements for this course:

Additional requirements for this course:

Deelname aan alle practica, computerpractica, alle onderdelen van het veldonderzoek, werkcolleges en groepspresentaties (ook het aanhoren van de presentaties van anderen) is verplicht. Bij het niet aanwezig zijn zonder melding en aanvaarding door coördinator vooraf, volgt, in principe, automatisch uitsluiting. Aanwezigheid bij hoorcolleges wordt sterk aanbevolen.

Assessment

Item and weight Details

Final grade

1 (100%)

Tentamen

Assignments

Computerpracticum

  • Opdrachten behorende bij het computerpracticum analyse worden vooraf via Blackboard beschikbaar gemaakt. Alleen als deze opdrachten zijn uitgevoerd krijgt de student het eindcijfer.

Veldonderzoek

  • Voor wat betreft het veldonderzoek (voorstel, uitvoering, uitwerking, presentatie) in Ambleteuse wordt via Blackboard aan de start van de module een veldhandleiding via Blackboard beschikbaar gemaakt.

Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:

  •    Naam opdracht 1 : beschrijving 2
  •    Naam opdracht 2 : beschrijving 1
  •    ....

Fraud and plagiarism

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat

Course structure

Weeknummer Onderwerpen Studiestof
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12

Timetable

Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd op https://datanose.nl/.

Additional information

Locatie: Science Park, veldwerk in de Boulonnais (Frankrijk) of elders. 


Contact information

Coordinator

  • dr. J.F. Duivenvoorden