Moleculaire Neurobiologie 3

Molecular Neurobiology 3

6 EC

Semester 1, periode 3

51023MON6Y

Eigenaar Bachelor Psychobiologie
Coördinator dr. M.F.M. Hoekman
Onderdeel van Bachelor Psychobiologie, jaar 3

Studiewijzer 2015/2016

Globale inhoud

Tijdens het vak moleculair neurobiologie ga je onderzoek doen naar de mechanisme achter Amyotrofische Laterale Sclerose en de ziekte van Parkinson. Om dit te kunnen doen wordt in hoorcolleges de theorie achter deze neurologische aandoeningen behandeld en worden verschillende moleculair biologische technieken uitgelicht. Tijdens de werkgroepen wordt literatuur besproken en ga je je eigen experimenten opzetten, die je tijdens de practica gaat uitvoeren.  


Studiemateriaal

Literatuur

  • Molecular Biology of the Cell, 6e druk, Alberts et al.

  • Practicumhandleiding (aan te schaffen bij de studentenbalie)

  • Critical Thinking Miniguide (aan te schaffen bij de studentenbalie)

Leerdoelen

  • Je kunt wetenschappelijke literatuur selecteren en kritisch inhoudelijk beoordelen.
  • Je kunt een presentatie geven over je bevindingen in wetenschappelijk Nederlands en Engels.
  • Je kunt het onderzoeksverslag en presentatie van medestudenten kritisch beoordelen
  • Je kunt uitleggen wat er onder een professionele lab- (academische-) houding wordt verstaan en je hier naar gedragen
  • Je kunt de theoretische achtergronden (concepten) van de volgende experimenten en technieken uitleggen en toepassing op experimenteel onderzoek: Basale aseptische, microbiologische en moleculair biologische technieken waaronder: transiente transfecties; celkweek van Neuro2A cellen; celpreparaten maken; fluorescentie microscopie; MTA-assay; semi-kwantitatieve PCR; SDS-PAGE; Westernblot; Immunocytochemie, eiwit bepaling, cellysaten maken.
  • Je kunt uit een onderzoeksartikel een protocol interpreteren en toepassen op experimenteel onderzoek
  • Je kunt de verschillende experimentele stappen toelichten en de samenhang hiertussen uitleggen
  • Je kunt zelfstandig de empirische cyclus doorlopen en toepassen in experimenteel onderzoek: 1) selecteren literatuur; 2) opstellen onderzoeksvraag en onderzoekshypothese; 3) maken van proefopzet (inclusief voorspellingen); 4) (statistisch) analyseren, interpreteren en bediscussiëren van verkregen resultaten
  • Je kunt een labjournaal bijhouden
  • Je kunt reflecteren op je eigen handelen
  • Je kunt professioneel samenwerken met medestudenten
  • Je kunt deelnemen aan een wetenschappelijke discussies (je mening naar voren brengen, verantwoorden en overeind houden)
  • Je kunt de algemene veiligheidsregels (voor mens en milieu) benoemen en toepassen
  • Je kunt uitleggen wat er onder een professionele lab- (academische-)houding wordt verstaan en je hier naar gedragen

Naast de algemene leerdoelen zijn er ook specifieke leerdoelen per werkvorm (hoorcolleges, werkgroepen en practica) die te vinden zijn op de Moleculaire Neurobiologie BlackBoard pagina.


Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • Werkcollege
  • (Computer)practicum
  • Zelfstudie

 

Highlight colleges: Geven een inkijkje in de achtergrond en recent wetenschappelijk onderzoek aan ALS en Parkinson’s in Nederland. Er wordt vooral nadruk gelegd op de moleculaire werkingsmechanismen, waarbij ook aandacht is voor de klinische relevantie van het getoonde onderzoek.

Werkcolleges (verplicht): De werkcolleges zijn gericht op de samenhang tussen de experimenten tijdens het practicum. Naast uitleg van de gebruikte technieken wordt er vooral de nadruk gelegd op het interpreteren van onderzoeksdata, hypothese-vorming, en hoe het volgende experiment te ontwerpen.

Practicum (verplicht): Het practicum is vooral gericht op hoe moleculaire technieken uit te voeren en vervolgens te relateren aan de gestelde vraag. Tijdens het practicum wordt uitvoerig aandacht besteed aan de empirische cyclus, oa door de interpretatie van de behaalde resultaten.

Zelfstudie: Studenten krijgen de tijd om aan de hand van wetenschappelijke literatuur en gestelde opdrachten zich te verdiepen in het vakgebied en de specifieke aandoening (ALS of Parkinson’s). Studenten dienen zich ook voor te bereiden op de werkcolleges en het practicum.

 

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Aantal uur

Hoorcollege

8

Practicum

68

Presentatie

16

Tentamen

3

Werkcollege

20

Zelfstudie

53

Totaal 6EC * 28

168

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan alle practica, computerpractica, veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht en de student dient zich op deze bijeenkomsten terdege voor te bereiden.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanvullende eisen voor dit vak:

Voor zowel de Highlight-colleges, werkcolleges als practica geldt een strikte aanwezigheidsplicht. Je mag gedurende het hele vak maximaal 1 van de highlightcolleges en werkcolleges missen. Ben je vaker dan 1 maal afwezig, dan wordt er geen eindcijfer geregistreerd.

Toetsing

Onderdeel en weging Details

Eindcijfer

0.15 (15%)

Tentamen

Moet ≥ 5 zijn, Herkansbaar

0.2 (20%)

Labvaardigheden

Moet ≥ 5 zijn

0.25 (25%)

Short Report

Moet ≥ 5 zijn, Herkansbaar

0.2 (20%)

Academische Houding

Moet ≥ 5 zijn

0.2 (20%)

Presentatie

Moet ≥ 5 zijn, Herkansbaar

Inzage toetsing

De manier van inzage wordt via de digitale leeromgeving gecommuniceerd.

Tentamens mogen niet worden meegenomen. Kort na het tentamen is er een moment waarop studenten de tentamenvragen kunnen inzien en opmerkingen over tentamenvragen kunnen melden. Datum, tijdstip en plaats worden via Blackboard gecommuniceerd. Opmerkingen zullen behandeld worden door de docenten en worden teruggekoppeld via Blackboard. Zodra de uitslag van een deeltentamen bekend is, is er een moment waarop studenten hun uitwerking van het tentamen en antwoordmodellen kunnen inzien. Datum, tijdstip en plaats worden via Blackboard gecommuniceerd.

Opdrachten

Computer-opdracht databases

  • De studenten leren te werken met online databases over genetische variaties en genexpressie. Aan de hand van informatie uit deze databases leren ze in te schatten of een genetische variatie ziekteverwekkend zou kunnen zijn

Flipping the classroom

  • De studenten presenteren aan elkaar een aantal technieken zoals gebruikt in het tegenwoordige neurobiologisch onderzoek.

JournalClub

  • De studenten lezen papers over ALS en Parkinson’s en presenteren die aan elkaar.

Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:

  •    Naam opdracht 1 : beschrijving 2
  •    Naam opdracht 2 : beschrijving 1
  •    ....

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat

Weekplanning

Weeknummer Onderwerpen Studiestof
1
2
3
4

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Eindtermen

Deze cursus draagt bij aan de volgende eindtermen van de opleiding Psychobiologie:

1) Kennis en Inzicht

De bachelor:

  • 1a) kan de basisprincipes uit de vakgebieden ‘genetica en evolutie’, ‘celbiologie’, ‘biochemie’, ‘fysiologie’, ‘embryologie’, ‘anatomie’ en ‘evolutie en gedrag’ uitleggen.
  • 1b) kan de ontwikkeling en werking van het brein op alle niveaus – van molecuul tot de menselijke geest – binnen Psychobiologie, voornamelijk de deelgebieden ‘perceptie tot bewustzijn’, ‘leren en geheugen’, ‘emotie’, ‘motivatie’, ‘neuroanatomie’ en ‘neurofysiologie’ uitleggen.
  • 1c) kan de pathofysiologie en bijbehorende diagnostische methoden en mogelijke therapieën uitleggen.
  • 1d) kan uitleggen welke onderzoekstechnieken nodig zijn voor het ontwikkelen van kennis en dat kennis nodig is voor het ontwikkelen van onderzoekstechnieken.
  • 1e) kan de kennis opgedaan bij een zelfgekozen vak uitleggen.
  • 1f) kan de basisprincipes uit de beroepsethiek en wetenschapsfilosofie uitleggen.
  • 1g) kan mogelijke vervolgopleidingen benoemen.
  • 1h) kan uitleggen wat de bijdragen en beperkingen zijn van de kennis op elk niveau - van molecuul tot de menselijke geest - aan het wetenschapsgebied Psychobiologie.
  • 1i) kan op alle niveaus de werking van het brein van dieren en mensen vergelijken.
  • 1j) kan onderbouwen hoe de pathofysiologie bijdraagt aan het begrip van de ontwikkeling en werking van het brein op alle niveaus.
  • 1k) kan grensverleggende ontwikkelingen in het wetenschapsgebied Psychobiologie herkennen.
  • 1l) kan uitleggen dat een standpunt wordt beïnvloed door context.

2) Toepassen Kennis en Inzicht

De bachelor:

  • 2a) kan onderbouwen welke onderzoekstechnieken nodig zijn om onderzoeksvragen binnen het wetenschapsgebied Psychobiologie te beantwoorden.
  • 2b) kan ondersteunende disciplines zoals wis-, natuur- en scheikunde en programmeren toepassen.
  • 2c) kan de empirische cyclus zelfstandig doorlopen bij het uitvoeren van een onderzoek.
  • 2d) kan op een wetenschappelijke manier lopende experimenten documenteren.
  • 2e) kan algemene laboratoriumvaardigheden uitvoeren.
  • 2f) kan onderzoek doen met proefpersonen en relevante proefdieren.
  • 2g) kan voor de psychobiologie relevante computerprogramma’s en/of programmeertalen gebruiken.
  • 2h) kan ruwe data interpreteren en een geschikte (kwantitatieve) analysemethode toepassen.
  • 2i) kan werken volgens algemene milieu- en veiligheidsnormen.
  • 2j) kan redeneren en argumenteren en meerdere standpunten benoemen en onderbouwen.

3) Oordeelsvorming

De bachelor:

  • 3a) kan relevante literatuur verzamelen, verwerken en interpreteren.
  • 3b) kan de implicaties van onderzoeksresultaten voor de maatschappij overzien.
  • 3c) kan onderzoeksresultaten binnen de Psychobiologie en/of binnen een discipline- overstijgende context interpreteren.
  • 3d) kan de ethische aspecten van beroepsmatige omgang met levende organismen en weefsel overwegen.
  • 3e) kan informatie analyseren aan de hand van kwaliteitscriteria en er een eigen oordeel over vormen.
  • 3f) kan alternatieven en tegenargumenten overwegen bij het vormen of herzien van een oordeel.

4) Communicatie

De bachelor:

  • 4a) kan kennis, bevindingen en standpunten in wetenschappelijk Nederlands en Engels schriftelijk rapporteren en mondeling presenteren.
  • 4b) kan een bijdrage leveren aan wetenschappelijke discussies.
  • 4c) kan op basis van begrip en respect communiceren.
  • 4d) kan onderzoeksgegevens communiceren volgens de regels van wetenschappelijke integriteit.
  • 4e) kan een standpunt overbrengen.
  • 4f)  kan relevante literatuur verzamelen, verwerken en interpreteren.

5) Leervaardigheden

De bachelor:

  • 5a) kan een zelfstandige en wetenschappelijke werkwijze en houding ontwikkelen.
  • 5b) kan zich zelfstandig kennis eigen maken.
  • 5c) kan nieuwe kennis integreren met aanwezige kennis en tot inzichten komen.
  • 5d) kan een constructieve en synergetische manier van samenwerken ontwikkelen.
  • 5e) kan zich in een zelfgekozen deelgebied verdiepen of verbreden.
  • 5f) kan zich nieuwe technische vaardigheden eigen maken.
  • 5g) kan feedback geven en verwerken.
  • 5i) kan reflecteren op eigen gedrag en dit gedrag desgewenst verbeteren.
  • 5j) kan geleerde principes generaliseren en toepassen in een andere context.

Aanvullende informatie

Dit vak heeft een Blackboardsite. Hier vind je de noodzakelijke aanvullende informatie, zoals de groepsindeling van de werkcolleges, de opdrachten. Bekijk de Blackboardsite dus met grote regelmaat! 

Contactinformatie

Coördinator

  • dr. M.F.M. Hoekman