Molecular Microbiology
4 EC
Semester 1, periode 3
5052MICR4Y
| Eigenaar | Bachelor Biomedische wetenschappen |
| Coördinator | prof. dr. L.W. Hamoen |
| Onderdeel van | Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1 |
In deze cursus wordt met name aandacht besteed aan de interactie tussen de mens en micro-organismen. De hoorcolleges richten zich eerst op de moleculaire en celbiologische structuren die typerend voor bacteriën zijn. De groei van bacteriën wordt besproken op moleculair niveau waarbij onder andere DNA-segregatie, peptidoglycaan-synthese en het FtsZ/Min systeem aan bod komen. Bacteriële groei wordt tevens op populatieniveau behandeld waarbij kwantitatieve begrippen zoals verdubbelingstijd, en daarnaast groeikinetiek, cel-opbrengst en de verschillende fasen van de groei besproken worden. Enkele metabole aspecten en begrippen die zeer specifiek voor de bacteriële wereld zijn worden kort toegelicht.
Vanuit deze kennis worden zowel de voor de mens gunstige en noodzakelijke als ongewenste interacties met micro-organismen geïntroduceerd. Het belang van de darm- huid- en mondflora enerzijds en infecties en pathogeniciteit anderzijds worden vanuit microbieel gezichtspunt behandeld. Koch's postulaten zijn daarbij uitgangspunt en een enkel aansprekend voorbeeld wordt uit de doeken gedaan. Er wordt bij al deze aspecten van de interactie een koppeling gemaakt naar de (mechanismen van) antibiotica en de ontwikkeling en mechanismen van antibiotica-resistentie.
De cursus bevat tevens colleges die de interactie vanuit humane mechanismen behandelen. De basisprincipes van de aangeboren en verworven immunologische respons en afweermechanismen in het algemeen worden uitgelegd. Een apart college is toegespitst op de bijzondere eigenschappen van virussen en hun relatie met de mens en de moleculaire menselijke verdedigingsmechanismen tegen virussen.
Het praktische deel van de cursus heeft drie doelstellingen. Ten eerste wordt een deel van de behandelde theorie geïllustreerd (vorm en groei van bacteriën, antibiotica-effecten). Ten tweede maakt men kennis met de praktijk van de Veilige Microbiologische Techniek, waarbij met behulp van volstrekt ongevaarlijke model-organismen geleerd wordt hoe verantwoord omgegaan dient te worden met (potentieel) pathogene soorten. Ten derde wordt aandacht besteed aan het experimenteel ontwerp om een hypothese te toetsen en de verkregen data statistisch correct te verwerken, te interpreteren en in een lab journaal te documenteren.
Naast de reguliere hoorcolleges worden twee gastcolleges aangeboden, verzorgd door externe deskundigen waarvan de expertise direct aansluit op de aangeboden theorie
BOEK Microbiology an introduction, Tortora Funke and Case. 11de editie ISBN 1:1-292-02630-8 (prijs ± €68) Voor de cursus is aanschaf van het boek (hardcopy of digitaal) essentieel. Aanvullend kan ook oefenmateriaal aangeschaft worden, dit is facultatief.
PPTs van alle (highlighht)colleges zullen op Blackboard beschikbaar gemaakt worden.
Syllabus Practicumhandleidingen (prijs ± €15,-, bij Educational Service Center )
Labjournaal (prijs ± €9,-, bij Educational Service Center)
Labjas (verplicht voor het practicum in alle cursussen) (prijs ± €25,-)
Hoorcollege (18 uur), high light colleges door gastdocenten (2x2 uur).
Microbiologisch practicum (5 dagdelen). Bij het practicum werken de studenten in koppels. Van het practicum wordt een labjournaal bijgehouden.
Computerpracticum ter ondersteuning van de practicumrapportage (1 dagdeel).
|
Activiteit |
Aantal uur |
|
Hoorcollege |
22 |
|
Laptopcollege |
4 |
|
Practicum |
20 |
|
Presentatie |
4 |
|
Tentamen |
3 |
|
Vragenuur |
4 |
|
Zelfstudie |
55 |
|
Totaal 4EC * 28 |
112 |
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Aanvullende eisen voor dit vak:
Aanwezigheid bij de hoorcolleges wordt sterk aanbevolen. Voor de practica geldt een strikte aanwezigheidsplicht (zie details in de practicumhandleiding). Voldoe je hier niet aan, dan kun je het practicum en dus het vak niet meer halen. Bij zwaarwegende redenen dien je voorafgaand aan het practicum de practicumcoördinator, met argumenten, hiervan op de hoogte te stellen.
| Onderdeel en weging | Details | Opmerkingen |
|
Eindcijfer | ||
|
9 (90%) Tentamen | Moet ≥ 5.5 zijn, Herkansbaar | |
|
1 (10%) Practicum | Moet ≥ 5.5 zijn | Practicum blijft geldig tot einde volgende studiejaar. Onvoldoende practicum kan volgend studiejaar opnieuw worden gevolgd. |
|
1 (33%) Labjournaal | ||
|
1 (33%) Praktische vaardigheden | ||
|
1 (33%) Academische werkhouding |
De manier van inzage wordt via de digitale leeromgeving gecommuniceerd.
Bij het practicum zullen enkele opdrachten gemaakt worden:
- Nauwkeurig uitvoeren van experimenten
- Beantwoorden van vragen bij de experimenten
- Bijhouden van een labjournaal
Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat
| Weeknummer | Onderwerpen | Studiestof |
| 1 | ||
| 2 | ||
| 3 | ||
| 4 |
Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd op
Dit vak heeft een Blackboardsite. Hier vind je de noodzakelijke aanvullende informatie, zoals de groepsindeling van de practica en de opdrachten. Bekijk de Blackboardsite dus met grote regelmaat!