Microscopie en spectroscopie

Microscopy and Spectroscopy

6 EC

Semester 1, periode 1

50928MIS6Y

Eigenaar Bachelor Natuur- en Sterrenkunde
Coördinator dr. W.H. Roos
Onderdeel van Bachelor Natuur- en Sterrenkunde, jaar 2

Studiewijzer 2015/2016

Globale inhoud

Microscopische en spectroscopische technieken zijn hedentendage alom vertegenwoordigd in de moleculaire en cellulaire biofysica en medische fysica. Dit vak behandelt deze technieken, in het bijzonder die op het gebied van (i) optische microscopie (helder veld, beeldvorming, resolutie, fase contrast), (ii) fluorescentie microscopie (fluorescentie, fluoroforen, labeling, Förster resonance energy transfer; confocale, wide-field, TIRF, multifoton en superresolutie fluorescentie microscopie), (iii) atomaire krachtmicroscopie (AFM, beeldvorming, moleculaire manipulatie), (iv) optische pincetten (moleculaire manipulatie, moleculaire kracht en plaats bepaling) en (v) moleculaire vibraties (infrarood absorptie en Raman scattering). Naast de hoorcolleges zullen studenten in kleine groepjes een artikel over een behandelde techniek uitdiepen en daar een mondelinge presentatie over geven.

Leerdoelen

  • De student verwerft begrip van de fysische achtergronden van moderne microscopie- en spectroscopietechnieken die als doel hebben om de eigenschappen van levende materie in beeld te brengen op moleculaire schaal en kan deze kennis reproduceren.
  • De student verkrijgt inzicht in moderne toepassingsmogelijkheden van deze technieken in biofysisch en biomedisch onderzoek en klinische diagnose.
  • De student kan de verworven kennis toepassen in een nieuwe context. Specifiek doel is dat de student, gegeven een biofysische vraagstelling op moleculair, cellulair of weefselniveau, kan beslissen welke techniek het meest geschikt is om de vraag te beantwoorden.
  • De student leert (Engelstalige) wetenschappelijke literatuur over deze technieken en hun toepassingen te lezen en te verwerken.
  • De student leert te presenteren in de Engelse taal.

Onderwijsvormen

    Hoorcolleges over achtergronden en toepassingen van de technieken.
    Literatuuronderzoek en mondelinge presentatie.

    Verdeling leeractiviteiten

    Activiteit

    Aantal uur

    Hoorcollege

    42

    Tentamen

    2

    Zelfstudie

    124

    Toetsing

    Onderdeel en weging Details

    Eindcijfer

    100%

    Theorie

    25%

    Literatuurpresentatie en ingeleverde discussievragen

    75%

    Tentamen

    Toetsing
    In de cursus wordt op verschillende manieren getoetst:
    • een schriftelijk tentamen: dit bepaalt het cijfer voor 3/4,
    • de literatuurpresentatie en de ingeleverde discussievragen: samen bepalen ze het cijfer voor 1/4,
    Het schriftelijk tentamen gaat over de theoriestof (~70%) en de toepassingscolleges/literatuurpresentaties (~30%). De stof behelst al wat er in de colleges behandeld is en dus in de powerpoint handouts staat. Het bestaat uit een mengeling van open en meerkeuzevragen.

    Opdrachten

    Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:

    •    Naam opdracht 1 : beschrijving 2
    •    Naam opdracht 2 : beschrijving 1
    •    ....

    Fraude en plagiaat

    Dit vak hanteert de algemene ‘Fraude- en plagiaatregeling’ van de UvA. Onder plagiaat of fraude wordt verstaan het overschrijven van het werk van een medestudent dan wel het kopiëren van wetenschappelijke bronnen (uit bijvoorbeeld boeken en tijdschriften en van het Internet) zonder daarbij de bron te vermelden. Uiteraard is plagiaat verboden. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd en streng tegen opgetreden. Bij verdenking van plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Wanneer de examencommissie overtuigd is dat er plagiaat gepleegd is dan kan dit maximaal leiden tot een uitsluiting van al het onderwijs van de opleiding voor een heel kalenderjaar. Zie voor meer informatie over het fraude- en plagiaatreglement van de Universiteit van Amsterdam.www.uva.nl/plagiaat

    Weekplanning

    Weeknummer Onderwerpen Studiestof
    1
    2
    3
    4
    5
    6
    7
    8

    Rooster

    Contactinformatie

    Coördinator

    • dr. W.H. Roos