Cellular Physiology Practical
6 EC
Semester 1, periode 3
5042CEFP6Y
| Eigenaar | Bachelor Biologie |
| Coördinator | dr. T. Munnik |
| Onderdeel van | Minor Moleculaire en Cellulaire Biologie, jaar 1Bachelor Biologie, jaar 2Bachelor Bèta-gamma, major Biologie, jaar 3 |
Centraal in deze cursus staan 'Stress en Acclimatisatie (Adaptatie)'. De moleculaire mechanismes hierachter zijn vaak universeel, en cruciaal voor het leven van planten, dieren en micro-organismen. Er zal worden gewerkt met twee wetenschappelijke modelsystemen: de gist Saccharomyces cerevisae (bakkers gist) en de modelplant Arabidopsis thaliana (zandraket). Het prakticum is er op gericht om fysiologische verschillen op moleculair- en cellulair niveau zichtbaar te maken en te kwantificeren, en om met de belangrijkste basis technieken bekend te geraken. Aan bod zullen komen o.a. DNA- en eiwit extracties, PCR, restrictie-analyse, eiwit bepaling, SDS-PAGE, Western blot analyse, gen expressie (GUS, GFP), knock-out en over-expressie mutanten, fysiologische groei- en stress tolerantie assays, en fluorescentie microscopie/spectroscopie.
Alberts, Molecular Biology of the Cell, verplicht als naslagwerk.
Practikumklapper; aan te schaffen bij aanvang van de cursus (kostprijs, ca. €7,-).
Laboratoriumjas verplicht!
Aanvullend materiaal zal via Blackboard worden aangeboden.
Dit is een praktische cursus die er op is gericht een breder inzicht te verschaffen in de moleculaire en cellulaire biologie. Specifieke leerdoelen hierin zijn:
| Leerdoel 1 | Kennis en Begrip | De moleculaire en celbiologische technieken uit deze cursus kunnen beschrijven en uitleggen. |
| Leerdoel 2 | Toepassing | De technieken kunnen uitvoeren en interpreteren. |
| Leerdoel 3 | Analytisch | Kunnen aangeven of bedenken voor welke andere onderzoeksdoelen een bepaalde techniek gebruikt kan worden. De relaties tussen technieken kunnen zien. |
| Leerdoel 4 | Synthese | Met behulp van de geleerde technieken en kennis een onderzoeksplan kunnen ontwerpen en een verslag kunnen schrijven. |
Met het practicum zullen studenten in 3 groepen van ca. 2-3 personen werken onder begeleiding van een aio, analist of post-doc.
|
Activiteit |
Aantal uur |
|
Hoorcollege |
18 |
|
Practicum |
90 |
|
Verslag |
30 |
|
Extra studietijd |
30 |
|
Totaal 6EC * 28 |
168 |
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Aanvullende eisen voor dit vak:
Deelname aan de practica is verplicht. Aanwezigheid bij de twee inleidende hoorcolleges wordt sterk aangeraden aangezien deze de lading dekt voor de 3 weken practicum.
| Onderdeel en weging | Details | Opmerkingen |
|
Eindcijfer | ||
|
50% Verslag | Moet ≥ 5 zijn | |
|
50% Indruk | Moet ≥ 5 zijn | Beoordeeld op grond van inzet en inzicht |
Wie te laat of geen verslag inlevert, slaagt niet. Er is geen herkansing.
Waneer er een voldoende behaald wordt voor het practische gedeelte, dan kan men het jaar erop in aanmerking komen voor een vervangende schrijfopdracht. Dit zal een verslag worden van een literatuuronderzoek van een actueel onderzoeksproject.
Verslagen in het Engels zullen met een bonuspunt beloont worden. Bij slecht Engels kan er aftrek plaatsvinden maar nooit meer dan het Bonuspunt.
Om een inzagemoment aan te vragen, kun je contact opnemen met je begeleider.
Aan het einde van het practicum zal er een verslag moeten worden ingeleverd. Verslagen in het Engels verdienen een bonus.
Onderstaande opdrachten komen aan bod in deze cursus:
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: www.uva.nl/plagiaat
| Weeknummer | Onderwerpen | Studiestof |
| 1 | ||
| 2 | ||
| 3 | ||
| 4 |
Het rooster van deze cursus wordt gepubliceerd op
Alle practicumdagen zijn verplicht. Bij ziekte of zwaarwegende verhindering (e.g. begrafenis) dient men zich van tevoren per email af te melden bij zowel de coördinator als de practicumbegeleider. Als je om aantoonbare zwaarwegende redenen niet kunt voldoen aan het gewenste, dien je je voorafgaand aan het toetsingsmoment (inleveren verslag) te melden bij de studieadviseurs. In geval van aantoonbaar zwaarwegende omstandigheden wordt er dan in samenspraak met de docent gekeken of er een andere oplossing mogelijk is.
Dit vak heeft een Blackboardsite. Hier vind je de noodzakelijke aanvullende informatie, zoals de groepsindeling, opdrachten, resultaten, etc. Bekijk de Blackboardsite met grote regelmaat!
Bij het practicum is het dragen van een laboratoriumjas verplicht!