Knopentheorie en Moleculen: honours

Knot Theory and Molecules: honours

Studiewijzer 2025/2026

Globale inhoud

Bij dit college leer je de beginselen van knopentheorie en past ze toe op moleculen. Knopentheorie is een jonge en actieve tak van wiskunde, die gebruik maakt van topologische begrippen en resultaten. Tijdens college zal de nadruk liggen op de denkwijze achter de topologische methoden (en niet zozeer op de technische details). Knopentheorie wordt in de praktijk toegepast om de topologie en chiraliteit van moleculen te analyseren, en in het tweede deel van het college zul je knopentheorie toepassen op DNA, knoopmoleculen, en moleculaire Möbiusladders. Een van de leuke dingen van knopentheorie is dat er nog volop onopgeloste vragen zijn, waarvan we sommige zullen tegenkomen tijdens college.

Studiemateriaal

Literatuur

• Erica Flapan, "Knots, Molecules and the Universe" (AMS). Dit boek is gratis te downloaden bij de UBA. 

Leerdoelen

• Basisconcepten uit de topologie (genus, orienteerbaarheid) en knopentheorie (equivalentie van knopen, Reidemeister moves, knopeninvariant,...) kunnen uitleggen en illustreren met voorbeelden.
• Invarianten (waaronder het Jones-polynoom) van een knoop kunnen berekenen en toepassen.
• De topologische chiraliteit van een molecuul kunnen bepalen.
• Knopentheorie kunnen gebruiken om de topologische eigenschappen van moleculen zoals DNA te beschrijven.

Onderwijsvormen

• Hoorcollege
• Werkcollege
• (Computer)practicum

Verdeling leeractiviteiten

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Van elke student wordt actieve deelname verwacht aan het onderdeel waarvoor hij staat ingeschreven.
• Als een student door overmacht niet aanwezig kan zijn bij een verplicht onderdeel van het onderdeel, dient hij dit zo snel mogelijk schriftelijk te melden bij de betreffende docent. De docent kan, eventueel na overleg met de studieadviseur, besluiten om de student een vervangende opdracht op te leggen.
• Het is niet toegestaan om verplichte onderdelen van een onderdeel te missen als er geen sprake is van overmacht.
• Bij kwalitatief of kwantitatief onvoldoende deelname, kan de examinator de student uitsluiten van verdere deelname aan het onderdeel of een gedeelte daarvan. Voorwaarden voor voldoende deelname worden van te voren vastgelegd in de studiewijzer en/of op Canvas.

Toetsing

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Contactinformatie

Coördinator

• prof. dr. S. Woutersen