Medische Microbiologie

Medical Microbiology

6 EC

Semester 1, periode 2

5052MEMI6Y

Eigenaar Bachelor Biomedische Wetenschappen
Coördinator dr. Y. Pannekoek
Onderdeel van Bachelor Bèta-gamma, major Biomedische Wetenschappen, jaar 3Bachelor Biomedische Wetenschappen, specialisatie Patientgericht Onderzoek, jaar 3
Links Zichtbare leerlijnen

Studiewijzer 2025/2026

Globale inhoud

Colleges Bacteriologie:

  • Inleiding Bacteriologie
  • Microbiële diagnostiek
  • Neisseria meningitidis, epidemiologie
  • Vaccins
  • Bloedbaan infecties, sepsis
  • Endocarditis en innate defense
  • Urineweg infecties
  • SOA's en Zoönoses
  • Darminfecties
  • Luchtweginfecties

Practicum Bacteriologie:

  • Analyse van bacteriele membraaneiwitten; kapseltypering
  • Buitenmembraaneiwitten, beschermende antistoffen en vaccinontwikkeling

Colleges Parasitologie:

  • Malaria cyclus, epidemiologie, pathogenese en behandeling
  • Malaria diagnostiek: microscopie, antigeentests en DNA detectie
  • Darmparasieten: Protozoa
  • Darmparasieten: Helminthen

Practicum Parasitologie:

  • Malaria diagnostiek

Colleges Virologie:

  • Inleiding Virologie
  • Virus entry en exit
  • Arbo virussen
  • Hepatitis C virus (HCV)
  • Human Immunodeficiency virus (HIV)
  • Picornavirussen
  • Morbillivirussen
  • Rhabdovirussen
  • Herpesvirussen
  • Humaan Papillomavirus (HPV)
  • Rota- en Norovirussen

Studiemateriaal

Syllabus

  • Practicumhandleiding om te printen wordt digitaal door de cursusleiding verstrekt.  Er zijn maar enkele geprinte exemplaren voorhanden, tegen geringe vergoeding.

Practicummateriaal

  • Laboratoriumjas en labjournaal dienen door de studenten zelf meegebracht te worden.

Leerdoelen

  • De student kan de behandelde onderzoeksmethoden uitvoeren
  • De student kan begrippen uit de medische microbiologie en epidemiologie toepassen
  • De student kan zelfstandig informatie verzamelen uit studieboeken en wetenschappelijke literatuur.
  • De student kan een schriftelijk overzicht opstellen over een specifiek virus in de vorm van een literatuurverslag aan de hand van een aantal aspecten van het virus.
  • De student kan middels adequate software de phylogenetische relatie tussen een aantal virussen op basis van hun sequentie vaststellen.
  • De student kan de volgende concepten herkennen en beschrijven, en er constructief over redeneren: verschillende soorten infectieziekten en bacteriën, virussen en parasieten, die deze ziekten veroorzaken, traditionele en moderne diagnostiek, mechanismen van pathogenese van microbiele infecties, interactie met de gastheer, afweermechanismen van de gastheer, immune evasion, de wijze van infectie en transmissie, en mogelijkheden tot preventie en behandeling.
  • De student kan middels LabBuddy practica voorbereiden, uitvoeren en de resultaten evalueren

Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • (Computer)practicum
  • Zelfstudie
  • Zelfstandig werken aan bijv. project/scriptie
  • Begeleiding/feedbackmoment
  • Werkcollege

Verplichte (werk)colleges, practicum, literatuurstudie en presentaties.
In de hoorcolleges wordt de leerstof behandeld welke wordt getoetst in het tentamen. Er is gelegenheid tot het stellen van vragen. Het practicum start met een verplicht voorcollege. Alle practica zijn verplicht.  Ieder practicumonderdeel is gekoppeld aan een verplicht inleidend Labbuddy onderdeel. De colleges  worden op Canvas geplaatst. Aan de hand van de Labbuddy en de practicumhandleiding worden de experimenten in groepjes uitgevoerd, waarbij assistentie aanwezig is. De resultaten van de proeven worden genoteerd in het labjournaal, dat de studenten zelf mee dienen te brengen! Het practicum wordt getoetst met een "open labjournaal tentamen" waarbij het labjournaal en de practicumhandleiding gebruikt mogen worden voor het beantwoorden van de vragen. Voor de opdrachten Virologie worden verslagen ingeleverd die worden beoordeeld. Het practicum Parasitologie wordt tijdens de uitvoering beoordeeld en dient voldoende te zijn.

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Aantal uur

Computerpracticum

10

Hoorcollege

26

Practicum

21

Tentamen

6

Zelfstudie

6

Zelfstudie

99

Aanwezigheid

  • Voor sommige studieonderdelen geldt een aanwezigheidsplicht. Indien er een aanwezigheidsplicht geldt, dan staat dit aangegeven in de studiegids die te raadplegen is via de UvA-website. De onderbouwing voor, en invulling van, deze aanwezigheidsplicht kan per vak verschillen, en is indien van toepassing opgenomen in deze studiewijzer.

    • Aanvullende eisen voor dit vak:

    Aanwezigheid bij practicum voorcollege's  en practica is verplicht, zie hierboven. De practica zijn een verdieping en uitbreiding van de hoorcolleges, waarbij de stof van de hoorcolleges bekend wordt verondersteld. Het volgen van de hoorcolleges is dus feitelijk essentieel.  

    Toetsing

    Onderdeel en weging Details

    Eindcijfer

    1 (100%)

    Deeltoets digitaal 1

    Opdrachten

    Opdrachten practica

    • Er wordt in de practica een aantal opdrachten bewerkt, en er wordt een labjournaal bijgehouden om over het tentamen een "open labjournaal" toets te kunnen maken. In deze toets worden vragen gesteld over het practicum, zowel over de resultaten als de interpretatie hiervan.
      In het onderdeel Virologie worden individuele computer- en schrijfopdrachten uitgevoerd.

    Fraude en plagiaat

    Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

    Weekplanning

    Weeknummer Onderwerpen Studiestof
    1
    2
    3
    4
    5
    6
    7
    8

    Aanvullende informatie

    Deze cursus Medische Microbiologie is verplicht voor  inschrijving voor de aansluitende cursus , maar geeft geen recht op plaatsing.
    Voor het doen van een bachelorproject bij de afdeling medische microbiologie worden de cursus Medische Microbiologie (6 EC) en de aansluitende cursus Practicum Medische Microbiologie (6 EC) sterk aanbevolen.
    Locatie: AMC (exacte plaats wordt door coordinator bekend gemaakt)

    Maximum 64 studenten.

    Verwerking feedback studenten

    Het practicum en de college's zijn naar aanleiding van suggesties uit de evaluatie 2024-2025 aangepast.  

    Contactinformatie

    Coördinator

    • dr. Y. Pannekoek

    Docenten

    • drs. Leonie de Boer
    • ing. S. Bovenkerk
    • dr. M.J. van Gils
    • dr. A. Hendriks
    • dr. Lia van der Hoek
    • dr. A.C. van der Kuyl
    • dr. P.F. Mens
    • dr. H.D.F.H. Schallig
    • ing. K. Schipper
    • prof. N. van Sorge
    • dr. A. Sridhar
    • dr. K.C. Wolthers
    • dr. Bas Zaat
    • dr. Karin van Dijk