Cell Regulation and Imaging
12 EC
Semester 2, periode 4
5052CIB12Y
Het microscopiseren van levende cellen heeft een revolutie in de celbiologie veroorzaakt en is cruciaal voor het begrijpen van kanker en de daaraan gerelateerde therapeutische strategieën. In de cursus celregulatie in beeld word je ingeleid in de geheimen van de levende cel microscopie geïllustreerd aan het klinisch uiterst relevante probleem kanker, huntington en andere ziektes. De cursus is half theoretisch en half praktisch en heeft tot doel de student in te voeren in de moderne moleculaire celbiologie van dynamische structuren in levende cellen en weefsels. Nadruk zal worden gelegd op subcellulaire communicatie, dynamische structuren in cellen (zoals het cytoskelet) en moleculaire mechanismen en regulatie van celdeling. Deze aspecten vormen de basis van celregulatie die kan leiden tot celdifferentiatie vanuit stamcellen, apoptose, of kanker. Tevens zullen methodologische aspecten van celbiologische technieken aan de orde komen, zoals moderne lichtmicroscopische technieken, labelingstechnieken, beeldanalyse, en klinische diagnostiek in relatie tot carcinogenese. Het belangrijkste leerdoel is de koppeling tussen theorie en onderzoekspraktijk. Niet alleen: hoe werkt het op papier (in het tekstboek), maar hoe doe je onderzoek hieraan en wat zijn de vragen waarmee men momenteel worstelt. Dit vak bouwt voort op “Moleculaire Technieken” en "Moleculaire Celbiologie” en sluit aan bij “Frontiers in Medical Biology”.
De master track “Cell Biology and Advanced Microscopy” sluit naadloos aan bij dit vak.
Molecular Biology of the Cell, (Alberts) 7e editie, hoofdstukken 9, 15-18 & 20-22
Biology of Cancer by R. Weinberg, chapters 2, 3, 10, 11, 12 en 14
Slides behorende bij de colleges
Laboratoriumjas
De practicumhandleiding wordt verstrekt of is online beschikbaar
Een laptop met USB port
ImageJ of FIJI
Dit vak bestaat uit een theoretisch gedeelte en een praktisch gedeelte.
Activiteit | Uren | |
Hoorcollege | 30.5 | |
Laptopcollege | 48 | |
Practicum | 64 | |
Presentatie | 30 | |
Tentamen | 2 | |
Vragenuur | 2 | |
Werkcollege | 6 | |
Zelfstudie | 153.5 | |
Totaal | 336 | (12 EC x 28 uur) |
Aanvullende eisen voor dit vak:
Aanwezigheid bij de hoorcolleges en werkcolleges die voorbereiden op het tentamen en onderdeel zijn van de theorie is niet verplicht, maar wordt sterk aanbevolen. Voor de practicum periode (week 10-11-12) geldt een strikte aanwezigheidsplicht (en dat geldt ook voor de (computer)practica, hoor- en werkcolleges in de practicumperiode). Deze activiteiten bevatten essentiele instructies die noodzakelijk zijn om het practicum op een efficiente en veilige manier te doen.
Ben je vaker dan 1 dag afwezig bij de practica dan wordt er geen eindcijfer geregistreerd.
Als je ivm persoonlijke omstandigheden (denk hierbij aan ziekte of bijzondere familieomstandigheden) niet kunt deelnemen aan een verplichte onderwijsbijeenkomst, kijk dan op de Canvaspagina voor de procedure. Een skivakantie is geen geldige reden om het practicum te missen.
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer | |
|
1 (100%) Tentamen |
Het tentamen bestaat uit 40 meerkeuze vragen. De normering van het tentamen is als volgt:
Voor een 5.0 heb je 23 goede antwoorden nodig. Voor elk goed antwoord komt er 0,3 punt bij (en gaat er 0,3 af per fout antwoord).
(Bij 40 vierkeuze vragen kan verwacht worden dat er 10 goed zijn als je willekeurig de antwoorden geeft. Dan moet je voor de overgebleven 30 vragen de helft, 15, goed hebben, dus totaal 25. Echter, de grens is enigzins soepeler en ligt dus bij 23 goede antwoorden.
Het eindcijfer is het gemiddelde van het theoriedeel (tentamen) en het praktijkdeel. Het deelcijfer (praktijk of theorie) moet minimaal (onafgerond) 5,0 zijn.
De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer (na afronding) 6 of hoger bedraagt. Het cijfer 5,50 wordt afgerond naar een 6 en het cijfer 5,49 wordt afgerond naar een 5. Alle andere getallen worden afgerond op halve cijfers, bijvoorbeeld een 7,38 wordt een 7.5.
Een student die een eindcijfer behaalt dat lager is dan 6 moet het tentamen herkansen. Het praktijkcijfer blijft onbeperkt geldig.
Om een inzagemoment aan te vragen, kun je contact opnemen met de coördinator.
Voor het praktische deel wordt het labjournaal beoordeeld en er moet ter afsluiting van het practicum een onderzoeksverslag ingeleverd worden.
De projectweek wordt afgesloten met een presentatie die beoordeeld wordt.
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
| Weeknummer | Onderwerpen | Studiestof |
| 1 | ||
| 2 | ||
| 3 | ||
| 4 | ||
| 5 | ||
| 6 | ||
| 7 | ||
| 8 |
Since twee jaar heet het vak "Celregulatie in beeld" en het was voorheen "Cellulaire Oncologie". De nieuwe titel dekt de inhoud beter en we hopen dan ook dat de verwachting die de studenten van het vak hebben beter overeenkomt met de onderwerpen die aan bod komen.
Dit jaar is het practicum volledig opnieuw ingericht. Het practicum is nu één geheel (ipv van meerdere loshangende onderdelen) en wordt getoetst aan de hand van het onderzoeksverslag. Dit beantwoordt aan de wens van studenten om langer te kunnen werken aan hun eigen onderzoek mbt een experiment aan een cellijn die Huntiungton eiwit tot expressie brengt. Daarnaast zit er een veel duidelijkere en logische opbouw in het practicum (eerst aanleren van vaardigheden en vervolgens deze toepassen in een eigen onderzoekje).
Daarnaast is er slecht één verslag met een duidelijke instructie, ipv van meerdere verslagen/presentaties zonder goede instructie.
Communicatie met de coordinator Joachim Goedhart:
Via email: celregulatie.in.beeld@gmail.com
Persoonlijk: Science Park 904, kamer C2.264