Ecofysiologie

Ecophysiology

6 EC

Semester 2, periode 5

5042ECOF6Y

Eigenaar Bachelor Biologie
Coördinator dr. M. Kant
Onderdeel van Bachelor Biologie, jaar 1
Links Zichtbare leerlijnen

Studiewijzer 2025/2026

Globale inhoud

Het vak biedt inzicht in de relatie tussen de verschijningsvorm van een organisme en z’n leefomgeving. Het vak vereist geen speciale voorkennis maar Biologie op middelbare school niveau is een pre. Het vak overkruist de vakgebieden van de gedragsbiologie, planten- en dierenfysiologie, neurobiologie, ecologie en evolutie in vogelvlucht en biedt naast kennis vooral inzicht in biologische interacties en ervaring met het opzetten van experimenteel onderzoek. De onderwerpen zijn:

    • Variatie en plasticiteit in fysiologie van planten en dieren;
    • De invloed van klimaatverandering op fysiologie;
    • De invloed van de biotische en abiotische leefomgeving op fysiologie;
    • De verdediging van planten en dieren tegen belagers (herbivoren, predatoren, parasitoiden en parasieten) en andere vormen van stress;
    • Fysiologische variatie gedurende de levensloop en levenscycli van organismen;
    • De fysiologie van het vermogen van planten en dieren om hun omgeving waarnemen;
    • Zoekgedrag, migratie, oriëntatie en leergedrag van dieren.

 

 

Studiemateriaal

Overig

  • Na ieder college verschijnen de slides op Canvas, voorzien van een begeleidende tekst inclusief de verwijzingen naar de relevantie hoofdstukken en paragrafen uit het boek.

     

    We gebruiken enkele hoofdstukken uit het boek “Plant Physiology and Development” (Taiz et al, 6e editie). Overig materiaal wordt als losse teksten toegevoegd aan het collegemateriaal op canvas.

Leerdoelen

  • Kennis en inzicht verkrijgen in de interacties van organismen met hun biotische en abiotische omgeving en hoe selectie in deze milieus de plasticiteit van hun fysiologie bepaalt.
  • Uitvoeren van onderzoek en toetsen van zelf-geformuleerde hypothesen.
  • Het lezen van wetenschappelijke literatuur (Engels) ter onderbouwing van een onderzoeksvraag
  • Het formuleren van een toetsbare hypothese en deze uitwerken in de vorm van ‘aims & objectives’ (het ‘doel’ en het ‘stappenplan’)
  • Het ontwerpen van een experiment, rekening houdende met dataverwerking, en in een groep tot consensus komen en taken verdelen
  • Het uitvoeren van een experiment en onderzoeksgegevens verzamelen op basis van een planning
  • Het uitwerken van onderzoeksgegevens door middel van gangbare methodes in statistiek en datapresentatie
  • Het rapporteren van onderzoeksresulaten m.b.v. een digitale poster

Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • (Computer)practicum
  • Presentatie/symposium
  • Zelfstudie
  • Begeleiding/feedbackmoment

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Uren

Hoorcollege

24

Practicum

64

Tentamen

3

Vragenuur

2

Zelfstudie

84

Totaal

168

(6 EC x 28 uur)

Aanwezigheid

  • Voor sommige studieonderdelen geldt een aanwezigheidsplicht. Indien er een aanwezigheidsplicht geldt, dan staat dit aangegeven in de studiegids die te raadplegen is via de UvA-website. De onderbouwing voor, en invulling van, deze aanwezigheidsplicht kan per vak verschillen, en is indien van toepassing opgenomen in deze studiewijzer.
  • Aanvullende eisen voor dit vak:

    Het is sterk aanbevolen om deel te nemen aan alle geplande onderwijsactiviteiten. Door dit te doen, draag je actief bij aan de levendige leergemeenschap die we bij de bachelor Biologie  koesteren. Jouw bijdrage en aanwezigheid bepalen in grote mate de kwaliteit van de onderwijsactiviteiten en je kansen om het vak succesvol af te ronden. De aangewezen verplichte activiteiten spelen een cruciale rol bij het behalen van de cursusdoelstellingen en zijn essentieel voor je algehele voortgang. Door je in te schrijven voor deze cursus ga je akkoord met de regels omtrent aanwezigheid en stem je ermee in actief deel te nemen aan de verplichte activiteiten.

    Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B): Deelname aan alle practica, computerpractica, veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht. Eventueel aanvullende eisen worden per onderdeel in deze studiewijzer omschreven. Hier staat ook beschreven wat de eventuele consequenties zijn van het niet nakomen van deze verplichting.

    Aanvullende eisen voor dit vak:

    Bovenstaande aanwezigheidsplicht geldt voor alle onderdelen m.u.v. de hoorcolleges. Afwezigheid bij een verplicht onderdeel resulteert in een “NAV” (niet aan voldaan) voor het betreffende onderdeel en daardoor ook voor de cursus als geheel.

    Het inhalen van onderdelen van het practicum binnen het lopende cursusjaar is niet mogelijk omdat de kennis en vaardigheden vanwege het benodigde materieel en de veiligheid alleen onder supervisie tijdens de verplichte onderwijsonderdelen worden opgedaan. Ook staan de practica grotendeels in het teken van groepsopdrachten. Aanwezigheid en actieve deelname aan de leeractiviteiten in de werkcolleges is cruciaal voor het groepswerk en is onderdeel van de eindbeoordeling. De leerstof verbonden aan de practica is niet slechts feitenkennis uit de literatuur, maar komt ook voort uit het verwoorden en toepassen van de ideeën, theorieën en concepten op basis van literatuur. Daarom wordt de kwaliteit van de practica voor een groot deel bepaald door de aanwezigheid, voorbereiding en actieve participatie van iedere student.

    Mocht je wegens persoonlijke omstandigheden (denk hierbij aan ziekte of bijzondere familieomstandigheden) niet kunnen deelnemen aan een verplichte onderwijsbijeenkomst, neem dan direct per e-mail contact op met de vakcoördinator en de begeleider van je practicumgroep. De vakcoördinator bespreekt dan met je of je in aanmerking komt voor de vervangende opdracht ter compensatie van de afwezigheid. In de regel zal je hiervoor in aanmerking komen indien de afwezigheid over de gehele cursusperiode niet meer dan twee cursusdagen betreft. Deze vervangende opdracht bestaat uit het schrijven van een uitgebreid practicumverslag over het gehele practicum.

    Toetsing

    Onderdeel en weging Details

    Eindcijfer

    0.8 (80%)

    Tentamen

    0.2 (20%)

    Practical

    Eindcijfer na herkansing

    0.8 (80%)

    Hertentamen

    0.2 (20%)

    Practical

    Het schriftelijk tentamen vindt aan het eind van de cursus plaats. Het beslaat 1 open vraag per hoorcollege en elke open vraag zal uit meerdere onderdelen bestaan. Het gastcollege wordt niet getentamineerd. Om tenminste 6 uur zelfstudietijd per tentamenvraag te hebben zal het onderwerp Plant-plant interacties getentamineerd worden binnen dezelfde tentamenvraag als het college “Verdediging bij Planten”.

    Het tentamen zal dus bestaan uit 8 open vragen die elk 1/8e van het eindcijfer van het schriftelijk tentamen uitmaken en welke de stof uit de volgende hoorcolleges toetsen:

    1. Het Abiotisch Milieu
    2. Het Biotisch Milieu
    3. Plant-Plant Interacties & Verdediging bij Planten
    4. Sensorische Systemen
    5. Chemische Communicatie
    6. Fenotypische Plasticiteit
    7. Levenscycli
    8. Verdediging bij Dieren

    Het eindcijfer van het schriftelijk tentamen is het gemiddelde van de score per vraag waarbij elke vraag even zwaar meetelt. De weging van de onderdelen worden voor elke vraag in het tentamen vermeld. Er worden vóór het vragenuurtje oefenvragen beschikbaar gesteld op Canvas.

    Het practicum wordt individueel beoordeeld en op basis van de groepsposter.

    De poster wordt beoordeeld door de docenten en practicumbegeleiders op basis van een rubric en heeft betrekking op: (1) hoe efficiënt is de poster in het duidelijk maken van de vraagstelling met de nadruk op de ‘aims & objectives’; (2) hoe efficiënt is de poster in het rapporteren van de voornaamste uitkomsten en (3) hoe efficiënt is de poster in het overbrengen van de conclusie(s). De voertaal op de poster is Engels. Aan het eind van de cursus presenteert elk practicumgroepje z’n poster(s) aan de andere groepen: deze presentaties zijn ook in het Engels maar worden niet apart beoordeeld.

    De practicumcijfers worden rekenkundig gemiddeld waarbij het individuele cijfer twee maal zo zwaar meetelt als het postercijfer. Het practicumcijfer maakt 20% van het eindcijfer van de cursus uit. Het schriftelijk tentamen maakt 80% van het eindcijfer van de cursus uit. Het eindcijfer is het gewogen gemiddelde van deze twee cijfers.

    Voor het practicum moet minimaal een 5.5 worden gehaald. Voor het schriftelijk tentamen moet minimaal een 5.0 worden gehaald. Je bent voor de module geslaagd wanneer het gewogen gemiddelde van tentamen en practicum gelijk of hoger is dan 6.0 (waarbij een 5.50 naar een 6.0 wordt afgerond). Hierbij gelden de regels uit het OER.

    Inzage toetsing

    Studenten kunnen hun tentamen inzien nadat het beoordeeld is volgens de regels van het OER.

    Opdrachten

    Het practicum bestaat uit het opzetten van een experiment op basis van “aims & objectives” (zie ‘leerdoelen’) en eventueel een hypothese. Aan het eind van het practicum vervaardig je groepsgewijs een poster waarop het practicumwerk aan het eind van de cursus gepresenteerd wordt. De instructies voor het maken van de poster vind je op Canvas. De poster wordt beoordeeld door de docenten en practicumbegeleiders.

    Fraude en plagiaat

    Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

    Weekplanning

    Zie rooster op rooster.uva.nl en overige informatie op canvas

    Aanvullende informatie

    Dit vak heeft een Canvas-site. Hier vind je de noodzakelijke aanvullende informatie, zoals de groepsindeling van de werkcolleges, de opdrachten. Bekijk de Canvassite dus met grote regelmaat

    Verwerking feedback studenten

    De studenten van vorig jaar waren tevreden over de practica maar vonden groepen van 10-12 studenten erg groot. We zijn het daar mee eens en we proberen elk jaar de practicumgroepen op te delen in kleinere groepen maar helaas is dat logistiek niet altijd mogelijk. Op verzoek van de opleidingscommissie hebben we de leerdoelen van de cursus kritisch bekeken en laten we het practicum dit jaar voor 20% meewegen in het eindcijfer. Ook gaven sommige studenten in de evaluatie aan dat ze graag vooraf toegang willen tot de PowerPoint presentaties van de hoorcolleges. Dat is inderdaad wel de bedoeling: soms vergeten docenten dat en dus raden we de studenten aan dit bij aanvang van het hoorcollege te melden zodat ze alsnog kunnen worden gedeeld.

    Contactinformatie

    Coördinator

    • dr. M. Kant

    Docenten

    • dr. M. Bruijning
    • dr. E.R. Burdfield-Steel
    • Charlene Diepenbroek-Barker PhD
    • Lin Dong BSc
    • L.M. van den Hout
    • M. Kuijt MSc
    • Peter Roessingh
    • Christel Rooker
    • X.J. Schrama
    • dr. Dorian Swarts
    • dr. Ernesto Villacís Pérez PhD
    • Nine Walta
    • dr. ir. Michiel van Wijk