Experimentatie - Hodgkin & Huxley en Neurofarmacologie

Experimentation - Hodgkin & Huxley and Neurofarmacology

Studiewijzer 2024/2025

Studiemateriaal

Syllabus

• zie canvas

Software

• zie canvas

Leerdoelen

• De door Hodgkin en Huxley (H&H) voorgestelde principes om de voltage-afhankelijke kanalen te charakteriseren begrijpen en in een computationeel model kunnen identificeren.
• Begrijpen hoe 'real-life' situatie gemodelleerd kunnen worden en de met behulp van een computationeel model verkregen resultaten kunnen vertalen naar toepassingen in de echte wereld.
• De veranderingen in membraan potentiaal gedurende een actiepotentiaal kunnen uitleggen aan de hand van (de kinetiek van) de activatie en inactivatie van natrium en kalium kanalen en de bijbehorende drijvende krachten achter deze processen.
• Begrijpen hoe het rustmembraanpotentiaal tot stand komt door de eigenschappen van ionkanalenpermeabiliteit en dit fenomeen in een computationeel model kunnen herkennen.
• Een wetenschappelijke figuur kunnen maken waar methode en resultaten duidelijk en compleet gepresenteerd worden.
• Ontwikkel of onderhoud vaardigheden in het onderzoeken van digitale informatiebronnen (bijv. PubMed) over de eigenschappen van natrium- en kaliumkanalen en in het organiseren en kritisch evalueren van de inhoud van de informatie (literatuur).
• Efficient samenwerken aan een wetenschappelijk project.
• Uitleggen hoe een bepaalde drug zijn target (bv. ionkanalen) beïnvloedt en interpreteren wat de invloed van de stof zal zijn op de actiepotentiaal (voortgeleiding).
• Vaardigheid krijgen in het opstellen en uitvoeren van een onderzoeksplan in verschillende fasen, zoals het formuleren van een probleemstelling, een vraagstelling, een hypothese aan de hand van relevante literatuur en het verzamelen, verwerken en kritisch interpreteren van gegevens en hieruit voor vakgenoten acceptabele conclusies kunnen trekken.
• De juiste statistiek toepassen op de verkregen dataset.
• Een verslag maken in het Engels, waarin vaardigheid wordt opgedaan in het formuleren van: een probleemstelling, een vraagstelling, een hypothese aan de hand van relevante literatuur, de uitgevoerde experimenten en het verwerken en kritisch interpreteren van gegevens en hieruit voor vakgenoten acceptabele conclusies kunnen trekken.

Onderwijsvormen

• Werkcollege
• Laptopcollege
• Presentatie/symposium
• (Computer)practicum
• Zelfstudie

Verdeling leeractiviteiten

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Deelname aan alle practica, computerpractica, veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht. Eventueel aanvullende eisen worden per onderdeel in de studiewijzer omschreven. Hier staat ook beschreven wat de eventuele consequenties zijn van het niet nakomen van deze verplichting.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Deelname aan alle practica, werkcolleges en laptopcolleges is verplicht. Bij zwaar wegende redenen voor afwezigheid neem contact op met je docent voor overleg.

Toetsing

Voor beoordelingsmodellen en opdrachtbeschrijvingen zie canvas.

Inzage toetsing

Toetsing kan op verzoek bij de coördinator ingezien worden.

Opdrachten

Werkbespreking in groepen van 2 (bij uitzondering 3), zie canvas voor instructies en beoordeling

Verslag in groepen van 2 (bij uitzondering 3), zie canvas voor instructies en beoordeling

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Eindtermen

Deze cursus draagt bij aan de volgende eindtermen van de opleiding Psychobiologie:

1) Kennis en Inzicht

De afgestudeerde

• 1a) kan de basisprincipes uit de vakgebieden ‘genetica en evolutie’, ‘celbiologie’, ‘biochemie’, ‘fysiologie’, ‘embryologie’, ‘anatomie’ en ‘evolutie en gedrag’ uitleggen.
• 1b) kan de ontwikkeling en werking van het brein op alle niveaus – van molecuul tot de menselijke geest – binnen Psychobiologie, voornamelijk de deelgebieden ‘perceptie tot bewustzijn’, ‘leren en geheugen’, ‘emotie’, ‘motivatie’, ‘neuroanatomie’ en ‘neurofysiologie’ uitleggen.
• 1c) kan de pathofysiologie en bijbehorende diagnostische methoden en mogelijke therapieën uitleggen.
• 1d) kan uitleggen welke onderzoekstechnieken nodig zijn voor het ontwikkelen van kennis en dat kennis nodig is voor het ontwikkelen van onderzoekstechnieken.
• 1h) kan uitleggen wat de bijdragen en beperkingen zijn van de kennis op elk niveau - van molecuul tot de menselijke geest - aan het wetenschapsgebied Psychobiologie.
• 1k) kan grensverleggende ontwikkelingen in het wetenschapsgebied Psychobiologie herkennen.

2) Toepassen Kennis en Inzicht

De afgestudeerde

• 2a) kan onderbouwen welke onderzoekstechnieken nodig zijn om onderzoeksvragen binnen het wetenschapsgebied Psychobiologie te beantwoorden.
• 2b) kan ondersteunende disciplines zoals wis-, natuur- en scheikunde en programmeren* toepassen.
• 2c) kan de empirische cyclus zelfstandig doorlopen bij het uitvoeren van een onderzoek.
• 2d) kan op een wetenschappelijke manier lopende experimenten documenteren.
• 2e) kan algemene laboratoriumvaardigheden uitvoeren.
• 2f) demonstreert te kunnen werken met proefpersonen, relevante (proef)dieren en materiaal van biologische oorsprong en demonstreert te kunnen werken met de aldus verkregen gegevens.
• 2g) kan voor de psychobiologie relevante computerprogramma’s en/of programmeertalen gebruiken.
• 2h) kan ruwe data interpreteren en een geschikte (kwantitatieve) analysemethode toepassen.
• 2i) kan werken volgens algemene milieu- en veiligheidsnormen.
• 2j) kan redeneren en argumenteren en meerdere standpunten benoemen en onderbouwen.

* Deze eindterm geldt voor studenten die gestart zijn vanaf studiejaar 2014/2015

3) Oordeelsvorming

De afgestudeerde

• 3a) kan relevante literatuur verzamelen, verwerken en interpreteren.
• 3b) kan de implicaties van onderzoeksresultaten voor de maatschappij overzien.
• 3c) kan onderzoeksresultaten binnen de Psychobiologie en/of binnen een discipline- overstijgende context interpreteren.
• 3d) kan de ethische aspecten van beroepsmatige omgang met levende organismen en weefsel overwegen.

4) Communicatie

De afgestudeerde

• 4a) kan kennis, bevindingen in wetenschappelijk Nederlands en Engels schriftelijk rapporteren en mondeling presenteren.
• 4b) kan een bijdrage leveren aan wetenschappelijke discussies.
• 4c) kan op basis van begrip en respect communiceren.
• 4d) kan onderzoeksgegevens communiceren volgens de regels van wetenschappelijke integriteit.

5) Leervaardigheden

De afgestudeerde

• 5a) kan een zelfstandige en wetenschappelijke werkwijze en houding ontwikkelen.
• 5b) kan zich zelfstandig kennis eigen maken.
• 5c) kan nieuwe kennis integreren met aanwezige kennis en tot inzichten komen.
• 5d) kan een constructieve en synergetische manier van samenwerken ontwikkelen.
• 5e) kan zich in een zelfgekozen deelgebied verdiepen of verbreden.
• 5f) kan zich nieuwe technische vaardigheden eigen maken.
• 5g) kan feedback geven en verwerken.
• 5i) kan reflecteren op eigen gedrag en dit gedrag desgewenst verbeteren.

Contactinformatie

Coördinator

• dr. Julia Dawitz