Experimentation - Molecular Celbiology
3 EC
Semester 2, periode 5
5102EXMC3Y
| Eigenaar | Bachelor Psychobiologie |
| Coördinator | Vincent Blum |
| Onderdeel van | Bachelor Psychobiologie, jaar 2 |
| Links | Zichtbare leerlijnen |
Tijdens deze cursus ontwikkelt de deelnemer praktische vaardigheden in de moleculaire biologie en biochemie. De zgn. moleculaire technieken die hierbij gebruikt worden vormen de basis van de vakgebieden moleculaire biologie en biochemie, en worden derhalve vaak toegepast in het celbiologisch onderzoek. Ook zal kennis worden gemaakt met een aantal bioinformatica hulpmiddelen en computerprogramma’s die in deze disciplines veel worden gebruikt. Er wordt tijdens het practicum onderzoek gedaan naar de functionele consequenties van mutaties in de humane glucocorticoïd receptor op DNA- en eiwitniveau. Er wordt aan een experiment gewerkt met een aanpak en planning die zeer dicht bij een werkelijke onderzoekssituatie ligt.
Molecular Biology of the Cell, 5e Editie of nieuwer (aanbevolen)
Labbuddy (https://pb-uva.labbuddy.net/node/2149)
SnapGene & Labbuddy
In het werkcollege leren studenten de technieken van het practicum toe te passen op de onderzoeksvraag en deze te plannen. Ze ontwerpen een experiment dat de onderzoeksvraag kan beantwoorden.
In het practicum ontwikkelen de studenten hun onderzoeksvaardigheden onder begeleiding. Hierbij leren de studenten de technieken toe te passen, samen te werken en te communiceren met collega's en het labjournaal bij te houden. In groepsverband wordt er gediscussieerd en worden de resultaten geanalyseerd. De studenten presenteren de werking en toepassing van de moleculaire technieken aan elkaar, zodat de kennis beklijft.
Voorbereiding gedurende de geroosterde zelfstudie uren is essentieel om de tijd op het lab effectief te kunnen gebruiken.
Aan de hand van zelf-ingevulde rubrics ontvangen de studenten halverwege het practicum feedback op de academische houding en het praktisch werk.
|
Activiteit |
Uren |
|
|
Practicum |
35 |
|
|
Werkcollege |
4 |
|
|
Quizzes |
3 |
|
|
Zelfstudie |
42 |
|
|
Totaal |
84 |
(3 EC x 28 uur) |
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Aanwezigheid bij het werkcollege en alle practica is verplicht, omdat het deelnemen aan deze onderdelen essentieel is voor het behalen van de leerdoelen.
Afwezigheid dient gemeld te worden bij de vakcoördinator. In hoge uitzondering en alleen in overleg kunnen eventueel aanpassingen worden gemaakt in de aanwezigheidsplicht. De maximale gemiste hoeveelheid onderwijs (werkcollege en/of practicum) is 8 uur, bij meer absentie kan de student geen cijfer ontvangen voor het praktische werk (en niet aan de leerdoelen voldoen) en dus het practicum niet voltooien. Studenten werken in een team en activiteiten dienen evenwichtig verdeeld te worden over de verschillende teamgenoten - iedereen dient een zichtbare bijdrage te leveren.
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer | |
|
25% Academic attitude | |
|
40% Practical Work | |
|
35% Laboratory notebook | Moet ≥ 5 zijn |
|
Quiz (voldaan/niet voldaan) | Moet ≥ AVV zijn |
Feedback:
De student ontvangt halverwege het practicum een rubric om de eigen academische houding en het praktisch werk te scoren. Deze beoordeling wordt besproken met de assistent en dient als een feedback (en feedforward) moment.
Labjournaal:
De student dient het labjournaal voor de deadline die op Canvas staat in te leveren. Indien het labjournaal niet voor de deadline ingeleverd is, moet de student herkansen. De herkansing van het labjournaal kan maximaal een 6.0 scoren.
Quizzes:
De student kan voor de 3 quizzes in totaal 100 punten scoren en heeft voldaan indien 55 of meer punten behaald zijn. De onderwerpen van de 3 quizzes zijn: DNA, eiwit en mutaties in de hGR. Indien de student niet voldoende punten haalt is er één herkansingsmogelijkheid waarbij de 3 onderwerpen tegelijk herkanst kunnen worden. Studenten kunnen alleen quizzes herkansen waarvoor zij nog geen voldoende hebben gehaald (d.w.z. > 55% score van één quiz). Voor elke quiz geldt: het laatste cijfer telt.
Academische houding en praktisch werk
De onderdelen academische houding en praktisch werk komen tijdens het practicum aan bod en kunnen niet in hetzelfde studiejaar herkanst worden.
Studenten kunnen via mail of aan de practicumbegeleider nadere uitleg vragen over ontvangen beoordelingen.
Moleculaire celbiologie practicum
De beoordeling van het Moleculaire celbiologie practicum zal zoals gebruikelijk gebeuren met een rubric. Je vind de rubrics bij de assignments op Canvas.
Praktisch werk, academische houding, de quizzes en het labjournaal worden individueel beoordeeld.
Cijferverdeling
In dit practicum komen verschillende vaardigheden aan de orde. Elke vaardigheid levert een aantal deelpunten op die samen het eindcijfer zullen vormen (zie rubric).
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
Zie Canvas
Zie de Zichtbare Leerlijnen Creator voor de koppeling van vakleerdoelen, leerlijndoelen en eindtermen.
https://datanose.nl/#program[BSc%20PB]/trajectories
https://datanose.nl/#program[BSc%20PB]/outcomes
- Vernieuwd rooster 2025 (meer zelfstudie) en meer tijd op het lab
- Nieuwe insteek van de quizzes en de inhoud komt iets explicieter aan bod in het practicum
- Labjournaal uit labbuddy verwijdert, alleen eJournal wordt nog gebruikt.
Deze cursus wordt in samenwerking gecoördineerd:
De studenten van de groepen ABC kunnen terecht bij: Richard de Boer: r.deboer@uva.nl
De studenten van de groepen DEF kunnen terecht bij: Vincent Blum: v.a.blum@uva.nl