Moleculaire Technieken en Immunologie BMW/GNK

Molecular Techniques and Immunology

Studiewijzer 2024/2025

Globale inhoud

De technieken die in deze cursus aan bod zullen komen behoren toe aan de vakgebieden immunologie, moleculaire biologie en biochemie. De practica, welke de ruggegraad vormen van deze cursus, zijn onderverdeeld in de volgende samenhangende onderwerpen:

In de eerste twee weken zullen de studenten kennis maken met de een aantal humorale en immunologische technieken, zoals bijvoorbeeld isoleren van antistoffen, immunoassay en immuno-affiniteitschromatografie, isoleren en kweken van lymfocyten en fagocytose assay. Ook zullen er een aantal verschillende immunologische technieken en onderzoeksmethoden theoretisch aan bod komen. De studenten zullen hun eigen immunologische experimenten uitvoeren en de resultaten rapporteren in een labjournaal.

De daaropvolgende twee weken zal de focus liggen op moleculair biologische en biochemische technieken. In dit deel wordt de functie en activiteit van een van de twee voornaamste allergenen van de huisstofmijt Dermatophagoides pteronyssinus bestudeerd. Er zal hierbij ook kennis worden gemaakt met een aantal bio-informatica tools die in deze disciplines veel worden gebruikt. Het practicum volgt een lintstructuur. Dit houdt in dat er aan één lang experiment wordt gewerkt, waarbij elke dag verder wordt gewerkt met het materiaal dat de dag ervoor is verkregen. Technieken die worden gebruikt zijn o.a.:

• BLAST
• (in silico) klonering
• (kolonie)PCR
• gel-elektroforese
• DNA digestie
• ligatie
• transformatie
• sequensen
• eiwitzuivering
• SDS-PAGE
• Western Blot

Studiemateriaal

Literatuur

• Aanbevolen naslagwerken: Molecular Biology of the Cell, 6 th Edition en Janeway’s Immunobiology 10th edition

Syllabus

• Labbuddy immnunologie

• Labbuddy moleculaire technieken

Practicummateriaal

• Labjournaal (verkrijgbaar bij de onderwijsbalie)

• Een laboratoriumjas is verplicht.

Software

• SnapGene

Leerdoelen

• De student kan veel gebruikte immunologische technieken begrijpen.
• De student kan veel gebruikte immunologische technieken uitvoeren.
• De theoretische en praktische achtergronden van de volgende technieken uitleggen: Bereiding van poly- en monoklonale antistoffen, Data-analyse aan de hand van een dose response curve.
• De student is in staat om methodologische problemen op te sporen, op te lossen en onderbouwde experimentele alternatieven aan te dragen
• De student kan de moleculair biologische/biochemische technieken die gebruikt worden voor het kloneren en biochemisch karakteriseren van een recombinant eiwit toepassen
• De student kan de moleculair biologische/biochemische technieken die gebruikt worden voor het kloneren en biochemisch karakteriseren van een recombinant eiwit uitvoeren
• De student kan relevante software en bioinformatica hulpmiddelen gebruiken om DNA/RNA/Eiwit sequenties en immunologische data te analyseren
• De student kan de uitvoering, resultaten en conclusies van de experimenten in het labjournaal bondig en inhoudelijk correct weergeven
• De student kan de conclusies van de behaalde resultaten van de gebruikte immunologische en moleculaire biologische en biochemische technieken onderbouwen
• Een (generiek) protocol toepassen op een specifieke onderzoeksvraag
• De student is in staat om professioneel te communiceren met collegae, medestudenten en docenten
• De student is in staat om deel te nemen aan een wetenschappelijke discussie
• De student is in staat om uit te leggen wat er onder een professionele lab- (academische-)houding wordt verstaan en je hiernaar gedragen
• De student is in staat om de algemene veiligheidsregels (voor mens en milieu) te benoemen en deze correct toe te passen

Onderwijsvormen

• (Computer)practicum
• Zelfstudie
• Werkcollege

Verdeling leeractiviteiten

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

• Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.
  

Aanvullende eisen voor dit vak:

Afwezigheid dient gemeld te worden bij de vakcoördinator. In hoge uitzondering en alleen in overleg kunnen eventueel
aanpassingen worden gemaakt in de aanwezigheidsplicht.

Voor immunologie: c.g.m.kuijk@uva.nl
Voor moleculaire technieken: v.a.blum@uva.nl

OER B - BMW, paragraaf 4.12:

Voor studenten, die de bacheloropleiding volgen geldt in het tweede en derde studiejaar in aanvulling op artikel A-4.6 lid 1 van het OER deel A, dat voor alle deelcijfers van onderdelen een 5.0 of hoger moet worden gehaald.
a.
Aanvullend hierop geldt dat bij de onderwijseenheid Moleculaire Technieken en Immunologie BMW/GNK (5052MTIB6Y), de student voor zowel het onderdeel Moleculaire Technieken als voor het onderdeel Immunologie minimaal een 5.5 moet scoren.

Toetsing

Opdrachten

Labjournaal (immunologie)

• Beschrijving van experimenten immunologie

Labjournaal (moleculaire technieken)

• Beschrijving van experimenten moleculaire technieken

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Aanvullende informatie

De cursus zal worden gegeven op het Science Park. Voor de cursus is een vaccinatie tegen hepatitis B verplicht.
Voor het immunologie deel geldt de volgende aanbevolen voorkennis:

• Janeway’s Immunobiology 10th edition, zie specificaties op Canvas. 

Contactinformatie

Coördinator

• Vincent Blum

De coördinatie van de cursus is verdeeld over het immunologie deel en het moleculaire technieken deel:

Contact?
Voor immunologie: c.g.m.kuijk@uva.nl
Voor moleculaire technieken: v.a.blum@uva.nl