The Cell
6 EC
Semester 1, periode 1
5052CELX6Y
| Eigenaar | Bachelor Biomedische Wetenschappen |
| Coördinator | dr. R.A.F. Gjaltema |
| Onderdeel van | Bachelor Biomedische Wetenschappen, jaar 1 |
| Links | Zichtbare leerlijnen |
In deze cursus zullen de belangrijkste moleculen, structuren en processen in de cel worden behandeld uitgaande van de meest essentiële chemische en biologische principes. Dit betreft de organisatie van genetische informatie, biomoleculen en hun functie, celcyclus en celdood, transcriptie, translatie en energiemanagement van de cel.
Bovendien zal op basis van deze inzichten uitgelegd worden hoe cellen zullen zich kunnen gedragen in de context van andere cellen, organismen en ziekten. Hierbij zal de nadruk liggen op cellulaire communicatie, moleculaire mechanismen van evolutie, celtypen en hun functie, de ontwikkeling van kanker, goede en slechte micro-organismen en het afweersysteem.
Door middel van een practicum wordt in deze cursus geleerd om basale cellulaire/moleculaire laboratoriumhandelingen zelfstandig, veilig en verantwoord uit te voeren.
Perspectief op de BMW (POBW) is projectonderwijs dat door het hele eerste jaar van de studie biomedische wetenschappen loopt. Tijdens de POBW onderwijsdagen zul je aan een uitdagend en relevant biomedisch thema werken waarbij je de kennis uit de cursus moet toepassen en waar nodig ook zelfstandig de kennis nog gaat aanvullen. Alle POBW onderwijsdagen zijn geïntegreerd in bestaande cursussen en je sluit iedere onderwijsdag dan ook af binnen de cursus die op dat moment loopt. De onderwijsdagen zijn ingericht als een projectdag (of projectdagen) waarbij je naast opdoen van kennis ook ervaring opdoet in een verscheidenheid aan competenties. Je zult in aanraking komen met wetenschap maar bijvoorbeeld ook met wetenschapscommunicatie, beleid en het bedrijfsleven.
Essential Cell Biology (6th edition) Alberts, Bruce ISBN 9781324033394
Optioneel: Molecular Biology of the Cell (6th edition) Alberts, Bruce ISBN 9780815344643. Dit boek wordt gebruikt voor meerdere cursussen in de bachelorstudie.
Leerwijzer 'De Cel' (5052CELX6Y). Verkrijgbaar als PDF op Canvas.
Witte laboratoriumjas (verplicht te dragen tijdens het practicum in alle cursussen)
Practicumhandleiding 'De Cel' (5052CELX6Y). Verkrijgbaar als PDF op Canvas. Zelf printen voorafgaand aan practicum!
Goed tekenpotlood (zwart)
Liniaal
Rekenmachine
Labjournaal (hier krijg je nog informatie over)
Laptop
Om dit vak te kunnen volgen is een laboratoriumjas verplicht. Deze kan, indien lid van de studievereniging Congo, tegen een gereduceerd tarief in de webshop besteld worden (http://webshop.medicalwerff.nl/congo/index.php).
In deze cursus wordt gebruik gemaakt van Just-in-Time Teaching (JiTT). Hierbij bereidt de student zich voor op het hoorcollege door thuis zelfstandig de opgegeven stof te lezen en daarna in het werkcollege in kleine groepjes (~4 studenten) aan de opdrachten te werken. Vragen die ontstaan tijdens de voorbereiding kunnen op Canvas worden ingediend en zullen worden behandeld tijdens het JiTT college. De student sluit de voorbereiding af met het maken van een korte kennistoets die bestaat uit een selectie oude tentamenvragen. Tijdens het JiTT college wordt de stof kort in de juiste context geplaatst en worden de opdrachten die gemaakt zijn in de voorbereiding, evenals de ingediende vragen, doorgesproken. De cursus bestaat uit totaal 9 JiTT dagen die ieder een afgebakend onderwerp behandelen (zie onder Weekplanning hieronder).
Naast de JiTT colleges wordt er een zogenaamde highlight college gegeven met als thema baanbrekende technologische ontwikkelingen in de microscopie.
Tijdens het practicum wordt d.m.v. een aantal eenvoudige experimenten de basis gelegd voor het uitvoeren van enkele belangrijke standaard labaratoriumhandelingen. Het registreren van experimenten in een labjournaal wordt aangeleerd. Dit wordt per practicumonderdeel voorzien van feedback.
In de laatste twee weken van de cursus wordt het onderdeel Perspectief op de Biomedische wetenschappen (PoBMW) gegeven in de vorm van twee colleges van 2-4 uur. Deelname is verplicht.
|
Activiteit |
Uren |
|
|
Hoorcollege |
18 |
|
|
Werkcollege |
38 |
|
|
Practicum |
16 |
|
|
Tentamen |
3 |
|
|
Zelfstudie |
93 |
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Bovenstaande aanwezigheidsplicht geldt ook voor alle 'live' aangeboden practica en werkcolleges.
Mocht je wegens persoonlijke omstandigheden (denk hierbij aan ziekte of bijzondere familieomstandigheden) niet kunnen deelnemen aan een verplichte onderwijsbijeenkomst, neem dan direct per e-mail (de-cel-fnwi@uva.nl) contact op met de vakcoördinator. De vakcoördinator bespreekt dan met je of er mogelijkheden zijn om het onderwijs op een andere wijze te volgen, en zo ja welke. Ben je langdurig niet in staat om onderwijs te volgen (langer dan 1 week), neem daarnaast dan ook contact op met de studieadviseur.
De werkcolleges en het practicum zijn verplicht. Er wordt een presentielijst bijgehouden door de docent. Mocht je door overmacht niet in staat zijn om bij één van deze onderdelen aanwezig te zijn, meld dit dan vooraf voor werkcolleges via de-cel-fnwi@uva.nlen voor practica via Practicum-de-cel-fnwi@uva.nl
De consequentie van het missen van een werkcollege of practicumdeel wordt in overleg met de vakcoördinator bepaald.
Herhaaldelijke afwezigheid zonder geldige reden of zonder afmelding kan tot de eindbeoordeling niet aan voldaan (NAV) leiden. Ook bij te laat komen voldoe je niet aan de aanwezigheidsplicht. Bij de beoordeling NAV wordt er geen eindcijfer geregistreerd ook al is voor het tentamen en practicum een voldoende behaald.
De hoorcollege's zijn niet verplicht, maar deelname wordt sterk aangeraden.
Het is essentieel dat je bij de POBW dagen actief meedoet en aanwezigheid is verplicht. Mocht je om specifieke redenen niet kunnen meedoen aan een onderwijsdag dan dien je contact op te nemen met de betreffende cursus coördinator en de POBW coördinator Ricardo Paap (r.h.paap@uva.nl).
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer | |
|
0.9 (90%) Tentamen digitaal | Moet ≥ 5.5 zijn, NAP bij geen cijfer |
|
0.1 (10%) Eindbeoordeling practicum | Moet ≥ 5.5 zijn, NAP bij geen cijfer |
|
PoBW | Moet ≥ AVV zijn |
|
Eindcijfer na herkansing | |
|
0.9 (90%) Hertentamen digitaal | Moet ≥ 5.5 zijn, NAP bij geen cijfer |
|
0.1 (10%) Eindbeoordeling practicum | Moet ≥ 5.5 zijn, NAP bij geen cijfer |
|
PoBW | Moet ≥ AVV zijn |
Het tentamen bestaat uit meerkeuzevragen en wordt afgenomen over de gehele stof die tijdens De Cel aan bod is gekomen, zoals weergegeven in de leerwijzer. Naast een pen zijn er geen verdere toegestane hulpmiddelen.
Deelname aan de practica is verplicht en een vereiste voor het verkrijgen van een cijfer voor de cursus. Het practicum wordt beoordeeld op basis van het labjournaal, praktische vaardigheden en academische werkhouding.
Het tentamencijfer telt voor 90% mee voor je eindcijfer. Het practicumcijfer telt voor 10% mee voor je eindcijfer.
Het vak is gehaald als zowel het tentamencijfer als het practicumcijfer een 5,5 of hoger zijn, en PoBW is afgesloten met 'aan voldaan'. Indien het cijfer voor het practicum lager is dan een 5.5 en/of PoBW is 'niet aan voldaan' (NAP) kan er geen eindcijfer voor het vak worden geregistreerd, ook al heb je wel een voldoende (>5.5) behaald op het tentamen.
Hoewel Perspectief op de Biomedische wetenschappen door het hele eerste jaar loopt zul je de verschillende
onderwijsdagen binnen de lopende cursus afronden.
Aansluitend op het tentamen volgt een plenaire nabespreking (zie rooster) waar de correcte antwoorden worden gegeven en toegelicht.
Na de bekendmaking van de uitslag van het tentamen krijgt de student op verzoek inzage in het beoordeelde werk. Indien je een inzagemoment wilt plannen, stuur dan binnen 10 werkdagen nadat de uitslag bekend is gemaakt een e-mail naar de-cel-fnwi@uva.nl.
Na de aanvraag zal de cursus coördinator je uitnodigen om langs te komen op het Science Park en krijg je één uur de tijd om de tentamenvragen en de door jou gegeven antwoorden in te zien.
JiTT | Opdrachten:
Voorafgaand aan ieder JiTT hoocollege worden in kleine groepen opdrachten gemaakt die op Canvas te vinden zijn. Deze opdrachten zijn bedoeld om met de stof te oefenen en zijn geen afspiegeling van de vragen die op het tentamen zullen worden gesteld. De opdrachten tellen niet mee voor het eindcijfer. Als de student specifieke vragen heeft over de stof dan kunnen deze voorafgaand aan het JiTT hoorcollege op het betreffende Discussion Board op Canvas worden ingediend.
JiTT | Kennistoets:
Voorafgaand aan ieder JiTT hoorcollege wordt door iedere student individueel op Canvas een digitale toets gemaakt (kennistoets). De vragen zijn o.a. geselecteerd uit oude tentamenvragen. Knelpunten bij de vragen worden kort behandeld in het JiTT hoorcollege. Dit telt niet mee voor het eindcijfer.
Practicum | Vragen
Voorafgaand aan en tijdens het practicum worden vragen uit de practicumhandleiding beantwoord. Hoewel de kwaliteit van de antwoorden niet meetelt voor het eindcijfer, weegt de inzet bij het maken ervan wel mee bij de eindbeoordeling van het practicum.
Practicum | Labjournaal:
Voor ieder experiment moet een labjournaal worden bijgehouden. Deze dient na afloop van het practicumonderdeel te worden ingeleverd bij de assistent. Per practicumonderdeel wordt het labjournaal van feedback voorzien door de assistent.
Perspectief op Biomedische Wetenschappen (PoBW)
Bij deze cursus werk je op de PoBW dagen in teamverband aan een graphical abstract over een relevant biomedisch thema.
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
| Weeknummer | Onderwerp | Inhoud |
| 1 |
JiTT 1 | Biomolecules |
DNA, RNA, proteins, fats, lipids, polysaccharides and glycogen |
| 1 |
JiTT 2 | Cell cycle |
Cell cycle order, mitosis, DNA replication, apoptosis, DNA damage and repair |
| 2 |
JiTT 3 | Transcription |
Production, processing, degradation and regulation of RNA |
| 2 |
JiTT 4 | Translation |
Production, degradation and regulation of proteins |
| 3 |
JiTT 5 | Energy management |
Energy carriers, glycolysis, citric acid cycle, oxidative phosphorylation, glycogen and fat |
| 3 |
JiTT 6 | Cell signaling |
General principles, intracellular signaling and extracellular signaling |
| 4 |
JiTT 7 | Evolution |
Mutation, recombination, transposition and meiosis |
| 4 |
JiTT 8 | Tissue organization and Cancer |
multicellular tissue development, tissue turnover, stem cells, cancer development, cancer genetics |
| 5/6 | PoBW |
Perspectief op de Biomedische wetenschappen |
Aanbevolen voorkennis: middelbare school scheikunde en biologie.
Neem uitsluitend contact op via onderstaande mailadressen. E-mails naar andere adressen kunnen helaas NIET worden beantwoord.
Voor algemene vragen, ziekmeldingen en meldingen van te laat komen: de-cel-fnwi@uva.nl