Microbes
4 EC
Semester 1, periode 3
5502MICR4Y
De cursus Microben heeft als doel de student een introductie te geven in de microbiologie. Dit is een zeer breed veld en in de hoorcolleges zal de diversiteit en biologie van zowel bacteriën, gisten, schimmels, protozoa als virussen worden behandeld.
Microben spelen een essentiële rol in de natuur en het leven van de mens. Ze zijn belangrijk voor de nutriëntenkringloop, het opnemen van voedsel, het bewaren en bewerken van ons voedsel, het beschermen tegen ziekteverwekkers en zijn belangrijk in de biotechnologie. Maar ze vormen ook één van de grootste bedreigingen voor onze gezondheid en veroorzaken sterfte op een mondiale schaal. In de hoorcolleges komen al deze aspecten aan bod.
Het praktische deel van de cursus heeft drie doelstellingen. Ten eerste wordt een deel van de behandelde theorie geïllustreerd. Ten tweede maakt men kennis met de praktijk van de Veilige Microbiologische Techniek (VMT), en ten derde wordt aandacht besteed aan het experimenteel ontwerp om een hypothese te toetsen, te interpreteren en in een labjournaal te documenteren.
Bij deze cursus wordt geen gebruik gemaakt van een leerboek. Alle leerstof staat in de PowerPoint presentaties van de hoorcolleges. Deze zullen na de colleges op Canvas geplaatst worden. De presentaties van vorig jaar staan reeds als PDF-files op Canvas en kunnen gebruikt worden als voorbereiding op de colleges.
(Engelstalige) practicumhandleiding
Labjournaal: (prijs ± €9,-, bij Education Service Center)
De PowerPoints van de hoorcolleges zullen op Canvas beschikbaar gemaakt worden.
Hoorcolleges:
In deze cursus wordt het onderwijs gegeven in hoorcolleges. De hoorcolleges (PowerPoint-slides) bepalen de tentamenstof. Er wordt geen gebruik gemaakt van een leerboek en het is daarom belangrijk om de hoorcolleges te volgen. PDFs van de hoorcolleges van vorig jaar zijn op Canvas beschikbaar. Deze kunnen gebruikt worden om een indruk te krijgen van de aankomende hoorcolleges. Let wel, de hoorcolleges zijn onderhevig aan aanpassingen en zullen verschillen met die van het vorige jaar. De PowerPoint-slides van de hoorcolleges worden na afloop op Canvas geplaatst. Er zullen ook opnames van de hoorcolleges gemaakt worden, maar dit loopt niet altijd goed en biedt dus geen garantie. Tenslotte zullen de docenten in hun college een lijst met keywords geven die als leidraad dient voor de tentamenstof.
Practica:
Studenten werken in individueel. De practicumhandleiding is in het Engels en het verslag/labjournaal wordt in het Engels geschreven. Het verslag/labjournaal zal niet worden beoordeeld op de kwaliteit van het Engels.
Computerpracticum:
Ter ondersteuning van de practicumrapportage. Dit is een thuiswerkopdracht met gelegenheid tot vragen stellen via zoom.
|
Activiteit |
Aantal uur |
|
Hoorcollege |
22 |
|
Practicum |
16 |
|
Computer practicum |
4 |
| Cursus |
2 |
|
Tentamen |
3 |
|
Zelfstudie |
65 |
|
Totaal 4 x 28 uur |
112 |
Het deelnemen aan de practica is verplicht en is een vereiste voor het verkrijgen van een cijfer voor de cursus. Tijdens de practica worden de vaardigheden van de student beoordeeld op basis van het labjournaal, praktische vaardigheden en academische werkhouding. Het cijfer voor het practicum telt voor 10% mee met het eindcijfer voor de cursus. Dus het eindcijfer is gebaseerd op 0.9 x theoriecijfer plus 0.1 x practicumcijfer. Tijdens de cursus wordt de theorie na 4 weken schriftelijk getoetst. De toets zal de vorm van vierkeuzevragen hebben.
De student is geslaagd voor de cursus als het eindcijfer 6 of hoger bedraagt. Het cijfer 5.5 wordt afgerond naar een 6.
Voor zowel het practicum onderdeel als het theoretische gedeelte moet een voldoende (5.5 of hoger) gehaald worden om een eindcijfer te krijgen. Een cijfer lager dan 5.5 bij het ene onderdeel kan dus niet gecompenseerd worden door een hoger cijfer bij het andere onderdeel.
Bij het practicum wordt de academische houding getoetst. In de practicumhandleiding vind je de behoordelingscriteria. Bij het schrijven van het labjournaal wordt ook gekeken naar de verwerking van de onderdelen van de empirische cyclus en de formulering van je tekst. In de practicumhandleiding vind je de beoordelingscriteria.
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Aanvullende eisen voor dit vak:
Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):
Deelname aan alle practica, computerpractica, veldwerk en werkcolleges in het curriculum is verplicht.
Eventueel aanvullende eisen worden per onderdeel in de studiewijzer omschreven.
Hier staat ook beschreven wat de eventuele consequenties zijn van het niet nakomen van deze verplichting.
Bovenstaande aanwezigheidsplicht geldt ook voor alle 'live' aangeboden online (computer)practica en werkcolleges.
Mocht je wegens persoonlijke omstandigheden (denk hierbij aan ziekte of bijzondere familieomstandigheden) niet kunt deelnemen aan een verplichte onderwijsbijeenkomst, neem dan direct per e-mail contact op met de vakcoördinator. De vakcoördinator bespreekt dan met je of er mogelijkheden er zijn om het onderwijs op een andere wijze te volgen, en zo ja welke.
Ben je langdurig niet in staat om onderwijs te volgen (langer dan 1 week), neem dan ook contact op met de studieadviseur.
NB Covid-19: Houd je te allen tijde aan de RIVM richtlijnen, ook als dit betekent dat je daardoor één of meerdere verplichte onderwijsbijeenkomsten moet missen. Ook hiervoor geldt, neem direct contact op met de vakcoördinator zodat er samen gekeken kan worden naar een oplossing.
| Onderdeel en weging | Details |
|
Eindcijfer | |
|
1 (100%) Tentamen digitaal |
Tijdens de cursus wordt de theorie na 4 weken schriftelijk getoetst. De toets zal de vorm van vierkeuzevragen hebben.
Toetsmatrijs tentamen:
|
Onderwerpen (college stof) |
Kennis |
Inzicht |
|
Bacteriën, archaea & bacteriofagen |
12 % |
6 % |
|
Microbiële ecologie |
6 % |
3 % |
|
Gisten en schimmels |
6 % |
3 % |
|
Virologie |
12 % |
6 % |
|
Protozoen en parasitologie |
6 % |
3 % |
|
Humane microbioom |
6 % |
3 % |
|
Voedsel & industriële microbiologie/biotechnologie |
6 % |
3 % |
|
Medische microbiologie |
6 % |
3 % |
|
Antibiotica en resistentie |
6 % |
3 % |
|
TOTAAL |
66% |
33 % |
Om een inzagemoment aan te vragen, kun je contact opnemen met de coördinator.
Nauwkeurig uitvoeren van experimenten
Beantwoorden van vragen bij de experimenten
Bijhouden van een labjournaal
Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl
Weekplanning hoorcolleges
Week 1:
Prof. Leendert Hamoen: Introductie bacteriën, archaea & bacteriofagen
Prof. Gerard Muijzer: Introductie microbiële ecologie
Week 2:
Prof. Martijn Rep: Introductie gisten en schimmels
Prof. Hans Zaaijer: Introductie virologie
Dr. Henk Schallig & Dr. Petra Mens: Introductie protozoa en parasitologieDr. Hilde Herrema: Introductie humane microbioom
Week 3:
Dr. Hilde Herrema: Introductie humane microbioom
Prof. Stanley Brul: Introductie voedsel microbiologie en biotechnologie
Dr. Nina van Sorge: Introductie bacteriële infecties
Dr. Bas Zaat: Introductie antibiotica en resistentie
Niet van toepassing.
Verdere informatie staat op Canvas.
Hieronder vind je de aanpassingen in de opzet van het vak naar aanleiding van de vakevaluaties.
Er zal een extra oefententamen worden toegevoegd.
De docenten zullen er voor zorgen dat de keywords actueel zijn.
De docenten zullen hun colleges beginnen met een overzichtsslide van de structuur van het vak zodat het duidelijk wordt in welke context het college gegeven gaat worden.
Prof. Dr. Leendert Hamoen
kamer C3.111
Science Park 904
1098 XH Amsterdam
Netherlands
Tel: 0031-0652370001
Email: l.w.hamoen@uva.nl