Studiewijzer 2023/2024

Globale inhoud

De technieken die in deze cursus aan bod zullen komen behoren toe aan de vakgebieden immunologie, moleculaire biologie en biochemie. De practica, welke de ruggegraad vormen van deze cursus, zijn onderverdeeld in de volgende samenhangende onderwerpen:

In de eerste twee weken zullen de studenten kennis maken met de een aantal humorale en immunologische technieken, zoals bijvoorbeeld isoleren van antistoffen, immunoassay en immuno-affiniteitschromatografie, isoleren en kweken van lymfocyten en fagocytose assay. Ook zullen er een aantal verschillende immunologische technieken en onderzoeksmethoden theoretisch aan bod komen. De studenten zullen hun eigen immunologische experimenten uitvoeren en de resultaten rapporteren in een labjournaal.

De daaropvolgende twee weken zal de focus liggen op moleculair biologische en biochemische technieken. In dit deel wordt de functie en activiteit van een van de twee voornaamste allergenen van de huisstofmijt Dermatophagoides pteronyssinus bestudeerd. Er zal hierbij ook kennis worden gemaakt met een aantal bio-informatica tools die in deze disciplines veel worden gebruikt. Het practicum volgt een lintstructuur. Dit houdt in dat er aan één lang experiment wordt gewerkt, waarbij elke dag verder wordt gewerkt met het materiaal dat de dag ervoor is verkregen. Technieken die worden gebruikt zijn o.a.:

BLAST
(in silico) klonering
(kolonie)PCR
gel-elektroforese
DNA digestie
ligatie
transformatie
sequensen
eiwitzuivering
SDS-PAGE
Western Blot

Studiemateriaal

Literatuur

Aanbevolen naslagwerken: Molecular Biology of the Cell, 6 th Edition en Janeway’s Immunobiology 8th edition of Parham The Immune System 3e of 4e editie

Syllabus

Labbuddy Immunologie
Labbuddy Molecular Techniques Lab

Practicummateriaal

Labjournaal (verkrijgbaar bij de onderwijsbalie)
Een laboratoriumjas en -bril zijn verplicht.

Software

SnapGene

Leerdoelen

De student kan veel gebruikte immunologische technieken begrijpen.
De student kan veel gebruikte immunologische technieken uitvoeren.
De theoretische en praktische achtergronden van de volgende technieken uitleggen: Bereiding van poly- en monoklonale antistoffen, Data-analyse aan de hand van een dose response curve.
De student is in staat om methodologische problemen op te sporen, op te lossen en onderbouwde experimentele alternatieven aan te dragen
De student kan de moleculair biologische/biochemische technieken die gebruikt worden voor het kloneren en biochemisch karakteriseren van een recombinant eiwit toepassen
De student kan de moleculair biologische/biochemische technieken die gebruikt worden voor het kloneren en biochemisch karakteriseren van een recombinant eiwit uitvoeren
De student kan relevante software en bioinformatica hulpmiddelen gebruiken om DNA/RNA/Eiwit sequenties en immunologische data te analyseren
De student kan de uitvoering, resultaten en conclusies van de experimenten in het labjournaal bondig en inhoudelijk correct weergeven
De student kan de conclusies van de behaalde resultaten van de gebruikte immunologische en moleculaire biologische en biochemische technieken onderbouwen
Een (generiek) protocol toepassen op een specifieke onderzoeksvraag
De student is in staat om professioneel te communiceren met collegae, medestudenten en docenten
De student is in staat om deel te nemen aan een wetenschappelijke discussie
De student is in staat om uit te leggen wat er onder een professionele lab- (academische-)houding wordt verstaan en je hiernaar gedragen
De student is in staat om de algemene veiligheidsregels (voor mens en milieu) te benoemen en deze correct toe te passen

Onderwijsvormen

(Computer)practicum
Zelfstudie
Hoorcollege
Werkcollege

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit	Aantal uur
Hoorcollege	30
Practicum	160

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.

Toetsing

Onderdeel en weging	Details
Eindcijfer
40% Deeltoets
20% Academic attitude - Immunology
20% Practical Skills - Immunology
20% Notebook - Immunology
40% Lab journal
45% Practical Work
15% Academical attitude

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

Weeknummer	Onderwerpen	Studiestof
1
2
3
4

Aanvullende informatie

De cursus zal worden gegeven op het Science Park. Voor de cursus is een vaccinatie tegen hepatitis B verplicht.
Voor het immunologie deel geldt de volgende aanbevolen voorkennis:

Janeway’s Immunobiology 8th edition chapter 1, chapter 4 (par 4.10-4.16), chapter 9 (par. 9.1, 9.4, 9.6, 9.11, 9.17, 9.18), chapter 10 (par. 10.1, 10.3, 10.6, 10.7, 10.14), of
Parham The Immune System 3rd edition: Chapter 1, Chapter 2, 2-10 tm 2-11, Chapter 3, 3-1 tm 3-11, Chapter 4, 4-14 tm 4-16, Chapter 5, 5-6 tm 5-16; 5-20, Chapter 7, 7-8, 7-11, Chapter 8, 8-1 tm 8-3, 8-5, 8-9, 8-10, 8-13, Chapter 9, 9-4, 9-8 tm 9-10, of
Parham The Immune System 4th edition: Chapter 1, Chapter 2, 3-1, 3-2 and 3-13, Chapter 4, 4-14 tm 4-17, Chapter 5, 5-6 tm 5-17, 5-21, Chapter 7, 7-8, 7-11, Chapter 8, 8-1 tm 8-3, 8-5, 8-9, 8-10, 8-12, 8-13, 8-14, Chapter 9-3, 9-7 tm 9-10.

Daarbij zullen de opnames van de colleges uit het BMW vak Immunologie theorie en praktijk beschikbaar worden gesteld.

Deze kennis zal voorafgaand aan het practicum getoetst worden en wanneer deze onvoldoende gemaakt wordt is deelname aan het practicumgedeelte niet zinvol.

De voertaal in de cursus zal Engels zijn.

Contactinformatie

Coördinator

Vincent Blum

Eigenaar	Bachelor Biomedische Wetenschappen
Coördinator	Vincent Blum
Onderdeel van	Dubbele bachelor Biomedische Wetenschappen en Geneeskunde, jaar 2
Links	Zichtbare leerlijnen

Moleculaire Technieken en Immunologie BMW/GNK