Basiswiskunde en Statistiek in de BMW

Basic Mathematics and Stastistics in BMS

4 EC

Semester 1, periode 1, 2

5051BSIB4Y

Eigenaar Bachelor Biomedische wetenschappen
Coördinator dr. ir. Michiel van Wijk
Onderdeel van Bachelor Biomedische wetenschappen, jaar 1Dubbele bachelor Biomedische wetenschappen en Geneeskunde, jaar 1

Studiewijzer 2022/2023

Studiemateriaal

Literatuur

  • The Analysis of Biological Data (3rd edition, 2020). Whitlock, M & Schluter, D. Publisher: Freeman, W.H. & Company. ISBN: 9781319325343

Syllabus

  • De Wiskunde syllabus bevindt zich op SOWISO

Practicummateriaal

  • Laptop

Software

  • R, Rstudio, MS excel, zoom en MS teams.

Leerdoelen

  • ruwe empirische data ordenen en zo organiseren dat de data op de juiste wijze weer kan worden gegeven in tabellen en figuren.
  • vaststellen aan de hand van empirisch verkregen data welke statistische methoden het meest geschikt is om de data te analyseren en deze analyse vervolgens uitvoeren.
  • experimenten zorgvuldig ontwerpen en beargumenteren waarom een bepaald experimenteel ontwerp geschikt is om de onderzoeksvraag te beantwoorden en aangeven hoe de verkregen data verwerkt en geanalyseerd zullen worden.
  • data bewerkingen, statistische bewerkingen en grafische representaties van de data uitvoeren in R en Excel.
  • Uitleggen wat statische begrippen als populaties en steekproeven, toetsingsgrootheden, kansverdelingen en beschrijvende statistieken zijn.
  • discrete en voorwaardelijke kansrekeningsvraagstukken oplossen.
  • basale statistische methoden zoals een binomiaaltoets en een chi-kwadraat toets, empirisch verkregen data.
  • bovengenoemde technieken uitvoeren in R.Voort
  • basiswiskunde kennis en vaardigheden toepassen om elementaire vraagstukken wiskundig te modelleren, te simuleren en te analyseren.
  • wiskundige voorstellingen hanteren om problemen in herkenbare contexten en in situaties zoals die later in de studie aan de orde komen te beschrijven en te analyseren.
  • zich fundamentele begrippen en technieken eigen te maken en hanteren uit het gebied dat ook wel bekend staat onder naam Dynamische Systemen of meer specifiek als Systeembiologie.
  • wiskundeteksten op basisniveau lezen en de betekenis van de meeste formules in de literatuur begrijpen.
  • wiskundige berekeningen en antwoorden op vragen correct formuleren en op te schrijven.
  • differentiëren en afgeleide functies opstellen en deze technieken toepassen voor extrema en stabiliteitsonderzoek van oplossingen van differentiaalvergelijkingen.
  • nulde- en eerste-orde differentiaalvergelijkingen opstellen om continue dynamische processen te beschrijven, zoals processen van groei, reactiekinetiek en farmacokinetiek.
  • onderzoek naar stabiliteit en asymptotiek bij autonome eerste-orde differentiaalvergelijkingen uitvoeren.
  • basistechnieken in de bestudering van dynamische systemen in twee veranderlijken toepassen.
  • dynamische systemen in de context van regulatie van genexpressie opstellen en analyseren.

Onderwijsvormen

  • Hoorcollege
  • Laptopcollege
  • Zelfstudie

Verdeling leeractiviteiten

Activiteit

Uren

Digitale Deeltoets

3

Hoorcollege

24

Laptopcollege

50

Vragenuur

4

Zelfstudie

31

Totaal

112

(4 EC x 28 uur)

Aanwezigheid

Aanwezigheidseisen opleiding (OER-B):

  • Deelname aan alle practica, computerpractica en werkcolleges in het curriculum is verplicht.

Aanvullende eisen voor dit vak:

Aanwezigheid bij de werkcolleges is verplicht.

  • Afwezigheid dient gemeld te worden op canvas.

Toetsing

Onderdeel en weging Details

Eindcijfer

1 (100%)

Tentamen digitaal 1

In het kader van de COVID-19 maatregelen is het tentamen een openboektentamen dat thuis wordt afgenomen onder oom surveillance. Het tentamen is volledig geparametriseerd, d.w.z. iedere student een uniek tentamen krijgt. 

 

Het tentamen bestaat uit de volgende twee deeltoetsen:

  • Statistiek (2 EC)
  • Wiskunde (2 EC)

Wanneer zowel de statistiek als de wiskunde deeltoets met een voldoende is afgesloten wordt het eindcijfer voor het vak berekend als het gemiddelde cijfer voor deze twee deeltoetsen. 

Wanneer een deeltoets niet met een voldoende is afgesloten dan kan de student deze deeltoets tijdens het hertentemenmoment herkansen. Deeltoets cijfers blijven ook het volgende collegejaar nog geldig. U kunt deeltoetsen dus onafhankelijk van elkaar herkansen tot u voor beide deeltoetsen een voldoende heeft behaald en er een eindcijfer voor het vak kan worden toegekend.

Inzage toetsing

Nadat een deeltoets is nagekeken zal de toets digitaal ter inzage worden aangeboden. Het moment waarop de student het tentamen kan inzien zal via een CANVAS announcement worden bekendgemaakt. 

Fraude en plagiaat

Dit vak hanteert de algemene 'Fraude- en plagiaatregeling' van de UvA. Hier wordt nauwkeurig op gecontroleerd. Bij verdenking van fraude of plagiaat wordt de examencommissie van de opleiding ingeschakeld. Zie de Fraude- en plagiaatregeling van de UvA: http://student.uva.nl

Weekplanning

WeeknummerOnderwerpenStudiestof
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16

Rooster

Het rooster van dit vak is in te zien op DataNose.

Aanvullende informatie

Recidivisten van studiejaar 2020-2021:

Deelcijfers behaald in studiejaar 2020-2021 zijn ook dit jaar nog geldig. U hoeft dus alleen de onderdelen die nog niet met een voldoende zijn afgesloten te herkansen. 

 

 

Overgangsregeling recidivisten afkomstig uit studiejaren voor  2020-2021 :

Wanneer u voor het studiejaar 2020-2021 Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 1 & 2 heeft gevolgd en voor een van deze vakken nog niet bent geslaagd geldt de volgende overgangsregeling: 

Reeds behaalde deelcijfers blijven geldig. De onderdelen kunnen apart worden herkanst.

De overgangsregeling per onderdeel is:  

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 1 onderdeel wiskunde: De eerste helft van de deeltoets 2 van het vak "Basiswiskunde en Statistiek in de BMW" (1 EC)

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 2 onderdeel wiskunde: De tweede helft van de deeltoets 2 van het vak "Basiswiskunde en Statistiek in de BMW" (1 EC)

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 1 onderdeel Statistiek: deeltoets 1 het vak "Basiswiskunde en Statistiek in de BMW" (2 EC) + deeltoets 1 van het vak "Voortgezette Statistiek in de BMW" (1 EC)

Basis Statistiek en Wiskunde in de Biomedische Wetenschappen 2 onderdeel Statistiek:  deeltoets 2 van het vak "Voortgezette Statistiek in de BMW" (3 EC)

 

 

Verwerking feedback studenten

Naar aanleiding van vak evaluaties is er dit jaar een extra werkcollege toegevoegd aan de cursus. Studenten gaven aan dat zij meer tijd nodig hadden om te wennen aan het werken met R. Dit extra, eerste werkcollege, zal volledig worden besteed aan het installeren en kennismaken met R en Rstudio. 

Contactinformatie

Coördinator

  • dr. ir. Michiel van Wijk
  • dr. ir M. van Wijk
  • mail: m.vanwijk@uva.nl

Docenten

  • dr. A.J.P. Heck
  • dr. ir. M. van Wijk
  • T. Meijer
  • M.F.L. Schut

Practicum docenten

  • B. van Pinxteren
  • J. Agenant
  • L. Beers
  • M. Snik
  • J. van Duijn
  • J. van der Hijden
  • L.S. Koops
  • E. Nieuwenhuis
  • E. Samuel
  • S.A.W. Smit